Título
RESPUESTA TRANSCRIPTÓMICA DEL CORAL Porites panamensis EN LAS CERCANÍAS DE UN CAMPO HIDROTERMAL, EN EL GOLFO DE CALIFORNIA
Autor
ERICK XAVIER TREVIÑO BALANDRA
Colaborador
Eduardo Francisco Balart Páez (Director)
Michael Hellberg (Director)
Nivel de Acceso
Acceso Abierto
Materias
Resumen o descripción
"Los corales son organismos de vida sésil conocidos por conformar arrecifes, considerados como los ecosistemas más productivos del planeta. Gracias a la relación simbiótica con dinoflagelados de la familia Symbiodiniaceae que mantienen a lo largo de su ciclo de vida, algunas especies, como Porites panamensis, son capaces de colonizar ambientes limitantes para el desarrollo, desde sitios donde la disponibilidad de recursos es nula hasta ambientes extremos como lo son manantiales y ventilas hidrotermales. Dado que las condiciones imperantes en estos sistemas son similares a los escenarios de variabilidad y cambio climático pronosticados (IPPC-NOAA-NASA), resulta relevante determinar los mecanismos genéticos responsables de la supervivencia coralina. En el presente estudio se documentan dichos mecanismos en el coral Porites panamensis en las cercanías de un campo hidrotermal en el Golfo de California. Se determinó: I) la variabilidad en las condiciones fisicoquímicas circundantes a las comunidades de P. panamensis en el campo hidrotermal; II) la identidad genética del holobionte (P. panamensis y Cladocopium sp) en el campo hidrotermal; y III) la respuesta transcriptómica en función de la temporada y el aporte hidrotermal. Se recolectaron muestras de agua (n=8) y tejido (n=40) en Bahía Concepción en dos localidades: Punta Bárbara (sitio con afluencia hidrotermal) y el Requesón (condición control) en verano (Ago-2017) e invierno (Ene-2018). Análisis químico-proximales fueron realizados a las muestras de agua para determinar salinidad (UPS), pH (H+), Acidez (CO32- mg/L), alcalinidad (CaCO3 mg/L), concentración de nitritos (NO2 μM) y sulfatos (SO4 mg/L). La transición temporal se caracterizó por cambios de temperatura (8.9 ± 0.5° C) y disponibilidad de nitritos (0.6 ± 0.05 NO2 μM). La influencia del aporte hidrotermal resultó en 3 condiciones semejantes a los pronósticos de cambio climático: Low (condiciones actuales), Mid (condiciones en 2050) y High (condiciones en 2100); caracterizados por presentar mayor temperatura, acidez, salinidad y disponibilidad de nitrógeno en la columna de agua. Se realizaron amplificaciones por PCR de las regiones ND1 del hospedero (P. panamensis mtDNA) y PsbA del simbionte (Cladocopium sp - chlDNA). Estimaciones por Máxima Verosimilitud determinaron la presencia de 2 linajes de P. panamensis (n=24, 5 haplotipos) y 1 de Cladocopium Clado C (n=10)..."
"Corals are sessile life organisms known for shaping reefs, considered the most productive ecosystems on the planet. Thanks to the symbiotic relationship with dinoflagellates of the Symbiodiniaceae family throughout their life cycle, some species, such as Porites panamensis, are able to colonize limiting environments for development, from sites where the availability of resources is nil to environments extremes such as springs and hydrothermal vents. Since the prevailing conditions in these systems are like the predicted scenarios of climate change and variability (IPPC-NOAA-NASA), it is relevant to determine the genetic mechanisms responsible for coral survival. In this study, these mechanisms are documented in the Porites panamensis populations close to hydrothermal activity in the Gulf of California. We determined: I) the variability in the physicochemical conditions surrounding the P. panamensis communities in the hydrothermal field; II) Genetic identity of the holobiont (P. panamensis and Cladocopium sp) in the hydrothermal field; III) Transcriptomic response related to seasonal transition and the hydrothermal activity. Samples of water (n = 8) and tissue (n = 40) were collected in Bahía Concepción in two locations: Punta Bárbara (site with hydrothermal inflow) and El Requesón (control condition) in summer (Aug-2017) and winter (Jan -2018). Proximal analyses were performed on water samples to determine salinity (UPS), pH (H+), Acidity (CaCO3 mg/L), alkalinity (CaCO3 mg/L), nitrite (NO2 μM) and sulphates (SO4 mg/L) concentrations. The temporal transition was characterized by changes in temperature (8.9 ± 0.5 ° C) and nitrite availability (0.6 ± 0.05 NO2 μM). The influence of the hydrothermal contribution resulted in 3 conditions like climate change forecasts: Low (current conditions), Mid (conditions in 2050) and High (conditions in 2100); characterized by higher temperature, acidity, salinity and nitrogen availability in the water column. PCR amplicons of the host ND1 (P. panamensis mtDNA) and symbiont PsbA (Cladocopium sp-chlDNA) were performed. Estimates byMaximum Likelihood determined the presence of 2 lineages of P. panamensis (n = 24, 5 haplotypes) and 1 of Cladocopium Clade C (n = 10). The sequencing products (7.2x109 readings) were assembled into a DeNovo metatranscriptome with an extension of 1.68x105 transcripts..."
Editor
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste, S.C.
Fecha de publicación
2020
Tipo de publicación
Tesis de maestría
Versión de la publicación
Versión publicada
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Formato
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Idioma
Español
Repositorio Orígen
Repositorio Institucional CIBNOR
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