Título
Evaluación del nivel y distribución de la diversidad genética de Sphyrna zygaena en el Pacífico norte mexicano
Assessment level and distribution of the genetic diversity of Sphyrna zygaena from the northern Mexican Pacific
Autor
DANIELA GUADALUPE FELIX LOPEZ
Colaborador
Axayácatl Rocha-Olivares (Asesor de tesis)
NANCY CLAUDIA SAAVEDRA SOTELO (Asesor de tesis)
Nivel de Acceso
Acceso Abierto
Materias
SNPs; panmixia; tamaño efectivo poblacional; tiburón martillo; cornuda prieta - (AUTOR) SNPs; panmixia; effective population size; smooth hammerhead shark - (AUTOR) BIOLOGÍA Y QUÍMICA - (CTI) CIENCIAS DE LA VIDA - (CTI) GENÉTICA - (CTI) GENÉTICA DE POBLACIONES - (CTI) GENÉTICA DE POBLACIONES - (CTI)
Resumen o descripción
La diversidad genética de una población es la base evolutiva para su permanencia frente a cambios ambientales, por lo que evaluar y entender este atributo nos puede dar información indirecta acerca de los patrones demográficos de la población y los procesos microevolutivos que controlan dicha variación genética. Sphyrna zygaena es una especie de tiburón martillo altamente migratoria incluida en el Apéndice II de la CITES y catalogada como Vulnerable por la IUCN. Además, análisis de riesgo ecológico la han categorizado como una especie vulnerable en el Golfo de California (GC) y Pacífico mexicano, debido a su abundante captura durante las últimas décadas y a sus características biológicas (estrategia de vida tipo K). El objetivo del presente trabajo fue evaluar la estructura y los patrones de diversidad genética de S. zygaena en el Pacífico norte mexicano (PNM). Para ello se analizaron 1,480 SNPs en 92 individuos de 4 regiones del PNM, de los cuales 1,456 fueron puramente neutrales (SNP-n) y 24 bajo posible selección (SNP-o). Los niveles de diversidad genética no mostraron un patrón espacial y fueron similares entre las cuatro regiones del PNM (HO= 0.275). El tamaño efectivo poblacional (Ne) se estimó de Ne=1,391, cuyo valor se encuentra por encima del óptimo teórico considerado para que la población se mantenga ante cambios en el tiempo. Los análisis de estructura genética con SNP-n determinaron que no existe estructura genética poblacional (FST=0.0012, p=0.44), dicha panmixia es asociada a la alta capacidad de dispersión de S. zygaena. Por otro lado, los SNP-o mostraron un patrón de diferenciación genética entre organismos del GC con respecto a los de la costa oeste de la Península de Baja California, la cual podría ser promovida por presión selectiva diferencial entre estas dos regiones. Sin embargo, no se relacionó la función de los loci outliers con variables ambientales entre regiones. Por lo tanto, es importante explorar la ontología de los genes que están asociados a estas presiones selectivas.
Genetic diversity is the evolutionary basis for the permanence of populations, allowing them to cope environmental changes. Hence, evaluating and understanding this attribute can give us indirect information about the demographic patterns of micro-evolutive processes that control it. Sphyrna zygaena is a highly migratory species of hammerhead shark, which was included in Appendix II of CITES and listed as Vulnerable by the IUCN. It has been categorized as vulnerable by ecological risk assessments in the Gulf of California (GC) and Mexican Pacific, due to the abundance of catches during the last decade and its biological characteristics (K-selected life history). The objective of this study was to assess the patterns of genetic diversity and structure of S. zygaena in the Northern Mexican Pacific (NMP). I analyzed 1,480 SNPs in 92 individuals from 4 regions in the NMP, of which 1,456 were neutral loci (SNP-n) and 24 putatively under selection (SNP-o). Genetic diversity was geographically homogeneous and similar among regions of the NMP (HO = 0.275). The estimated effective population size (Ne) was Ne=1,391; this value is theoretically optimal for population permanence through time. There was no pattern of genetic structure using SNP-n (FST = 0.0012, p = 0.44); such panmixia may be associated to the high dispersal capacity of S. zygaena. A pattern of adaptive variation was reveled using SNP-o, where individuals from the GC were different from those of the west coast of the Baja California Peninsula. Such differentiation could be promoted by differential selective pressures between these two regions. However, I did no correlate the function of outlier loci with differences in environmental variables between regions. Therefore, it is important to explore the ontology of the genes that are associated with these selective pressures.
Editor
CICESE
Fecha de publicación
2019
Tipo de publicación
Tesis de maestría
Recurso de información
Formato
application/pdf
Idioma
Español
Sugerencia de citación
Félix López, D.G. 2019. Evaluación del nivel y distribución de la diversidad genética de Sphyrna zygaena en el Pacífico norte mexicano. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 44 pp.
Repositorio Orígen
Repositorio Institucional CICESE
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