Título

Análisis de la interacción entre las proteínas ABF1 y RAP1 de Candida glabrata con los elementos de regulación en CIS del telómero E derecho

Autor

LEONARDO CASTANEDO IBARRA

Colaborador

IRENE BEATRIZ CASTAÑO NAVARRO (Director)

Nivel de Acceso

Acceso Abierto

Resumen o descripción

"La regulación de la expresión génica está gobernada por la unión de los factores de transcripción a los elementos de regulación en cis del genoma eucariota. En el patógeno Candida glabrata, un ejemplo de este tipo de regulación se encuentra representado por la familia de genes EPA (adhesina epitelial, por su siglas en inglés), que codifican para proteínas de la pared celular, las cuales, median la adhesión de la levadura a las células epiteliales del hospedero. En la cepa BG2, EPA1 es el único gen de la familia EPA que se expresa in vitro, mientras los 22 parálogos EPA permanecen transcripcionalmente reprimidos o silenciados. EPA1 está codificado en la región subtelomérica del cromosoma E izquierdo (tE-R), adyacente a EPA2 y EPA3. Las regiones subteloméricas de C. glabrata presentan un silenciamiento regional, no obstante, el tE-R manifiesta una combinación de silenciamiento regional y local sobre los genes EPA localizados allí. Este efecto podría deberse a la formación de bucles teloméricos (T-loop) al extremo del cromosoma, posiblemente mediado por las proteínas de unión al ADN, Abf1 y Rap1, mediante el reclutamiento de las proteínas Sir, las cuales son necesarias para el silenciamiento subtelomérico en C. glabrata. Para estudiar la función de éstas proteínas en el silenciamiento subtelomérico de C. glabrata, las etiquetamos con los epítopos c-Myc y FLAG y encontramos que las etiquetas pueden interferir con la función nativa de las proteínas. Adicionalmente, determinamos que Abf1 y Rap1 participan en la regulación de la expresión de los genes EPA de los telómeros E-R e I-R, posiblemente a través de la formación de T-loops."

"Regulation of gene expression in eukaryotes is governed by the binding of transcription factors to cis-acting elements in the genome. In the pathogenic yeast, Candida glabrata, an example of this regulation is the EPA (Epithelial Adhesin) gene family, which encodes cell surface proteins that mediate adhesion of the yeast to epithelial host cells. In the strain BG2, EPA1 is the only gene of this family that is expressed in vitro, whereas the remaining 22 EPA paralogues are transcriptionally repressed. EPA1 forms a cluster with EPA2 and EPA3 close to the right telomere of the Chromosome E (E-Rt). Contrary to the widespread silencing effect over the subtelomeric regions observed in other C. glabrata telomeres, the E-Rt exhibits a combination of regional and local silencing of the EPA genes. This effect could be due to repression at a distance, by telomere looping (T-loop), where the DNA-binding proteins Abf1 and Rap1 participate through the recruitment of the Sir proteins, which are completely necessary for the silencing at subtelomeric regions in C. glabrata. We tagged the Abf1 and Rap1 proteins with c- Myc and FLAG epitopes to study their function at Candida glabrata subtelomeric regions. We found that the tags can interfere with the normal silencing activity of the proteins and in the process, we determined that Abf1 and Rap1 participate in the regulation of the expression of EPA genes at the E-R and I-R telomeres, possibly through telomere loop formation."

Fecha de publicación

agosto de 2015

Tipo de publicación

Tesis de maestría

Formato

application/pdf

Idioma

Español

Audiencia

Público en general

Repositorio Orígen

Repositorio IPICYT

Descargas

312

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