Author: ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO

Expresión de receptores notch y detección de virus de papiloma humano en cáncer cervicouterino

ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO (2005)

"El desarrollo de cáncer es el resultado de la acumulación progresiva de alteraciones moleculares específicas, particularmente en eventos que dirigen la determinación del destino celular. La vía de señalización Notch juega un papel fundamental en las diferentes etapas de desarrollo celular como proliferación, diferenciación y apoptosis. Estudios recientes han demostrado que dependiendo del nivel de expresión y del contexto celular, los receptores de membrana Notch contribuyen a la tumorogénesis. En este trabajo se investigó el patrón de expresión de los receptores Notch-1 al -4 en cáncer cervicouterino. Se detectó una expresión aumentada de receptores Notch-2 y -3 y una expresión baja pero consistente de Notch-4 en lesiones de pacientes en etapas avanzadas con cáncer cervicouterino. Además se comprobó la presencia de virus de papiloma humano en todos los casos estudiados. Los resultados obtenidos revelan de manera inesperada una expresión diferente a la reportada, ya que el receptor Notch-1 se sobreexpresa y proporciona los efectos para transducir una señal de supervivencia en estas células tumorales."

"The development of cancer is the result of a progressive accumulation of specific molecular alterations, mainly those driving cell fate determinations. The Notch signaling pathway plays a crucial role at different stages of cell development such as proliferation, differentiation, and programmed cell death. Recent studies have demonstrated that depending on the expression level and cellular context, the Notch receptors contribute to tumorigenesis. This work describes the expression pattern of the membrane receptors Notch-1 to –4 in cervical cancer. We detected an up-regulated expression of Notch-2 and Notch-3 and a low but steady expression of Notch-4 in lesions of patients with advanced stages of cervical cancer. The presence of the Human Papilloma virus was confirmed in all cases studied. Unexpectedly, the results obtained reveal anatypical expression pattern when compared to the data reported up to now, in which Notch-1 is frequently overexpressed and confers the primary effects to transduce a survival signal in this specific type of tumoral cells."

Master thesis

Cáncer cervicouterino Señalización Notch BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA MOLECULAR

Expresión heteróloga de la ATPasa TAA43 y la alcohol deshidrogenasa Ta1316 procedentes de Thermoplasma acidophilum

ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO (2009)

"El reino Archaea constituye uno de los tres dominios en los que se clasifican los seres vivos. Son microorganismos unicelulares carentes de núcleo y organelos. Fueron descubiertas hace 40 años en ambientes con condiciones extremas y desde entonces se les ha encontrado en todo tipo de hábitats. Debido a que varias especies de arqueas son microorganismos extremófilos poseen propiedades inusuales, lo que los convierte en una valiosa fuente de moléculas útiles en procesos biotecnológicos. Además el patrimonio genético de las arqueas es único ya que poseen genes ortólogos en bacterias y eucariontes, aunado a esto su información genética esta contenida dentro de un solo cromosoma circular pequeño (0.49x106 – 5x106 pares de bases). Todas estas características hacen a las moléculas de los microorganismos del reino Archaea modelos de estudio contra organismos más complejos, además de contribuir (biomasa y biocatalizadores) en el mejoramiento y desarrollo de procesos biotecnológicos. Thermoplasma acidophilum es un microorganismo termo-acidofílico del que actualmente se cuenta con su información genética derivada de la secuenciación de su genoma. En este trabajo se realizó la expresión heteróloga de proteínas provenientes de Thermoplasma acidophilum: 1) la ATPasa TAA43 de la familia de proteínas AAA y 2) las proteínas Ta0841 y Ta1316 ADH que presentan identidad con alcohol deshidrogenasas descritas en las bases de datos existentes. En el caso de la proteína recombinante TAA43 se logró la obtención de condiciones idóneas de cristalización para la elucidación de su estructura tridimensional. Por último, se llevó a cabo la caracterización bioquímica de la alcohol deshidrogenasa Ta1316 ADH, la cual por sus características de termoresistencia se propone como un candidato en los procesos de biocatálisis enzimática."

"The AAA proteins (ATPases Associated with various cellular Activities) are enzymes found in all kingdoms of life (Archaea, Bacteria and Eukarya) and they are involved in important cellular functions such as proteolysis and unfolding/folding events to mantain homeostasis. The ORF (Open Reading Frame) Taa43 from Thermoplasma acidophilum genome encodes a 43 kDa protein (TAA43) and contains one AAA domain. TAA43 is classified as a member of the AAA protein family. It remains to be clarified the real function of this protein and the three-dimensional structure would help to clarify its contribution in cellular processes. In this work, the AAA TAA43 protein was expressed in Escherichia coli in an amount of 25 mg/l, a purity of 98% and ATPase activity, with the ultimate purpose of carrying on crystalization assays. We were able to identify growth of crystals conditions for TAA43 and the composition confirmed these preliminary results by X-ray diffraction."

Doctoral thesis

BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA MOLECULAR

Inocuidad en Granos

OFELIA YADIRA LUGO MELCHOR ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO (2017)

La creciente demanda de alimentos ha requerido una mayor eficiencia en la producción de granos básicos pues se trata de los productos principales en la dieta alimentaria del país. Los granos se consideran inocuos si no ocasionan daño a las personas y a los animales que los consumen. Actualmente, el mundo demanda granos inocuos por lo tanto las regulaciones nacionales e internacionales de los países compradores impactan en la cadena logística y de comercialización de los países productores con el objetivo de satisfacer las crecientes demandas impuestas por los consumidores globales. En el presente capitulo se mencionan cuáles son las principales causas de contaminación que normalmente resultan con pérdidas de inocuidad de los granos como es la presencia de micotoxinas, residuos de plaguicidas, microorganismos de control de calidad y patógenos y los organismos genéticamente modificados.

Book part

Inocuidad; granos INGENIERÍA Y TECNOLOGÍA CIENCIAS TECNOLÓGICAS TECNOLOGÍA DE LOS ALIMENTOS HIGIENE DE LOS ALIMENTOS HIGIENE DE LOS ALIMENTOS

Tequila vinasses acidogenesis in a UASB reactor with Clostridium predominance

GUSTAVO DAVILA VAZQUEZ ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO ROBERTO EMMANUEL BOLAÑOS ROSALES SILVIA MARIBEL CONTRERAS RAMOS (2015)

Tequila vinasses represent an acidic, highly concentrated pollutant effluent generated during the distillation step of

Tequila production. Although acidogenesis of Tequila vinasses has been reported for some reactor configurations,

a characterization of the bacteria present during this metabolic process is lacking in the literature. Hydraulic retention

times (HRT) between 36 and 6 h and organic loading rates (OLR) from 5 to 30 g COD L−1 d−1 were assessed in

a UASB reactor fed with Tequila vinasses. Results showed that OLR excerted a stronger effect (p ≤ 0.0001) on parameters

such as gas production rate, pH, and acidity than HRT. While it was clear that shorter HRT were related to higher

volatile fatty acid production levels. Figures above 2 Lgas L−1

reactor d−1 (where “gas” could be a mixture of methane and

hydrogen) were attained only with an OLR as high as 30 g COD L−1 d−1. Bacterial identification of a sludge sample at

the end of the experiment revealed that acid-tolerant microorganisms that remained in the reactor were exclusively

affiliated to the Clostridium genera, being the first report of organisms identification for Tequila vinasses acidogenesis.

These findings are relevant to the field of biotechnology since acidogenesis of Tequila vinasses using identified and

studied microorganism abilities (i.e. Clostridium strains) presents the opportunity of optimizing processes intended for

different metabolites production (butanol, volatile fatty acids, hydrogen, solvents).

Article

Stillage, Volatile fatty acid, Biohydrogen, DGGE, Agave INGENIERÍA Y TECNOLOGÍA

Vacunas en estudios clínicos para combatir la tuberculosis

YESSICA YADIRA LLAMAS GONZALEZ ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO MARIO ALBERTO FLORES VALDEZ (2016)

"La Tuberculosis (TB) es un problema de salud mundial, y es la principal causa de muerte entre millones de personas cada año, en comorbilidad con el virus de inmunodeficiencia humana (VIH). En este trabajo se abordan los avances que existen en la actualidad con respecto al desarrollo de vacunas contra la tuberculosis, enfocándonos a aquellos ya en fases de investigación clínica. Sabemos hoy en día que la TB es una de las enfermedades más difíciles de controlar por lo que se continúa con la búsqueda para desarrollar una vacuna universal que sea protectora contra la enfermedad. Hasta el momento, existen casi 20 candidatos a vacuna en las diferentes etapas de ensayos preclínicos y clínicos, fruto de más de 3 décadas de investigación. El objetivo de estas pruebas clínicas es identificar una vacuna contra la tuberculosis que sea segura, más efi caz que la BCG, que sea ampliamente aplicable e intentar conseguir el control de la enfermedad. En la actualidad, el campo de estudio se ha centrado en la selección de antígenos que induzcan una mejor activación de la respuesta inmune y así estimular células que sean capaces de producir citocinas pro-infl amatorias, asimismo la manipulación de los componentes de la mucosa de pulmón pueden jugar un papel importante en la respuesta inmune protectora a la infección por Mycobacterium tuberculosis. Dentro de las perspectivas recientes existe la necesidad urgente de una vacuna altamente eficaz contra la TB pulmonar".

Article

BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA INMUNOLOGÍA VACUNAS

Efecto de un consorcio de rizobacterias sobre el rendimiento de pepino

ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO FLOR YOHANA FLORES HERNANDEZ ROBERTO EMMANUEL BOLAÑOS ROSALES GUSTAVO DAVILA VAZQUEZ SILVIA MARIBEL CONTRERAS RAMOS (2016)

"El consumo elevado de fertilizantes y las legislaciones cada vez más exigentes para productos agrícolas, propician la búsqueda de alternativas de insumos para la agricultura. La producción de inóculos bacterianos es una opción para hacer la agricultura más sustentable. El objetivo de este trabajo fue evaluar el efecto de un consorcio (PTA-122530) de rizobacterias en el rendimiento de un cultivo de pepino europeo (Cucumis sativas L.). Se utilizaron plantas de 60 días de trasplante con dos experimentaciones: 1) Se adicionaron a 25 plantas (3mL/planta) del consorcio con una densidad celular viable de 1.3 x 1013 UFC/mL, se compararon contra 25 plantas al azar sin adición del consorcio (Testigo); 2) Se inocularon 25 plantas (5mL/planta) con el consorcio (1.9 x 1013 UFC/mL) en las mismas condiciones descritas, comparadas contra un testigo absoluto y contra plantas adicionadas con el mismo consorcio comercial (6 x 105 UFC/mL) en la misma dosis (5mL/planta). En el primer experimento las plantas inoculadas con el consorcio presentaron aumentos significativo en el rendimiento de producción de 26% (215 kg) más que las plantas control (171 kg). En el segundo experimento se encontró que las plantas inoculadas con el consorcio de rizobacterias tuvieron un aumento significativo en el rendimiento del 59% (22 kg) con respecto al control (13.8 kg) mientras que el inóculo comercial tuvo un incremento del 20% (16.5 kg) contra el control. Con los dos experimentos se concluyó que el consorcio PTA-122530 de rizobacterias tuvo un efecto positivo en el rendimiento de pepino en condiciones de agricultura protegida, concluyendo que el uso de estos insumos podría ayudar a incrementar la productividad en este sector. "

Article

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Identification and quantification of volatile compounds found in vinasses from two different processes of Tequila production

ELIZABETH RODRIGUEZ FELIX SILVIA MARIBEL CONTRERAS RAMOS GUSTAVO DAVILA VAZQUEZ Jacobo Rodríguez Campos ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO (2018)

"Vinasses are the main byproducts of ethanol distillation and distilled beverages worldwide and are generated in substantial volumes. Tequila vinasses (TVs) could be used as a feedstock for biohydrogen production through a dark fermentative (DF) process due to their high content of organic matter. However, TV components have not been previously assayed in order to evaluate if they may dark ferment. This work aimed to identify and quantify volatile compounds (VC) in TV and determine if the VC profile depends upon the type of production process (whether the stems were initially cooked or not). TVs were sampled from 3 agave stems with a not-cooking (NC) process, and 3 agave stems with a cooking (C) process, and volatile compounds were determined by gas chromatography coupled with mass spectrometry (GC–MS). A total of 111 volatile compounds were identified, the TV from the cooking process (C) showed the higher presence of furanic compounds (furfural and 5-(hydroxymethyl) furfural) and organic acids (acetic acid and butyric acid), which have been reported as potential inhibitors for DF. To our knowledge, this is the first description of the VC composition from TVs. This study could serve as a base for further investigations related to vinasses from diverse sources"

Article

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

HLA-C genotype and TCR vβ expression analysis in Mexican patients with Psoriasis

MARTHA LETICIA SANTOS MARTINEZ MA. FABIOLA LEON GALVAN ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO ANTONIO DE LEON RODRIGUEZ ANA PAULINA BARBA DE LA ROSA BENJAMIN MONCADA GONZALEZ (2011)

"Genetic background and T-cell expansion have been associated as the most important factors for psoriasis susceptibility in the Caucasian population. This study was performed to identify the T cell receptor Vβ repertoire and HLA-Cw genotype in two Mexican groups with severe chronic plaque-type psoriasis. HLA-C typing was performed to detect the allele pattern associated with the disease by sequence-specific primer-polymerase chain reaction. In parallel, RT-PCR and Western blot were used for the identification of the TCR Vβ repertoire. We found a wide variety of HLA-C alleles displayed with a preference to HLA-Cw *07 as the most representative allele in the group of patients. TCR Vβ-2 and Vβ-7 clone-type frequencies were statistically significant (p of 0.0280) when compared to other TCR Vβ expressed in the two groups. We found notable differences both in the HLA-C genotype and TCR Vβ repertoire in the groups of patients studied. Since Mexican individuals are genetically different from the Caucasian population, we suggest that due to these differences the susceptibility to disease and activation of T-cells for a proper immune response may be affected."

Article

Psoriasis TCR vβ HLA-Cw Mexican patients BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA MOLECULAR

Utilization of vinasses as soil amendment: consequences and perspectives

RENE GUADALUPE MORAN SALAZAR ANA LORENA SANCHEZ LIZARRAGA JACOBO RODRIGUEZ CAMPOS GUSTAVO DAVILA VAZQUEZ ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO Luc Dendooven SILVIA MARIBEL CONTRERAS RAMOS (2016)

"Vinasses are a residual liquid generated after the production of beverages, such as mezcal and tequila, from agave

(Agave L.), sugarcane (Saccharum officinarum L.) or sugar beet (Beta vulgaris L.). These effluents have specific characteristics

such as an acidic pH (from 3.9 to 5.1), a high chemical oxygen demand (50,000–95,000 mg L−1) and biological

oxygen demand content (18,900–78,300 mg L−1), a high total solids content (79,000 and 37,500 mg L−1), high total

volatile solids 79,000 and 82,222 mg L−1, and K+ (10–345 g L−1) content. Vinasses are most commonly discarded onto

soil. Irrigation of soil with vinasses, however, may induce physical, chemical and biochemical changes and affect crop

yields. Emission of greenhouse gases (GHG), such as carbon dioxide, nitrous oxide and methane, might increase from

soils irrigated with vinasses. An estimation of GHG emission from soil irrigated with vinasses is given and discussed in

this review".

Article

Agave, Greenhouse gases, Mezcal, Sugar beet, Sugarcane, Tequila CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA CIENCIAS DE LA TIERRA Y DEL ESPACIO CIENCIAS DEL SUELO (EDAFOLOGÍA) CONSERVACIÓN DE SUELOS

Mycobacterium tuberculosis TLR-2 agonists LprA, LM and Man-LAM induce notch1 and socs3 transcription

MARIO ALBERTO FLORES VALDEZ VANIA ELVIRA BONIFAZ PENA ERIKA NAHOMY MARINO MARMOLEJO CITLALLI TORNEZ BENITEZ Mabel Guzmán Rodríguez Abel Gutiérrez Ortega Letícia Santos (2011)

"Mycobacterium tuberculosis employs a number of strategies to subvert host signaling events, leading to its persistence within macrophages. Upon infection, Mycobacterium bovis BCG induce the expression of suppressor of cytokine signaling 3 (socs3), in a Toll-like receptor 2 (TLR2)-Notch1- dependent manner. Purified phosphatidyl inositol di-mannosides (a TLR2 agonist) act as an inducer for the Notch1-socs3 pathway. This prompted us to analyze other TLR2 agonists seeking for additional molecules that may affect this pathway. We found that lipoprotein LprA, as well as glycolipids lipomannan (LM), and mannose-capped lipoarabinomannan (ManLAM) treatment of murine macrophages resulted in stimulation of notch1 and socs3 transcription".

Article

BIOLOGÍA Y QUÍMICA BIOLOGÍA Y QUÍMICA