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Una aproximación a la estructura florística de las diatomeas epifitas de Zostera marina y sus variaciones temporales, en Bahía Falsa, San Quintín, B.C.

AN APPROXIMATION TO THE FLORISTIC STRUCTURE OF THE EPIPHYTIC DIATOMS OF Zostera marina AND ITS TEMPORAL VARIATIONS IN BAHIA FALSA, SAN QUINTIN, B.C.

David Alfaro Siqueiros Beltrones (1985)

De julio a diciembre de 1982, se tomaron muestras mensuales de Zostera marina en Bahía Falsa, San Quintín, para analízar la estructura de las asociaciones de diatomeas epífitas. Se determinó un tamaño de muestra de 1000 frústulas o individuos en base al índice de Shannon-Wiener (H’). Los parámetros que definen la estructura de la asociación, se estimaron a partir del indice de diversidad de Shannon-Wiener y del complemento del indice de Simpson (Ds), así como de los índices de equitabilidad (J’) y dominancia (REDI). La similitud entre muestras se midió con los índices de Stander y de Jaccard (SIM1 y JAC) . También se calculó la amplitud de nicho temporal de la especie (Bi) y el indice de valor biológico (IVB) de las mas importantes. La diversidad de las muestras fue alta en general, con un valor máximo de H’ de 4.15, para la muestra de noviembre y un minimo de 3.42 en septiembre. Las muestras presentaron poca similitud en cuanto a presencia y ausencia de especies, pero una semejanza relativamente alta en cuanto a las especies de mayor abundancia relativa. Las especies más importantes según su valor de IVB fueron.Naviculaparua, Cocconeis seutellum, C. seutellum var.parva, C. dirupta y Nitzschia frustulum var. per-minuta. La especie con mayor amplitud de nicho temporal fue Cocconeis placentula var. cuglypta.

During the second half of 1982, monthly samples of zostera marina where taken in Babia Falsa, San Quintín. The objective was to an 9 samples ofzostera marina where taken in Babia yze the structure of the associations of epiphytic diatoms. A sample size of 1000 individuals or frustules was determined, based on tests using the Shannon-Wiener index. The association structure parameters were estimated from the ShannonWiener diversity index and the complement of Simpson’s index (Ds) and also from the equitability (J’) and dominance (REDI) indexes. Similarity between samples was estimated with the Stander and Jaccard indexes (SIMI; JAC). Al so, the speciesniche breadth was measured and the biological index value (BIV) of the most important ones. Sample diversity was generally high, with a maximum H’ value of 4.15 for the November sample and a minimum of 3.42 in September. Using presence-absence of species, samples showed little similarity, but were relatively similar when considering the relative abundance of the more important species. The most important specles accordmg to therr 6lV were, Navicula parva, Cocconeis scutellum, C. seutelbm var. parva, C. dirupta and Nitzschia fn*stulum var. perminuta. The species with rhe wider niche breadth was Cocconeis placentula var. euglypta.

Article

Zostera marina, Bahía Falsa, San Quintín, Índice de Shannon-Wiener, Índice de Simpson, Índices de equitabilidad y dominancia, Índices de Stander y de Jaccard, Shannon-Wiener index, Simpson’s index, Equitability and dominance indexes, Stander and Jaccard indexes CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA CIENCIAS DE LA TIERRA Y DEL ESPACIO OCEANOGRAFÍA OCEANOGRAFÍA FÍSICA (VE R 5603 .04)

Estructura, crecimiento y dinámica de la selva baja caducifolia en el Ejido El Limón, Morelos.

MIGUEL ANGEL SANCHEZ HERNANDEZ (2018)

Tesis (Doctorado en Ciencias Forestales).- Colegio de Postgraduados, 2018.

Este trabajo se compone de cinco capítulos los cuales tienen como objetivo, determinar la estructura, crecimiento y dinámica de la Selva Baja Caducifolia (SBC) o también conocido como Bosque Tropical Caducifolio (BTC) en el Ejido el Limón de Cuauchichinola, Morelos. Para esto se realizó un inventario en 34 sitios de 500 m2 en los cuales se registró el diámetro a la altura de 1.30 m (Diámetro a la Altura del Pecho-DAP de las especies arbóreas). Se consideraron solamente individuos que presentaran un diámetro ≥ 10 cm registrando la altura total de estos, también se verificó la identidad taxonómica de las especies y sus sinonimias. Con estos datos se determinó la estructura horizontal y vertical, la composición florística, el índice de valor de importancia (IVI) y diversidad arbórea (Shannon-Wiener y Simpson). Además se obtuvo el Incremento en diámetro y altura el cual se obtuvo tomando una segunda medición de diámetro y altura de todos los individuos inventariados un año antes (primera medición junio 2016, segunda julio 2017). Conjuntamente se determinó la dinámica, para realizar las evaluaciones de esta se delimitaron sitios en con forma rectangular de 2.5 m de ancho por 10 m de largo, subdivididos en cuadrantes de 0.5 m, siempre con una orientación de oeste a este partiendo del centro del sitio de muestreo. Los individuos considerados como regeneración debían ser ≤ 30 cm de altura. Finalmente se determinó la fenología de cuatro especies de importancia en el Bosque Tropical Caducifolio: Copal manso (Bursera copallifera); Palo Dulce (Eysenhardtia polystachya); Tecolhuixtle (Acacia bilimekii), Tepemezquite “o” Tlahuitol (Lysiloma divaricata), la metodología consistió en la observación bimestralmente del estado fenológico en que se encontraban las especies seleccionadas. Los estados fenológicos a evaluar fueron: Reposo, Vegetativo, Floración, Fructificación y Semillación. _______________ STRUCTURE, GROWTH AND DYNAMICS OF THE TROPICAL DECIDUOUS FOREST IN EJIDO EL LIMÓN, MORELOS. ABSTRACT: This work consists of five chapters which objectives to determine the structure, growth and dynamics of the Lower Caducifolia Forest (SBC) or also known as Tropical Deciduous Forest (TDF) in the Ejido el Limón de Cuauchichinola, Morelos. For this purpose, an inventory was made in 34 sites of 500 m2 in which data such as the diameter at the height of 1.30 m (Diameter at Breast Height (DBH)) were taken into account only individuals with a diameter ≥ 10 cm, the total height of these, also verified the taxonomic identity of the species and their synonymies. With these data, the horizontal and vertical structure, floristic composition, importance value index (IVI) and tree diversity (Shannon-Wiener and Simpson) were determined. In addition, the increase in diameter and height was obtained, which was obtained by taking a second measurement of diameter and height of all the individuals inventoried one year before (first measurement June 2016, second July 2017). Jointly the dynamics were determined to perform the evaluations of this were delimited sites in rectangular shape of 2.5 m wide by 10 m long, subdivided into quadrants of 0.5 m, always with an orientation from west to east starting from the center of the site Of sampling. Individuals considered as regeneration should be ≤ 30 cm tall. Finally, the phenology of four important species in the Deciduous Tropical Forest: Copal manso (Bursera copallifera); Palo Dulce (Eysenhardtia polystachya); Tecolhuixtle (Acacia bilimekii), Tepemezquite "or" Tlahuitol (Lysiloma divaricata), the methodology consisted in the bimonthly observation of the phenological state in which the selected species were found. The phenological stages to be evaluated were: Rest, Vegetative, Flowering, Fructification and Seeding.

Doctoral thesis

Bosque Tropical Caducifolio Shannon-Wiener y Simpson Fenología Tropical Forest Caducifolio Shannon-Wiener and Simpson Phenology Ciencias Forestales Doctorado CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS CIENCIA FORESTAL CONSERVACIÓN

Estructura poblacional y diversidad genética de Dioon holmgrenii.

MARIO VALERIO VELASCO GARCÍA (2017)

Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista Forestal).- Colegio de Postgraduados, 2016.

Dioon holmgrenii De Luca, Sabato & Vázq. Torres está en peligro de extinción, es endémica y de distribución restringida en el sur de Oaxaca, México. A pesar de lo anterior no existe información sobre su estructura poblacional y diversidad genética, que permita precisar el nivel de riesgo de extinción de la especie. Los objetivos de este trabajo fueron: 1) conocer la estructura, heterogeneidad de estadios y el patrón de dispersión espacial y 2) determinar la diversidad genética y diferenciación entre poblaciones de D. holmgrenii. Unidades de muestreo se establecieron en sitios sin cambio aparente (SCUS) y con cambio de uso de suelo (CCUS) en 10 poblaciones para obtener la estructura poblacional y la dispersión espacial de los individuos. Foliolos de 285 plantas se recolectaron en nueve poblaciones y seis loci microsatélites se usaron para analizar la diversidad y estructura genética. La densidad promedio de individuos fue mayor en sitios SCUS que CCUS (782 vs. 353 plantas ha-1). Porcentaje alto de plántulas y adultos, con porcentaje bajo de plantas, juveniles y pre-reproductivos se registraron en sitios SCUS; porcentaje alto de adultos con porcentaje bajo de plántulas, juveniles y pre-reproductivos se hallaron en sitios CCUS. La heterogeneidad de estadios fue mayor en sitios SCUS que sitios CCUS (H´ = 1.57 vs. 1.38, p = 0.048). La semejanza dentro de sitios en SCUS (IM-H = 0.93, ISct = 0.81) y CCUS (IM-H = 0.83, ISct = 0.61) fue mayor que entre ambas condiciones (IM-H = 0.70, ISct = 0.53). La dispersión espacial de los individuos fue agregada (65 %). En las poblaciones de D. holmgrenii el número total de alelos varío de 20 a 39. El porcentaje de loci polimórfico varío de 83 a 100 %, la heterocigocidad promedio esperada de 0.496 a 0.790, heterocigocidad promedio observada de 0.610 a 0.978, índice de fijación de -0.601 a -0.091, el número promedio de alelos por locus de 3.3 a 6.5 y el índice de diversidad de Shannon de 0.899 a 1.651. Exceso de individuos heterocigotos se encontró a nivel población (FIS = -0.287) y déficit de individuos heterocigotos (FIT = 0.071) se encontró al considerar las nueve poblaciones juntas. La diferenciación genética entre poblaciones fue alta (FST = 0.287) con un número de migrantes menor a uno. Las distancias genéticas de Nei y los componentes principales (uno y dos) de los parámetros de diversidad genética agruparon a las poblaciones en dos grupos. Los resultados mostraron que las perturbaciones humanas disminuyen la calidad del hábitat para D. holmgrenii, siendo las plántulas y los juveniles los más afectados. La diversidad genética y la diferenciación entre poblaciones de D. holmgrenii fueron altos. _______________ POPULATION STRUCTURE AND GENETIC DEVERSITY OF Dioon holmgrenii. ABSTRACT: Dioon holmgrenii De Luca, Sabato & Vázq. Torres is an endangered and endemic species that grows in the south of Oaxaca, Mexico although there is no information about its population structure and genetic diversity that allows knowing the level of risk of extinction of the species. The aims of the present research were: 1) to know the structure, heterogeneity of stages, and the pattern of spatial dispersion; 2) to determine the genetic diversity and differentiation among populations of D. holmgrenii. Sampling plots were set in conditions without an evident change of land use (SCUS) and with an evident change of land (CCUS) use in ten populations. The DNA was extracted from leaflets of 285 plants from nine populations, and six microsatellite loci were selected d to estimate diversity and genetic structure. The average plant density was higher in SCUS sites than that in CCUS (782 vs. 353 plants ha-1). A high seedling percentage, high mature plant percentage, low pre-reproductive percentage and low juvenile plant percentage grew in SCUS; however, a high mature plant percentage, low seedling percentage, low sapling percentage and low pre-reproductive plant percentage occurred in CCUS. The stage heterogeneity was higher in SCUS than that in CCUS (H’ = 1.57 vs. 1.38). The similarity was higher in SCUS (IM-H = 0.93, ISCT = 0.81) and CCUS (IM-H = 0.83, ISCT = 0.61) than that between both conditions (IM-H = 0.70, ISCT = 0.53). The spatial-dispersion pattern of individuals was aggregate (65 %). D. holmgrenii populations had a number of alleles that varied from 20 to 39. Percentages of polymorphic loci were between 83 and 100 %; expected heterozygosity ranged from 0.496 to 0.790; observed mean heterozygosity fluctuated from 0.610 to 0.978; fixation index ranged between -0.601 and -0.091; the average number of alleles per locus varied from 3.3 to 6.5, and the Shannon diversity index fluctuated from 0.899 to 1.650. An excess of heterozygotes was found in the population level (FIS = -0287), and a deficit of heterozygotes (FIT = 0.071) was noticed by considering the nine populations together. The genetic differentiation among populations was high (FST = 0.287). The number of migrants was less than one. Nei genetic distances and the main component of genetic diversity parameters clustered the D. holmgrenii populations in two groups. The human disturbances decreased the habitat quality for D. holmgrenii. Seedlings and juveniles were the mainly affected. The genetic diversity and differentiation among D. holmgrenii populations were high.

Doctoral thesis

Cambio de uso de suelo Densidad Distancia genética Índice de Shannon Heterocigocidad Semejanza Density Heterozygosity Genetic distance Land use change Shannon index Similarity Ciencias Forestales Doctorado CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS CIENCIA FORESTAL PROTECCIÓN

Caracterización y mapeo de hábitat en bosque templado bajo manejo maderable.

ANGÉLICA YURIDIA VILLEGAS MACEDO (2019)

Tesis (Maestría en Ciencias Forestales).- Colegio de Postgraduados, 2019.

La conservación de la biodiversidad, en un escenario de demanda creciente por bienes y servicios derivados de los recursos forestales, sugiere implementar medidas de gestión forestal sostenible que permitan caracterizar y analizar la distribución de los recursos, específicamente, de los hábitats. Este trabajo reporta un estudio comparativo que evalúa la diversidad arbórea en rodales intervenidos silvícolamente, con propósito de producir madera, y rodales conservados. Paralelamente reporta modelos de regresión lineal múltiple ajustados usando el enfoque clásico y el enfoque Bayesiano, con la finalidad de predecir la diversidad arbórea en un bosque templado bajo manejo forestal maderable. Se aplicó un muestreo en campo por conglomerados con arreglo sistemático, mismo que se utilizó como base para obtener los datos para calcular diversos índices: de valor de importancia por especie, de diversidad de Shannon (H’), de Simpson (D) y de equidad de Pielou (J) para 157 sitios de 400 m2. Por otro lado, se utilizaron medidas de textura espectral obtenidas de imágenes RapidEye como indicadores de heterogeneidad espacial y métricas LiDAR como indicadores de variables estructurales de la masa forestal. Los resultados muestran que las intervenciones de aprovechamiento maderable reinician el desarrollo de los rodales, modificando los índices de diversidad y la estructura de los rodales. Se observó que al llegar a la etapa de latizal, los índices de diversidad se reestablecen, pues fueron estadísticamente similares a los de un bosque conservado sin intervenciones silvícola por mas de 80 años. Los modelos ajustados explican, en validación cruzada, cerca del 70% de variabilidad para índice de Shannon y el 60% para la Riqueza de especies. Las variables que más aportaron a los modelos fueron las métricas LIDAR (relacionadas a la altura del dosel) y en todos los casos, entre las medidas de textura estadísticamente significativas se encontraron la banda roja e infrarroja cercana. Se utilizó un modelo de regresión lineal múltiple para predecir el índice de Shannon en el área de estudio. _______________ ABSTRACT: Biodiversity conservation is a scenario for growing demand of benefits and services derived from forest resources that suggest implementing sustainable forest management measures that allow characterize and analyze resource distribution, specifically, from habitats. This paper reports a comparative study that evaluates tree diversity in silvicultural stands, with the purpose of producing wood, and conserved stands. At the same time, it reports multiple linear regression models adjusted using the classical approach and the Bayesian approach, in order to predict tree diversity in a temperate forest under timber management. Field sampling consisted on conglomerates with a systematic arrangement, wich was used as a basis to obtain importance value index, diversity of Shannon (H’), Simpson (D) and equity of Pielou (J) for 157 circle shaped sites of 400 m2. On the other hand, spectral texture measurements obtained from RapidEye images were used as indicators of spatial heterogeneity and LiDAR metrics as structural variables of the forest mass. Results show that timber harvesting interventions reinitiate the development of the stands, modifying their structure and diversity indexes, but, it was observed that diversity indexes are reestablished when the stand reaches the latizal stage; they were statistically similar to those of a conserved forest (without silvicultural interventions for more than 80 years). The adjusted models explain, in cross-validation, about 70% of variability for Shannon index and 60% for species richness. The variables that contributed the most to the models were LIDAR metrics (related to the height of the canopy) and in all cases, the red and near infrared bands as texture measurements. A multiple linear regression model was used to predict the Shannon index in the study area.

Master thesis

Diversidad en bosques manejados Índice de Shannon Riqueza específica Mapeo de hábitat Diversity in managed forests Shannon Index Specific Richness Habitat mapping Ciencias Forestales Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS CIENCIA FORESTAL CONSERVACIÓN

Ecología y taxonomía de las diatomeas epifitas de Zostera marina en Bahía Falsa, San Quintín, B.C

David Alfaro Siqueiros Beltrones (1984)

Durante el segundo semestre de 1982 se tomaron muestras de Zostera marina en Bahía Falsa, San Quintín con el fin de determinar la composición florística y estructura de la asociación de diatomeas epífitas. Se determinó un tamaño de muestra de 1000 individuos en base al Índice de Heterogeneidad (Hʻ). Los parámetros que definen la estructura de la asociación se estimaron a partir de los índices de diversidad (Hʻ), riqueza de especies (Da), equitabilidad (J) y dominancia (ƛ. REDI). SE calculó la similitud entre muestras en base a los índices de Jaccard y de Stander (JAC y SIMI) y se determinó la amplitud de nicho temporal (Bi). Así como el índice de valor biológico de las especies (IVB). El análisis taxonómico resuiltó en un total de 235 taxa entre especies y variedades, para los seis meses. Las asociaciones de diatomeas estuvieron representadas por pocas especies abundantes y muchas especies raras. El mayor número de taxa (112) se observó en la muestra de Octubre. La diversidad (H') de las muestras fué alta en general, con un máximo de 4.15 para la muestra de Noviembre y un mínimo (3.42) en Septiembre. Las muestras presentaron poca similitud en cuanto a la presencia y ausencia de especies, pero una semejanza relativamente alta en cuanto a la abundancia relativa de las especies más comunes. Las especies más importantes según su valor de IVB, fueron Navicula parva, Cocconeis scutellum, C, scutellum var, parva, C. dirupta y Nitzchia frustulum var. perminuta. La especie con mayor amplitud de nicho temporal fué Cocconeis placentula var. euglypta. Se relacionan las variaciones observadas en los índices calculados con el ciclo de vida de Z. marina, así como con la dinámica propia de la bahía, en base a medidas de temperatura, salinidad y nutrimentos.

Master thesis

Taxonomía de zostera marina,Taxonomía de diatomeas,Ecología de diatomeas,Bahía Falsa,San Quintín,Baja California,Ciencias del mar CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS PECES Y FAUNA SILVESTRE PECES Y FAUNA SILVESTRE

Organización, conservación y aprovechamiento de bromelias y otros recursos forestales no maderables en Santa Catarina Ixtepeji, Oaxaca.

SABINA CARVENTE ACTEOPAN (2016)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Desarrollo Rural).- Colegio de Postgraduados, 2016.

En “El Punto”, Santa Catarina Ixtepeji, Oaxaca se aprovechan bromelias y otros Recursos Forestales No Maderables (RFNM) en época navideña principalmente. En esta investigación se estudiaron, analizaron y visibilizaron las formas y estrategias de organización social comunitaria para el uso, manejo y aprovechamiento de la diversidad de bromelias y otros RFNM, en “El Punto” Santa Catarina Ixtepeji, Oaxaca. Se encontraron dos formas de organización, para el aprovechamiento de bromelias y otros RFNM. a) Un grupo de recolectores aprovecha en temporada navideña y funcionan mediante mecanismos de control local y, b) una Unidad de Manejo de la Vida Silvestre (UMA) integrada por mujeres que recolectan únicamente bromelias durante todo el año en zonas específicas de bosques de encino, pino y mixtos. Las zonas fueron: La Cruz de Yovaneli, La Curva de San Miguel, Reynoso y La Petenera. La mayor diversidad y abundancia se observó en los árboles de Quercus, ya que estos al parecen ser excelentes forófitos. El índice de diversidad de Shannon fue más alto en las zonas de la Curva de San Miguel y Reynoso. Dos especies de bromelias están protegidas por la ley. Por lo tanto estos bosques son importantes para la comunidad y para la conservación de la biodiversidad del país. _______________ ORGANIZATION, COLLECTION AND EXPLOITATION OF BROMELIADS AND OTHER NON-TIMBER FOREST RESOURCES IN SANTA CATARINA IXTEPEJI, OAXACA. ABSTRACT: In “El Punto”, Santa Catarina Ixtepeji, Oaxaca, people benefit from bromeliads and other Non-Timber Forest Resources (NTFR) mainly in Christmas season.

In this research were studied, analyzed and visibilizaron forms and strategies of community social organization for use, handling and use of the diversity of bromeliads and other RFNM, in "El Punto" Santa Catarina Ixtepeji, Oaxaca.There were found two ways people organize to benefit from bromeliads and NTFR: a) A group of pickers work in Christmas season and are managed by a local control. b) An Units for conservation, management and sustainable use of wildlife (UMA) integrated by women that pick up exclusively bromeliads throughout the year in specific zones at Holm Oak, Pine Tree and mixed forests. Such zones were: La Cruz de Yovaneli, La Curva de San Miguel, Reynoso and La Petenera. The highest diversity and abundance were observed in Quercus trees, because such trees result to be excellent phorophytes. The highest value in Shannon diversity index was achieved in La Curva de San Miguel and Reynoso zones. Two bromeliad species are protected by law. Therefore, these forests are important to the community and to the biodiversity of the country.

Master thesis

UMA Recolectores Diversidad Índice de Shannon Forofito Bromeliad picker Diversity Shannon index Phorophyte Desarrollo Rural Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS CIENCIA FORESTAL TÉCNICAS DE CULTIVO

Composición y variación temporal en la abundancia y biomasa de la epifauna asociada a una pradera de Zostera marina en Bahía San Quintín, B.C

Patricia Quiroz Vázquez (2002)

Este estudio describe la composición y variación temporal en la estructura de la comunidad epifaunal (≤ 1 mm) asociada a una pradera de Zostera marina en Bahía Falsa, San Quintín, así como su relación con la densidad y biomasa de los pastos. Las muestras consideradas para este análisis corresponden a los meses de abril, mayo, julio, agosto, octubre y noviembre de 1993. La estructura de la comunidad se determinó mediante el análisis de descriptores como abundancia, riqueza, biomasa, diversidad y dominancia. La relación entre estos descriptores y las variables estructurales de la pradera se determinó mediante un análisis de correlación por rangos de Spearman. Se registré un total de 74 taxa pertenecientes a cuatro grupos taxonómicos: poliquetos, crustáceos, peces y moluscos. Los dos primeros grupos presentaron la mayor riqueza de especies (24 taxa = 32% cada uno), mientras que el último fue el más abundante al contribuir con el 71%del total de organismos recolectados. Las especies más importantes en abundancia y biomasa fueron Assiminea dubiosa (70 y 15%, respectivamente) e Hippolyte californiensis (5 y 32%). Los valores de los descriptores comunitarios presentaron notables variaciones a lo largo del periodo de muestreo. La abundancia más alta se presentó en agosto y la más baja en noviembre. La mayor riqueza se registró en noviembre y la más baja en abril. La diversidad y equidad presentaron valores altos en julio y agosto, y valores bajos el resto de los meses. La biomasa presentó dos picos, uno en mayo y otro en octubre. Las tendencias temporales de la mayoría de los descriptores comunitarios no presentaron una relación clara con los factores estructurales de la pradera, a excepción de la diversidad cuya relación con la biomasa de Z. marina fue alta (rs=1, p0.05). Las tendencias temporales de las especies más importantes de poliquetos y anfípodos del orden Gammaridea coincidieron notablemente con la de biomasa de Z. marina. La falta de relación entre la mayoría de los descriptores de la comunidad y la densidad y biomasa de los pastos puede deberse al tipo de muestreo realizado, y a Ja diferencia en los ciclos de vida de las especies analizadas. La semejanza entre los patrones temporales de poliquetos y anfípodos y el de biomasa de Z. marina pueden deberse a la estrecha asociación de estos organismos con la estructura foliar de la planta...

This study describes the composition and temporal variation in the structure of the epifaunal community (≤ 1 mm) associated with a Zostera marina (eelgrass) bed in Bahia Falsa, San Quintin, and its relationship with the seagrass density and biomass. Samples used for this analysis correspond to April, May, July, August, October, and November 1993. Community structure was determined by means of descriptors such as abundance, richness, biomass, diversity, and dominance. The relationship between these descriptors and the bed structural variables was established using Spearman's rank correlation test. A total of 74 taxa belonging to four taxonomical groups were recorded: polychaetes, crustaceans, fish, and mollusks. The first two groups were characterized by the highest species richness (24 taxa = 32% each one), while the last group was the most abundant, as it contributed with 71% of the total collected animals. The most important species in abundance and biomass were Assiminea dubiosa (70 and 15% respectively), and Hippolyte californiensis (5 and 32% respectively). Community descriptors were characterized by important variations during the study period. Abundance was highest in August, and the lowest in November. The highest richness was recorded in November and the lowest in April. Diversity; and evenness showed high values in July and August, and low values the remaining months. Biomass showed two peaks: May and October. Most community descriptors showed seasonal trends that were not clearly related with the seagrass bed structure, with diversity being the exception, as its relationship with eelgrass biomass was high (rs=1, p0.05). Temporal trends of the most important polychaetes species, and amphipods of the Gammaridea order showed striking coincidences with eelgrass biomass. The lack of relationship between most community descriptors, and Z. marina’s biomass and density could be due to sampling design, and differences in the life cycles of the analyzed species. Similarities in polychaetes and anphipods’ temporal trends and eelgrass biomass could be due to the strong relationship of these organisms with seagrass leaves. In general terms, the described faunal structure is similar to the one reported for other sites, and other temperate seagrass species...

Master thesis

Zostera marina - México, Bahía San Quintín(Baja California),Ciencias del mar CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS PECES Y FAUNA SILVESTRE PECES Y FAUNA SILVESTRE

Amarillamiento del pino híbrido (Pinus elliottii var. elliottii x Pinus caribaea var. hondurensis) por Lasiodiplodia sp. y su relación con factores edáficos en Veracruz, México.

LAURA ROSNEY JIMÉNEZ GONZÁLEZ (2020)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo, 2020.

El establecimiento de las plantaciones forestales comerciales en Veracruz puede verse influenciada negativamente por diversos factores, entre los que destacan, el clima, la calidad del suelo y las enfermedades. El objetivo de la presente investigación fue determinar la etiología del amarillamiento de árboles de pino híbrido y su relación con las propiedades físicas, químicas y biológicas del suelo. En diciembre de 2018, en las plantaciones forestales comerciales del sur de Veracruz, se colectaron muestras de raíz y tallo de árboles con amarillamiento y muestras asintomáticas para el aislamiento de hongos fitopatógenos. En agosto 2019, se colectaron 85 muestras de suelo de 500g c/u a 30 cm de profundidad, para la determinación nutrimental del suelo, los cuales se realizaron en GISENAlabs Texcoco, Edo. de México, bajo la metodología interna del Laboratorio y la NOM-021-RECNAT-2000. Del mismo modo, de árboles con amarillamiento, en seis lotes de aproximadamente una hectárea cada una, se colectaron 36 muestras de suelo de 200 g c/u, para el análisis de la diversidad fúngica, lo cual se realizó en el laboratorio de Patología Forestal del COLPOS al igual que el manejo de las muestras de tejido vegetal. Estas últimas se sembraron en cajas Petri con medio de cultivo papa-dextrosa-agar (PDA) y se incubaron a 28±2 °C. Para diversidad fúngica, se utilizó medio PDA-TS (Papa – Dextrosa – Agar- Tergitol – Estreptomicina) de Steiner y Watson (1965). De los árboles muestreados, se aisló el hongo Lasiodiplodia sp. proveniente del tallo, generando una asociación hospedante-patógeno del 34.6%, de la cual, el 24.6% se aislaron de muestras con amarillamiento, mientras que el 10% restante se aisló de árboles asintomáticos. Mediante análisis filogenético de la región ITS, los genes β-tubulina (β-tub) y factor de elongación 1-alfa (TEF1-α), se identificaron las especies Lasiodiplodia theobromae, L. brasiliense y L. iraniensis. Por su prevalencia y asociación constante con los síntomas bajo estudio, la cepa L. theobromae se seleccionó para la prueba de patogenicidad y cuatro días después de la inoculación se presentaron los síntomas típicos de amarillamiento y muerte de plántulas. Los resultados de las variables de suelo indican bajos niveles de materia orgánica, pH de ácidos a fuertemente ácido, con baja disponibilidad de N, P, K, analizados de acuerdo a la norma 021. Los hongos del suelo identificados fueron Aspergillus, Penicillium, Trichoderma y Fusarium. De acuerdo al índice de Shannon-Weaver la diversidad fúngica es baja, lo cual se relaciona con niveles bajos de materia orgánica y poca disponibilidad de nutrimentos. De acuerdo a los resultados se concluye que Lasiodiplodia theobromae está estrechamente relacionado con la baja calidad del suelo misma que afecta el desarrollo de los árboles sometiéndolas a estrés constante, condición que originó el desarrollo del hongo. _______________ YELLOWING OF THE HYBRID PINE (Pinus elliottii var. elliottii x Pinus caribaea var. hondurensis) FOR Lasiodiplodia sp. AND ITS RELATIONSHIP WITH EDAPHIC FACTORS IN VERACRUZ, MEXICO. ABSTRACT: The establishment of commercial forest plantations in Veracruz can be negatively influenced by several factors, including climate, soil quality and diseases. The main goal of this research was to determine the etiology of the yellowing of hybrid pine tree and their relationship with the physical, chemical and biological properties of the soil. In december 2018, root and stem samples of trees with yellowing and asymptomatic samples were collected in the commercial forest plantations in south of Veracruz, for the isolation of phytopathogenic fungi. In august 2019, 85 soil samples of 500 g each to were collected at a depth of 30 cm, for soil analysis, which were carried out at GISENAlabs Texcoco, State of Mexico under the methodology of the Laboratory and the NOM-021-RECNAT-2000. Also, from yellowing trees, in six plots of approximately one hectare each, 36 soil samples of 200 g each were collected for fungal diversity analysis, carried out in the Forest Pathology laboratory of COLPOS as well as plant tissue samples processing. The latter were seeded in Petri dishes with potato-dextrose-agar (PDA) culture medium and incubated at 28±2 °C. For fungal diversity analysis, PDA-TS medium (Potato - Dextrose - Agar - Tergitol - Streptomycin) by Steiner and Watson (1965) was used. Of the trees sampled, the fungus Lasiodiplodia sp. was isolated from the stem, generating a host/pathogenic association of 34.6%, of which 24.6% were isolated from samples with yellowing, while the remaining 10% were isolated from asymptomatic trees. Through phylogenetic analysis of ITS region, β-tubulin (β-tub) and 1-alpha elongation factor (TEF1-α) genes, the species Lasiodiplodia theobromae, L. brasiliense and L. iraniensis were identified. Because of its prevalence and constant association with the symptoms under study, the L. theobromae strain was selected for the pathogenicity test and four days after inoculation the typical symptoms of yellowing and seedling death occurred. The results of the soil variables indicate low levels of organic matter, acidic and strongly acidic pH's, with low availability of N, P, K, analyzed according to standard 021. The soil fungi identified were Aspergillus, Penicillium, Trichoderma and Fusarium. According to the Shannon-Weaver index the fungal diversity is low which is related to low levels of organic matter and low nutrients availability. According to the results, it is concluded that Lasiodiplodia theobromae is closely related to the low quality of the soil itself, which affects the development of trees by predisposing them to constant stress, a condition that originates the development of the fungus.

Master thesis

Identificación filogenética Lasiodiplodia theobromae Calidad del suelo PDA-TS Índice de Shannon-Weaver Phylogenetic identification Soil quality Shannon-Weaver Index Fitopatología Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS CIENCIA FORESTAL CONSERVACIÓN

Diversidad beta de la mastofauna terrestre del estado de Oaxaca, México

Yazmín Monroy García (2017)

En México existen muchas regiones con un alto valor de diversidad alfa. Sin embargo, la explicación más clara sobre la gran riqueza biológica en el país es la diversidad beta, la cual puede definirse como el cambio en la composición de especies entre dos o más áreas. El recambio de especies de mamíferos terrestres (voladores y no-voladores) es resultado de diferentes factores, principalmente del área de distribución de las especies y de la heterogeneidad ambiental. En este sentido el objetivo de este trabajo fue analizar la diversidad beta de los mamíferos terrestres de Oaxaca considerando diferentes niveles, tales como las regiones geográficas delimitadas para el estado, cuencas hidrológicas y diferentes tipos de vegetación presentes en el estado. El estudio se realizó con un total de 17 670 registros de mamíferos terrestres, 12 373 registros de mamíferos no-voladores, los cuales corresponden a 126 especies y 5 297 registros de mamíferos voladores, pertenecientes a 96 especies. Los resultados de diversidad beta obtenidos mediante los diferentes índices para la base de datos completa, son los siguientes: regiones geográficas: índice de Jaccard: 0.57, índice de Morisita-Horn: 0.72, Complementariedad total: 57.1%; cuencas hidrológicas: índice de Jaccard: 0.27, índice de Morisita-Horn: 0.39, Complementariedad total: 76.2% y tipos de vegetación: índice de Jaccard: 0.21, índice de Morisita-Horn: 0.30, Complementariedad total: 65.4%, índice de Cody: 54%. Dichos resultados son muestra de que en Oaxaca, tal como pasa en México, xiste una alta diversidad beta, lo cual puede corroborarse con forme a lo establecido en el criterio teórico de cada medición. De forma particular, la diversidad beta de los mamíferos no voladores tiende a ser más alta que en los mamíferos voladores. Sin embargo, para poder garantizar la conservación de ambos grupos de mamíferos se requeriría proteger el mayor número de sitios, donde estos grupos se distribuyen.

Master thesis

BIOLOGÍA Y QUÍMICA Ecología mamíferos índice de Jaccard índice de Morisita-Horn

Diversidad Beta de los anfibios del estado de Oaxaca

Alba Lilia Santiago Cruz (2019)

El estado de Oaxaca contiene una gran riqueza de vertebrados terrestres, ocupa el primer lugar en riqueza de anfibios. Esta riqueza se ha visto amenazada por distintos factores como enfermedades y la destrucción de su hábitat debido a la actividad antropogénica. El cálculo de la diversidad en sus distintos componentes y en distintos gradientes geográficos nos proporciona información para la creación de estrategias de conservación adecuadas para este grupo. En este trabajo se calculó la diversidad alfa (riqueza) y beta (índice de Jaccard) en tres divisiones espaciales: subprovincias fisiográficas, altitud y vegetación. Además, se evaluó la información de los anfibios dentro de las áreas protegidas del estado. Para los análisis se usaron la base de SNIB-CONABIO complementada con datos de Gbif y publicaciones. Con un total de 11673 registros en 1754 localidades de colecta, se analizó la distribución de 149 especies de anfibios de Oaxaca. La Sierra Madre de Oaxaca contuvo el mayor número de especies, seguido por la Sierra Madre del Sur y las Montañas y Valles de Oaxaca, encontrándose en cada una de ellas alrededor de un tercio de las especies. La diversidad beta entre las provincias definió dos grandes zonas de distribución de los anfibios, una hacia el pacífico (desde los Valles Centrales hasta la Costa) y otra hacia el golfo de México (desde la Sierra Madre de Oaxaca, las provincias del Istmo y Planicie del Golfo). En cuanto a la altitud se pueden definir dos zonas, una por encima de los 2000 m s.n.m donde los valores de similitud son menores; la otra zona por debajo de los 2000m s.n.m donde los valores de similitud en general son más altos. En cuanto a los datos de vegetación y de las áreas protegidas del estado los resultados no fueron consistentes debido a la falta de registros. Se concluye que los datos de las bases usadas, permiten una evaluación congruente que refleja patrones de diversidad espacial de los anfibios del estado de Oaxaca.

Master thesis

BIOLOGÍA Y QUÍMICA índice de Jaccard, provincias fisiográficas, altitud, vegetación