Autor: RAMON ALBERTO BATISTA GARCIA

Análisis genómico y metagenómico para la búsqueda de proteínas con utilidad en deconstrucción de lignocelulosa

RAMON ALBERTO BATISTA GARCIA (2015)

La creciente demanda de combustibles fósiles y los pronósticos de la industria

petrolera internacional demandan la necesidad de nuevos sistemas combustibles

como el bioetanol. Actualmente, los desechos lignocelulósicos se definen como las

principales materias primas para la producción de bioetanol y otros productos

valorizables en los esquemas de biorrefinación. Sin embargo, la deconstrucción de

la biomasa vegetal constituye un reto para la factibilidad y sostenibilidad de las

biorrefinerías. La organizada estructura polimérica y composición química de la

lignocelulosa define la recalcitrancia de este material, y a la vez se necesitan de

múltiples proteínas para su degradación, entre ellas: proteínas amorfogénicas,

celulasas, xilanasas, esterasas y peroxidasas. Los enfoques genómicos y

metagenómicos complementados con estudios de ecología clásica, permiten el

análisis integral de la biodiversidad y recursos genéticos de un ecosistema

determinado. Atendiendo a los criterios anteriores, el objetivo general de este

trabajo fue: “Analizar genes y/o proteínas con utilidad en la deconstrucción de

lignocelulosa para su conversión en materias primas de interés para las

biorrefinerías”.

Se identificaron las poblaciones bacterianas degradadoras de bagazo de caña de

azúcar mediante una librería de ARNr16S obtenida de un metagenoma de bagazo

de caña de azúcar, y se evidenciaron distantes relaciones filogenéticas con las

secuencias de referencias. A la vez se realizó la caracterización bioquímica y

estructural de una expansina de Schizophyllum commune con utilidad en la

liberación de glucosa y N-acetilglucosamina a partir de celulosa cristalina y quitina.

Para complementar los estudios anteriores, se estudiaron las actividades

ligninolíticas de cuatro hongos, los cuales mostraron capacidad para colonizar

diferentes sustratos lignocelulósicos. Aspergillus caesiellus H1 fue aislado de

bagazo de caña de azúcar en fermentación; mientras Cadophora sp. TS2,

Emericellopsis sp. TS 11 y Pseudogymnoascus sp. TS12 fueron aislados de la

esponja marina Steletta normani. Estos ascomicetos mostraron novedosos perfiles

de enzimas lignocelulolíticas respecto a termotolerancia, haloestabilidad y

temperatura y pH óptimos.

Tesis de doctorado

BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA

Manual de métodos para el estudio de extremófilos

MA. NIEVES TRUJILLO TAPIA RAMON ALBERTO BATISTA GARCIA MARIA EUGENIA HIDALGO LARA ROSA MARIA CAMACHO RUIZ (2023)

En un principio, se pensó que si era posible encontrar vida en ambientes con elevada o baja temperatura, con valores de pH muy ácidos o alcalinos o en lugares con baja disponibilidad de agua, alta presión y elevados niveles de salinidad, entonces se podía hallar vida en otros planetas cuyas condiciones fueran similares. Es así como se exploraron los desiertos, glaciares, géiseres, lagos salados, volcanes, ventanas hidrotermales y numerosos lugares extremos. No obstante, el estudio de los ambientes extremos nos ha llevado a la mejor comprensión de la evolución de la vida en la Tierra y a entender las interacciones que se establecen en las comunidades bacterianas para sobrevivir en ambientes hostiles.

Esta publicación, compilada por miembros de la Red Mexicana de Extremófilos (REMEX), se concibió con el propósito de contribuir a la difusión de los procedimientos que la comunidad científica nacional ha desarrollado para el estudio de los ambientes extremos y de los organismos que en estos pueden encontrarse. El manual está organizado en ocho capítulos que abordan temas como: aislamiento, identificación, conservación de microorganismos, extracción, producción, cuantificación, prospección, aplicaciones de sus biomoléculas, así como enfoques bioinformáticos y metagenómicos. Incluye además recomendaciones para buenas prácticas y manejo de residuos. Esta edición busca, además, introducir a investigadores y estudiantes al estudio de la vida en condiciones extremas.

Libro

BIOLOGÍA Y QUÍMICA QUÍMICA extremófilos