Título
Síntesis y reconocimiento molecular de aniones fosfatados por nuevos derivados de espiramicina
Autor
KARLA ISABEL RIVERA MARQUEZ
Colaborador
FELIPE MEDRANO VALENZUELA
Nivel de Acceso
Acceso Abierto
Resumen o descripción
RESUMEN
En este proyecto de tesis se presenta el estudio de reconocimiento molecular de aniones por nuevos derivados aromáticos del antibiótico natural espiramicina, que es un compuesto perteneciente a la familia de los macrólidos y que presenta muchas de las características adecuadas para funcionar como un buen receptor de aniones, ya que posee dos aminoazúcares cargados positivamente en pH ácido, así como grupos hidrofóbicos e hidrofílicos y una gran cantidad de centros quirales. Sin embargo, carece de grupos aromáticos que le confieran propiedades fotofísicas de absorción y que pudieran favorecer interacciones con las unidades aromáticas de los aniones estudiados AMP, ADP y ATP.
Se llevó a cabo la síntesis de cuatro nuevos derivados de espiramicina 1a-d introduciendo aminas con fragmentos aromáticos tales como: bencilo (1a), 2-metil-piridina (1b), 1-metil-natftilo (1c) y 1-metil-pirenilo (1d) mediante reacción de aminación reductiva del grupo aldehído de la espiramicina. Los derivados fueron completamente caracterizados mediante RMN (1H, 13C) y espectrometría de masas (HRMS). La adición de fragmentos aromáticos a la espiramicina se hizo con la finalidad de estudiar las propiedades fotofísicas de los nuevos derivados por la técnica espectrofotométrica UV-visible.
Posteriormente, se llevaron a cabo estudios para la determinación de las constantes de protonación (pKa´s) de los derivados 1a-c por la técnica de potenciometría. Adicionalmente, las constantes de protonación calculadas para el derivado 1b fueron asignadas mediante titulación potenciométrica seguida por RMN 1H en D2O.
Se realizaron estudios de reconocimiento molecular por potenciometría para la determinación de las constantes de asociación de 1a-c con huéspedes aniónicos de estructura diversa; en donde, el compuesto 1a reconoció selectivamente a los aniones fosfatados en el siguiente orden ADP > ATP > AMP > pirofosfato > fosfato, con constantes de magnitud log K = 4.82 - 3.34. Por otro lado, también se observó la asociación de 1a con dicarboxilatos, observándose una mayor afinidad por pimelato sobre adipato (log K = 4.80
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y 4.56, respectivamente). La tendencia de selectividad para los complejos formados por 1b con la misma serie de aniones fue: pirofosfato > fosfato > ATP > AMP > ADP (log K = 4.16- 2.67); mientras que con la serie de ácidos dicarboxílicos la selectividad fue: succinato > adipato > pimelato > suberato (log K = 3.27 – 3.03). Finalmente, para el receptor 1c sólo se estudió la serie de nucleótidos de adenina, cuya tendencia para la complejación fue: ATP > ADP > AMP (log K = 6.40 – 4.10). Adicionalmente, por ITC se determinaron los parámetros termodinámicos para la formación del complejo 1b-ATP. No obstante, por medio de UV-visible no fue posible determinar las constantes de asociación entre los derivados 1c-d con los nucleótidos de adenina.
Se llevaron a cabo titulaciones por RMN 1H y 31P en D2O entre el derivado 1b con los aniones ATP y ADP con el fin de conocer los sitios de interacción en los complejos formados. Los valores de CIS calculados indicaron que dichos complejos se forman principalmente por interacciones de puente de hidrógeno entre los grupos amino protonados del receptor y los grupos fosfato de los nucleótidos, lo cual fue confirmado mediante estudios de química computacional a nivel de mecánica molecular.
De este trabajo se concluye que el derivado bencil espiramicina 1a, mostró mayor afinidad hacia ATP y pirofosfato; mientras que el derivado 2-picolil espiramicina 1b mejoró su capacidad en el reconocimiento molecular únicamente hacia el pirofosfato y el derivado naftil espiramicina 1c potencializó su afinidad hacia ATP, todas ellas en comparación con las reportadas por espiramicina. El derivado 1a también mostró constantes de asociación más altas hacia los aniones dicarboxilato, como adipato y pimelato en comparación con las obtenidas por espiramicina. Cabe destacar que estas constantes se obtuvieron mediante la técnica de potenciometría, la cual nos permitió trabajar con mezclas acuosas para disolver mejor los derivados, arrojando valores de constantes más confiables. La técnica de ITC únicamente permitió trabajar con compuestos solubles en agua, por lo cual el derivado 1b fue el único que se estudió bajo esta técnica, determinándose los valores termodinámicos para el complejo 1b - ATP. Finalmente, por espectrofotometría con la técnica de UV-visible sólo fue posible trabajar con los derivados 1c-d, los cuales presentaron absorbancias significativas debido a la presencia de grandes grupos aromáticos.
ABSTRACT
In this work, the study of the anion molecular recognition by new derivatives of spiramycin is presented. Spiramycin is a natural antibiotic of the macrolide family and has many of the adequate characteristics to work as an efficient receptor for anions, including two aminosugar moieties with a positive charge at acidic pH, hydrophobic and hydrophilic groups as well as several chiral centers. However, spiramycin lacks aromatic groups that can confer photophysical properties of light emission/absorption or the ability to establish - interactions with anions such as AMP, ADP or ATP.
The synthesis of four new derivatives 1a-d was carried out by reductive amination of the spiramycin aldehyde group to link aromatic moieties, such as benzyl (1a), 2-methyl-pyridyl (1b), 1-methyl-naphthyl (1c) and 1-methyl-pyrenyl (1d). The compounds 1a-d were fully characterized by 1H, and 13C NMR and mass spectrometry (HRMS). The aim of introducing aromatic fragments into the structure of spiramycin was to study the photophysical properties of the new derivatives by UV-vis spectrophotometry.
Later, studies for the determination of protonation constants (pKa´s) of the derivatives by potentiometry were carried out. Additionally, the determined protonation constants for 1b were assigned unequivocally by 1H NMR titrations in D2O.
Molecular recognition studies to determine the association constants between 1a-c with diverse anionic guests were carried out by potentiometry. Compound 1a selectively recognized phosphate anions in the order ADP > ATP > AMP > pyrophosphate, phosphate with association constant in the range log K = 4.82 - 3.34. In another side, the association of 1a with dicarboxylates also was observed, in this case a higher affinity for pimelate over adipate (log K = 4.80 and 4.56, respectively) was observed.
The selectivity trend for the complexes formed between 1b and the same anion series was: pyrophosphate > phosphate > ATP > ADP > AMP (log K = 4.16 - 2.67); while with the studied dicarboxylates the selectivity followed the order: succinate > adipate > pimelate > suberate (log K = 3.27 – 3.03). Finally, receptor 1c was only studied with adenine nucleotides, which
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form complexes in the affinity trend: ATP > ADP > AMP (log K = 6.40 – 4.10). Besides, the thermodynamic parameters of the association between 1b-ATP were determined by ITC. The determination of association constants between the receptors 1c-d and nucleotides was not possible by UV-vis spectroscopy.
In order to determine the interaction sites in the structure complexes formed between 1b derivative with ATP and ADP nucleotides, some 1H and 31P NMR titrations were performed. The calculated CIS values indicated that these complexes are formed by hydrogen bonds between the protonated amino groups of the receptor and phosphate moieties of the nucleotides, which was confirmed by molecular mechanic computational studies.
In conclusion, compared with spiramycin, the benzyl spiramycin derivative 1a, has the highest affinity toward ATP and pyrophosphate; while 2-picolyl spiramycin, 1b improved its molecular recognition ability towards pyrophosphate and naphthyl spiramycin derivative 1c showed a higher affinity for ATP. Derivative 1a also showed higher association constants with dicarboxylates as pimelate and adipate in comparison with spyramycin. It´s essential to remark that constants obtained by potentiometry in aqueous solution in this study are trustworthy. Because of the ITC equipment only allows to work with substances totally dissolved in water; just the derivative 1b was studied by this technique, where the thermodynamic parameters for the 1b-ATP complex were determined. Finally, complexes with the derivatives 1c-d were analyzed by UV-Vis spectrophotometry due to the strong absorption of the aromatic groups present in the structure of the derivatives.
Editor
El autor
Fecha de publicación
18 de mayo de 2018
Tipo de publicación
Tesis de doctorado
Recurso de información
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Idioma
Español
Cobertura
MEX
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Repositorio Orígen
Repositorio Institucional de Acceso Abierto de la Universidad Autónoma del Estado de Morelos
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