Autor: natalia palacios rojas

Replication Data for: Bayesian linear regression near infrared spectroscopy (NIR) to predict provitamin A carotenoids content in maize breeding programs

Jose Crossa Thanda Dhliwayo THOKOZILE NDHLELA natalia palacios rojas (2021)

Vitamin A deficiency (VAD) is a public health problem worldwide. For countries with a high per capita consumption of maize, breeding varieties with higher provitamin A carotenoid content than normal yellow maize — biofortification — can be a viable strategy to reduce VAD. Selection for provitamin A carotenoid content uses molecular markers and phenotypic data generated using expensive and laborious wet lab analyses. Near-infrared spectroscopy (NIRS) could be a fast and cheap method to measure carotenoids. This dataset contains carotenoid and NIRS data from 1857 tropical maize samples used as a training set to predict provitamin A carotenoid content of an independent set of 650 tropical maize samples using Bayesian linear regression models. The datasets contain information about specific carotenoids measured and the NIRS values measured at different wavelengths. The results of the analysis are described in the accompanying article.

Dataset

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Replication Data for: Investigating genomic prediction strategies for grain carotenoid traits in a tropical/subtropical maize panel

Mary-Francis LaPorte Pattama Hannok Peter Bradbury Jose Crossa natalia palacios rojas Christine Diepenbrock (2024)

Vitamin A deficiency continues to cause challenges around the world including in areas where maize is an important component of human diets. Biofortification offers one solution for alleviating this deficiency. A Carotenoid Association Mapping panel, developed by the International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT) contains 380 inbred lines adapted to tropical and subtropical environments that have varying grain concentrations of provitamin A and other health-beneficial carotenoids. The data in this study were used to assess the accuracy of several genomic prediction (GP) strategies for maize grain carotenoid traits within and between four environments in Mexico. Results are provided for these strategies including Ridge Regression-Best Linear Unbiased Prediction (including all markers versus subsets of markers), Elastic Net, Reproducing Kernel Hilbert Spaces, and Least Absolute Shrinkage and Selection Operator. The findings described in the accompanying journal article indicate the utility of genomic prediction methods for grain carotenoid traits and could inform their resource-efficient implementation in biofortification breeding programs.

Dataset

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Replication Data for: Genomic Prediction with Genotype by Environment Interaction Analysis for Kernel Zinc Concentration in Tropical Maize Germplasm

Edna Mageto Jose Crossa Paulino Pérez-Rodríguez Thanda Dhliwayo natalia palacios rojas XUECAI ZHANG (2020)

The Zinc association mapping (ZAM) panel is a set of 923 elite inbred lines from the International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT) biofortification breeding program. The panel represented wide genetic diversity for kernel Zn and is comprised of several lines with tolerance/resistance to an array of abiotic and biotic stresses commonly affecting maize production in the tropics, improved nitrogen use efficiency, and grain nutritional quality. The ZAM panel_923_LINES_GENO and Zinc association mapping (ZAM) panel_phenotypic data are two files with GBS and phenotypic data for zinc (Zn) from this population. From the ZAM panel, four inbred lines (two with high-Zn and two with low-Zn) were selected and used to form the bi-parental populations, namely DH population1 and DH population2. Genotypic and phenotypic data corresponding to these populations are DH populations1&2_255_LINES_GENO and DH population1_phenotypic data and DH population2_phenotypic data

Dataset

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

2018 CIMMYT Maize Latin America Product Announcement for Product Profile LA-PP1C / Anuncio de Productos de Maíz de CIMMYT en Latinoamérica por el Perfíl de Productos LA-PP1C

Felix San Vicente Garcia Thanda Dhliwayo Alberto Antonio Chassaigne Ricciulli natalia palacios rojas Michael Olsen Aparna Das Prasanna Boddupalli (2022)

New and improved maize hybrids, developed by the CIMMYT Global Maize Program, are available for uptake by public and private sector partners, especially those interested in marketing or disseminating hybrid maize seed across Latin America and similar agro-ecological zones. Following a rigorous trialing and a stage-gate advancement process culminating in the 2018 Stage 5 trials, CIMMYT advanced a total of two new elite maize hybrids in Latin America in 2018. These are yellow maize hybrids adapted for the tropical lowlands (Product Profile LA-PP1C). Phenotypic data collected in Stage 4 and Stage 5 trials for the two selected hybrids as well as information about the trial sites are provided in this dataset. These trials were conducted through a network of partners, including NARS and private seed companies, in Latin America under various management and environmental conditions. Nuevos y mejorados híbridos desarrollados por el Programa Global de Maíz del CIMMYT se ponen a disposición de instituciones del sector público y privado, especialmente para aquellas instituciones colaboradoras interesadas en la comercialización y diseminación de semilla de maíz en Latinoamérica o en zonas agroecológicas similares. Después de un riguroso proceso de evaluación de germoplasma en distintas etapas que culminó en ensayos de evaluación de híbridos en etapa cinco, el CIMMYT avanzó dos nuevos híbridos élite en Latinoamérica en 2018. Esos son hibrídos de maíz amarillo adaptados por las tierras bajas tropicales (Perfíl de Producto LA-PP1C). Datos fenotípicos recopilados en los ensayos en etapa cuatro y cinco, además de información sobre los sitios están incluidos en este conjunto de datos. Estos ensayos fueron conducidos bajo diferentes condiciones de manejo y ambientes a través de redes colaborativas con instituciones de investigación pública y empresas semilleras de Latinoamérica.

Dataset

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

2021 CIMMYT Maize Latin America Product Announcement / Anuncio de Productos de Maíz de CIMMYT en Latinoamérica

Felix San Vicente Garcia Alberto Antonio Chassaigne Ricciulli Thanda Dhliwayo natalia palacios rojas XUECAI ZHANG Michael Olsen Aparna Das Prasanna Boddupalli (2021)

New and improved maize hybrids, developed by the CIMMYT Global Maize Program, are available for uptake by public and private sector partners, especially those interested in marketing or disseminating hybrid maize seed across Latin America and similar agro-ecological zones. Following a rigorous trialing and a stage-gate advancement process culminating in the 2020 Stage 5 trials, CIMMYT advanced a total of two new elite maize hybrids in Latin America in 2021. Phenotypic data collected in Stage 4 and Stage 5 trials for the two selected hybrids as well as information about the trial sites are provided in this dataset. These trials were conducted through a network of partners, including NARS and private seed companies, in Latin America under various management and environmental conditions. Nuevos y mejorados híbridos desarrollados por el Programa Global de Maíz del CIMMYT se ponen a disposición de instituciones del sector público y privado, especialmente para aquellas instituciones colaboradoras interesadas en la comercialización y diseminación de semilla de maíz en Latinoamérica o en zonas agroecológicas similares. Después de un riguroso proceso de evaluación de germoplasma en distintas etapas que culminó en ensayos de evaluación de híbridos en etapa cinco, el CIMMYT avanzó dos nuevos híbridos élite en Latinoamérica en 2021. Datos fenotípicos recopilados en los ensayos en etapa cuatro y cinco, además de información sobre los sitios están incluidos en este conjunto de datos. Estos ensayos fueron conducidos bajo diferentes condiciones de manejo y ambientes a través de redes colaborativas con instituciones de investigación pública y empresas semilleras de Latinoamérica.

Dataset

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

2022 CIMMYT Maize Latin America Product Announcement for Product Profile LA-PP1 / Anuncio de Productos de Maíz de CIMMYT en Latinoamérica por el Perfíl de Productos LA-PP1

Felix San Vicente Garcia Alberto Antonio Chassaigne Ricciulli Thanda Dhliwayo natalia palacios rojas XUECAI ZHANG Michael Olsen Aparna Das Prasanna Boddupalli (2022)

New and improved maize hybrids, developed by the CIMMYT Global Maize Program, are available for uptake by public and private sector partners, especially those interested in marketing or disseminating hybrid maize seed across Latin America and similar agro-ecological zones. Following a rigorous trialing and a stage-gate advancement process culminating in the 2020 Stage 5 trials, CIMMYT advanced a total of four new elite maize hybrids in Latin America in 2022 for Product Profile LA-PP1. These are yellow and white maize hybrids adapted for the tropical lowlands. Phenotypic data collected in Stage 4 and Stage 5 trials for the four selected hybrids as well as information about the trial sites are provided in this dataset. These trials were conducted through a network of partners, including NARS and private seed companies, in Latin America under various management and environmental conditions. Nuevos y mejorados híbridos desarrollados por el Programa Global de Maíz del CIMMYT se ponen a disposición de instituciones del sector público y privado, especialmente para aquellas instituciones colaboradoras interesadas en la comercialización y diseminación de semilla de maíz en Latinoamérica o en zonas agroecológicas similares. Después de un riguroso proceso de evaluación de germoplasma en distintas etapas que culminó en ensayos de evaluación de híbridos en etapa cinco, el CIMMYT avanzó cuatro nuevos híbridos élite en Latinoamérica en 2022 por el Perfíl de Producto LA-PP1. Estos son híbridos amarillos y blancos adaptados a las tierras bajas tropicales. Datos fenotípicos recopilados en los ensayos en etapa cuatro y cinco por los cuatro hibridos avanzados, además de información sobre los sitios están incluidos en este conjunto de datos. Estos ensayos fueron conducidos bajo diferentes condiciones de manejo y ambientes a través de redes colaborativas con instituciones de investigación pública y empresas semilleras de Latinoamérica.

Dataset

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

2022 CIMMYT Maize Latin America Product Announcement for Product Profile LA-PP2B / Anuncio de Productos de Maíz de CIMMYT en Latinoamérica por el Perfíl de Productos LA-PP2B

Thanda Dhliwayo Felix San Vicente Garcia Alberto Antonio Chassaigne Ricciulli natalia palacios rojas XUECAI ZHANG Michael Olsen Aparna Das Prasanna Boddupalli (2022)

New and improved maize hybrids, developed by the CIMMYT Global Maize Program, are available for uptake by public and private sector partners, especially those interested in marketing or disseminating hybrid maize seed across Latin America and similar agro-ecological zones. Following a rigorous trialing and a stage-gate advancement process culminating in the 2020 Stage 5 trials, CIMMYT advanced a total of one new elite maize hybrid in Latin America in 2022 for product profile LA-PP2B. Phenotypic data collected in Stage 4 and Stage 5 trials for the selected hybrid as well as information about the trial sites are provided in this dataset. These trials were conducted through a network of partners, including NARS and private seed companies, in Mexico under various management and environmental conditions. Nuevos y mejorados híbridos desarrollados por el Programa Global de Maíz del CIMMYT se ponen a disposición de instituciones del sector público y privado, especialmente para aquellas instituciones colaboradoras interesadas en la comercialización y diseminación de semilla de maíz en Latinoamérica o en zonas agroecológicas similares. Después de un riguroso proceso de evaluación de germoplasma en distintas etapas que culminó en ensayos de evaluación de híbridos en etapa cinco, el CIMMYT avanzó un nuevo híbrido élite en Latinoamérica en 2022 por el perfíl de producto LA-PP2B. Datos fenotípicos recopilados en los ensayos en etapa cuatro y cinco, además de información sobre los sitios están incluidos en este conjunto de datos. Estos ensayos fueron conducidos bajo diferentes condiciones de manejo y ambientes a través de redes colaborativas con instituciones de investigación pública y empresas semilleras de Latinoamérica.

Dataset

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA