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Talla de madurez de almeja de sifón Panopea globosa en la parte central del Golfo de California

Size at maturity of the Cortes geoduck Panopea globosa in Central Gulf of California

EUGENIO ALBERTO ARAGON NORIEGA (2015)

Se describe la talla de madurez de almeja de sifón Panopea globosa, la cual habita en la parte central Golfo de California. El objetivo del estudio fue conocer la talla a la cual el 50% de la población se encuentra madura. La justificación es que este valor se desconoce, no sólo de esta especie en particular, sino en general de otros congéneres este conocimiento es escaso. Otra justificación es que la talla mínima legal en la pesquería mexicana, la cual es de 130 mm de longitud de concha (LC), fue emitida desconociendo aspectos biológicos claves de la especie en México. Las almejas fueron recolectadas a profundidades de 20 m a 25 m, durante enero de 2014 en Bahía Guaymas-Empalme, Sonora. Para obtener el valor de talla de madurez se utilizó un modelo logístico ajustado con el criterio de máxima verosimilitud. El 50% de la población estaba madura, y la talla fue de 91.906 mm de LC para hembras y 91.909 mm de LC para machos. Sin embargo, el análisis de los residuales de suma de cuadrados mostró que ambos sexos no son significativamente diferentes (F0.284; p < 0.7547). Se ha demostrado con este estudio que el tamaño mínimo legal de 130 mm es más grande de lo necesario. Dato importante en tanto la talla de madurez se toma como requisito de restricción en la pesca de esta especie.

This paper describes the size at maturity of the Cortés geoduck Panopea globosa in the central Gulf of California. The objective of this study was to determine the size at which 50% of the population is mature. The justification is that this value is still unknown not only of this particular species, but in general, for other species of the genus such knowledge is scarce. Another justification for the study is that the minimum legal size in Mexican Cortes geoduck fishery, which is 130 mm in shell length (SL), was determined ignoring key biologi-cal aspects of the species in Mexico. Mexican geoducks were collected sub-tidal, 20 m to 25 m depth in Bahía Guaymas-Empalme, Sonora located in the Central Gulf of California in January 2014. A logistic model was used fit with the maximum likelihood criterion to get the size value at 50% maturity, which was 91.906 mm SL and 90.909 mm SL, female and male respectively. The analyses of the residual sum of squares showed both curves were not significantly different (F0.284; p < 0.7547), demonstrating that the 130 mm legal size is larger than necessary if the size at maturity was the constraining requirement.

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BIOLOGÍA Y QUÍMICA Almeja de sifón Golfo de California Panopea globosa Talla de madurez Talla mínima legal Cortes geoduck Gulf of California Minimum legal size Size at maturity

Distribución potencial de almeja de sifón Panopea globosa del Golfo de California en un escenario de cambio climático

Potential distribution of Geoduck clam Panopea globosa of the Gulf of California in a climate change Model

EUGENIO ALBERTO ARAGON NORIEGA SERGIO GUSTAVO CASTILLO VARGASMACHUCA Jesús Trinidad Ponce Palafox ROLANDO CRUZ VASQUEZ GUILLERMO RODRIGUEZ DOMINGUEZ (2017)

El cambio climático ha roto el equilibrio natural y se ha modificado el estado de salud de las diferentes especies comerciales como la almeja de sifón. Por lo tanto, el objetivo del presente estudio fue pronosticar la distribución de almeja de sifón Panopea globosa del Golfo de California en el año 2050 ante un escenario de cambio climático. Se usó el modelo de máxima entropía (MaxEnt) utilizando 12 variables ambientales que afectan la distribución desde el punto de vista térmico, químico y biológico. El modelo de MaxEnt predijo el hábitat potencial adecuado para P. globosa con altas tasas de éxito (AUC = 0.995). El hábitat más favorable de P. globosa se encuentra en Guaymas, Sonora, debido a la surgencia de nutrientes que benefician la producción de clorofila-a. Para el año 2050, el modelo MaxEnt pronosticó que en Sonora se presentará una reducción hacia la costa sur. En Santa Rosalía e Isla San Marcos, Baja California Sur, las probabilidades disminuyen de 0.70 a 0.04. Los actuales sitios de captura se notarán alterados con posibles afectaciones sociales y económicas en las comunidades litorales. La conclusión es que el estudio resulta importante para la administración de recursos pesqueros, ya que en un escenario de cambio climático los sitios de captura pueden modificarse.

Climate change has broken the natural equilibrium and has modified the state of health of different commercial species such as the geoduck clam. Therefore, the objective of the present study was to predict the distribution of the geoduck clam Panopea globosa of the

Gulf of California to the year 2050 using a climate change model. We applied the maximum entropy model (MaxEnt), which considered 12 environmental variables that affect thermal, chemical, and biological distribution. The MaxEnt model predicted the potential habitat

suitable for P. globosa with high success rates (Area Under the Curve [AUC] = 0.995). The most favorable habitat of P. globosa is located of Guaymas, Sonora, mainly due to the upwelling of nutrients that promotes the production of chlorophyll-a. In the year 2050, Max-Ent forecasted southward reduction towards the south coast of Sonora, of Santa Rosalía and San Marcos Island in Baja California Sur the presence probability decreased from 0.70 to 0.04. Current clam harvesting sites were observed to have been altered by the social and economic conditions of coastal communities. We conclude that this study is important for fisheries resource management purposes because the fisheries harvesting sites could be affected by climate change.

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Almeja de Sifón Geoduck clam CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA Cambio climático Golfo de California Modelo de máxima entropía Panopea globosa Pesca Variables ambientales Climate change Environmental variability Gulf of California Maximum entropy model Fishery

Variabilidad genética de la almeja de sifón Panopea globosa (Dall, 1898) en el Noroeste de México

LAURA IZASCUM PEREZ VALENCIA (2011)

The geoduck clam Panopea globosa is a sessile bivalve, whose distribution covers the Gulf of California to Bahia Magdalena. Due to its high profitability, fishery began in 2002, even without extensive knowledge about its biology. To establish an adequate management plan for the species, it is necessary to know whether we are dealing with a single population or several of them. With the goal of knowing the population genetic structure, specific microsatellite markers were identified, through the construction of 5 enriched genomic libraries. 36 pairs of primers were designed and only two yielded polymorphic markers. Samples from 3 location in the Gulf of California [San Felipe (SF), Puerto Peñasco (PP), Guaymas (GU)] and one from the Pacific [Bahia Magdalena (BM)] were analyzed. We estimated the genetic variability expressed in number of alleles (nA), number of effective alleles (ne), observed heterozygosity (Ho), expected heterozygosity (He), allelic richness (AR) and inbreeding coefficient (FIS). Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) and linkage disequilibrium were tested as well. To detect population genetic structure FST paired values were calculated and three Analysis Molecular of Variance, AMOVA (Gulf of California vs Pacific PP-SF vs BM-GU, PP-SF vs GU vs BM). We found moderate levels of genetic variability (nA = 13.37, ne = 7.48, AR = 11.31, Ho = 0.71, He = 0.87, FIS = 0.26). Linkage disequilibrium was not observed. Deviation to HWE was observed due to heterozygote deficiencies, caused by null alleles in most locations. Significant genetic differences were observed between BM and the two localities of the Upper Gulf, SF and PP (FST = 0.018, FST = 0.036, respectively). None of the comparisons between the groups formed for the AMOVA showed any significant F value, however BM has a tendency to be a different location from the rest [...]

La almeja de sifón Panopea globosa es un bivalvo sésil, cuya distribución abarca el Golfo de California hasta Bahía Magdalena. Debido a su alta rentabilidad, su pesca inició el año 2002, aún sin tener un conocimiento amplio sobre su biología. Para establecer un plan de manejo adecuado para la especie, es necesario saber si estamos tratando con una sola población o bien con varias de ellas. Con el objetivo de conocer los niveles actuales de diversidad genética y determinar si existe estructura genética poblacional se realizó un análisis basado en microsatélites. Primeramente se identificaron marcadores microsatélite específicos para la especie, mediante la construcción de 5 librerías genómicas enriquecidas, de las cuales se diseñaron 36 pares de cebadores obteniéndose dos marcadores polimórficos útiles. Se analizaron organismo colectados en 3 localidades del Golfo de California [San Felipe (SF), Puerto Peñasco (PP), Guaymas (GU)] y una localidad de la costa occidental de la península de Baja California Sur [Bahía Magdalena (BM)] . Se estimó la variabilidad genética expresada en, número de alelos (nA), número de alelos efectivos (ne), heterocigosidad observada (Ho), heterocigosidad esperada (He), riqueza alélica (AR) y coeficiente de endogamia (FIS). Se realizaron pruebas de Equilibrio de Hardy-Weinberg (EHW) y desequilibrio de ligamiento. Para detectar estructura genética poblacional se calcularon los valores pareados de FST y 3 Análisis Moleculares de Varianza, (AMOVA) con las siguientes jerarquías: Golfo de California vs Pacífico; PP-SF vs BM-GU y PP-SF vs BM vs GU. Se encontraron niveles moderados de variabilidad genética (nA=13.37, ne= 7.48, AR= 11.31, Ho=0.71, He= 0.87, FIS= 0.26). No se observó desequilibrio por ligamiento. No se observó EHW en la mayoría de las localidades, debido a déficit de heterocigotos, causado por alelos nulos. Se observaron diferencias genéticas significativas entre BM y las dos localidades del Alto Golfo, SF y PP (FST= 0.018, FST= 0.036, respectivamente). Ninguna de las comparaciones entre los grupos formados para el AMOVA mostró algún valor significativo, sin embargo BM, tiene una tendencia a ser una localidad distinta del resto [...]

Master thesis

Panopea globosa; genetic variability; genetic structure; microsatellites BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA GENÉTICA GENÉTICA DE POBLACIONES GENÉTICA DE POBLACIONES

Ecología, biología y pesquería de almeja de sifón Panopea globosa en la región central del Golfo de California

GUSTAVO CORTEZ LUCERO (2013)

Este estudio describe y delimita diez bancos susceptibles de ser aprovechados en la captura de almeja de sifón Panopea globosa en la parte central del Golfo de California. Se comparó la densidad entre bancos y la estructura de pesos y tallas en cada uno de ellos. Se determinó los parámetros de crecimiento de la especie y la talla de primera madurez. El estudio fue motivado porque el conocimiento biológico de esta especie es muy limitado en México. Para determinar la distribución y densidad de la almeja de sifón se realizaron muestreos en una red de estaciones rectangulares desde Bahía San Carlos hasta Bahía de Lobos. Las extracciones se hicieron por buceo semiautónomo y con ayuda de embarcaciones menores de 7m de eslora. En el presente estudio se recolectaron un total de 10,114 organismos con un peso promedio de 997±212g, resaltando que del total de organismos pesados el 80% estuvo por encima de los 800g. En cuanto a longitud se refiere el promedio fue de 132±12.5mm, con el 80% de los organismos por encima de la talla mínima legal (130mm) que sugiere el plan de manejo vigente de almeja generosa. La edad fue determinada mediante el método de "piel de acetato". El crecimiento se determinó utilizando un enfoque múlti-modelo. Los parámetros de crecimiento individual fueron estimados por medio de cinco modelos: Von Bertalanffy, Logístico, Gompertz, Schnute y Schnute-Richards. Los parámetros en cada uno de los modelos y su intervalo de confianza fueron calculados por el método de máxima verosimilitud. El modelo que mejor se ajustó a los datos de longitud-edad fue seleccionado utilizando el criterio de información de Akaike AIC (siglas en inglés). Según el AIC el modelo logístico de crecimiento describe mejor el crecimiento de P. globosa en esta región. Se encontró que la longitud asintótica de la especie en estudio fue de 123.72 mm (95% CI, 116.3, 128.1) promediando la longitud asintótica estimada con los cinco modelos. La talla de primera madurez que se alcanza a los 94 mm de longitud de concha. Se concluye que la almeja de sifón en la parte central del Golfo de California es una población recientemente asentada. Además, el uso de una talla mínima legal de captura con base en la longitud de concha de 130 mm de almejas de sifón, parece ser inadecuado para la especie presente en esta área [...]

This study describes and locates ten beds of geoducks Panopea globosa in central Gulf of California GCC suitable to be exploited. The density and size and weights structure of the geoducks were compared between beds. Individual’s growth parameters and size at first maturity was also established. This study was carry-out mainly because scares biological know of this species in Mexico. In order to determine distribution and density a rectangular network of stations in the GCC were sampled out. The extractions were done semiautonomous diving and using boats under 7m in length. In the present study we collected a total of 10,114 organisms with an average weight of 997 ± 212 g, noting that the total number of organisms was 80% above 800g. As regards the average length was 138 ± 12.5mm, stressing that 80% was above the minimum legal size (130mm), which suggests the current management plan for the geoduck. Age was established using “acetate peel” method. Individuals growth was estimate by means of five models; von Bertalanffy, Logistic, Gompertz, Schnute and Schnute-Richards. The parameters in each models and their confidence interval were computed by maximum likelihood method. The best fitted model was selected using Akaike´s information criterion AIC. According to the AIC the Logistic growth model better describes the growth of P. globosa in this region. The asymptotic length of the shell in cortes geoduck clam Panopea globosa off Guaymas (located in the central Gulf of California) was 123.72mm (95%confiden interval, 116.3- 128.1) mm by averaging the asymptotic length estimated in five candidates models. Size at first maturity was fond to be 94 mm shell length. The conclusion is that geoduck population in CGC is a recent settled population. In addition the use of a minimum legal size of 130 mm shell length is not an effective management strategy for geoduck clams in this area [...]

Doctoral thesis

Panopea globosa; ciclo biológico; Golfo de California BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA ANIMAL (ZOOLOGÍA) DESARROLLO ANIMAL

JOINT LIKELIHOOD FUNCTION BASED ON MULTINOMIAL AND NORMAL DISTRIBUTIONS FOR ANALYZING THE PHENOTYPIC GROWTH VARIABILITY OF GEODUCK CLAM PANOPEA GLOBOSA

MARLENE ANAID LUQUIN COVARRUBIAS ENRIQUE MORALES BOJORQUEZ SERGIO SCARRY GONZALEZ PELAEZ Daniel Bernardo Lluch Cota (2016)

"In age and growth studies the individual variability is recognized as a source of bias, if it is not taken into account in the analyses it can lead to overestimates or subestimates of the mean length at age of a cohort. In this study, a new approach for analyzing individual shell length-at-age variability was developed for Panopea globosa using a joint negative log-likelihood where both shell length frequency distributions (0.105–7.04 mm) and shell length–at-age (100–187 mm) data sets were combined. Six candidate growth models were analyzed that included assumptions about the variance for each age in the population, and the best growth model was selected using a multimodel inference approach. Growth modeling including phenotypic growth variability showed that estimates of to were better than those computed from conventional growth models. We found that the Johnson model was the best candidate growth model for fitting both data sets."

Article

GEODUCK CLAM, PANOPEA GLOBOSA, GROWTH VARIABILITY BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA ANIMAL (ZOOLOGÍA) CRECIMIENTO ANIMAL CRECIMIENTO ANIMAL

Ciclo reproductivo de la almeja de sifón Panopea globosa en la playa del sol, Empalme, Sonora, México

Edna María Arambula Pujol (2006)

"La almeja de sifón Panopea globosa es una especie nativa de México que posee un alto potencial económico, de la cual no existen reportes relacionados a su distribución y su biología en los litorales mexicanos, desconociendo las bases biológicas que permitan su aprovechamiento. Derivada de una prospección realizada por el Centro Regional de Investigaciones Pesqueras en el litoral de Empalme, Sonora fueron localizadas poblaciones naturales en las costas de Sonora, lo cual está permitiendo realizar diversos estudios sobre su biología, ecología y potencial pesquero. En el presente estudio se muestran los resultados de un trabajo sobre el ciclo reproductivo de la almeja de sifón Panopea globosa, en el litoral de Empalme, Sonora, incluyendo la apariencia externa de las gónadas y la determinación del ciclo reproductivo usando técnicas histológicas. Las características macroscópicas externas de la masa gonadal no presentaron diferencias entre machos y hembras. Sin embargo, las diferencias entre sexos sólo se aprecian a nivel microscópico en los cortes histológicos del tejido gonádico. Se definieron cinco estadios gametogénicos: inmaduro = 0, actividad temprana = 1, actividad tardía = 2, maduro = 3, parcialmente desovado = 4 y vacío = 5. En invierno se presentan los estadios 1, en primavera el estadio 2 y en verano el estadio 3 con el posterior desove. Estos resultados indican que el ciclo reproductivo encontrado en P. globosa, es similar a lo reportado en otras especies del mismo género como P. abrupta en Puget Sound entre los límites de Seattle, EE.UU. y Vancouver, Canadá, y en P. zelandica en Nueva Zelanda."

"The Geoduck clam Panopea globosa is a native species of Mexico that possesses a high economic potential. Reports with respect to their distribution in the Mexican coast and their biology do not exist. Therefore, its biological basis that permits their use is not known. Recently, natural populations in the coast of Sonora have been located, which has permitted to carry out diverse studies on their biology, ecology and fishing potential. In the present study, the advances of a work on the reproductive biology of the Geoduck clam Panopea globosa, in the coast of Empalme-Sonora are shown, including its external appearance of the gonads, the determination of its reproductive cycle, and its fertility using histological techniques. The external macroscopic characteristics of the mass gonadal did not present differences between male and female. Nevertheless, the differences among sexes only are appreciated at the microscopic level in the histological slides of the gonadal tissue. Five stages of gametogenesis were defined: immature = 0, early activity = 1, late activity = 2, ripe = 3, partly spent = 4 and spent = 5. Stage 1 is presented in winter, stage 2 in spring, and stage 3 in summer, with the subsequent spawning. These results indicate that the reproductive cycle found up to now in P. globosa, is similar to that reported in other species of the same kind as P. abrupt in Puget Sound, which is located among the limits of Seattle, United States and Vancouver, Canada, and in P. zelandica in New Zealand."

Master thesis

Panopea globosa, ciclo reproductivo, Golfo de California BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA ANIMAL (ZOOLOGÍA) DESARROLLO ANIMAL DESARROLLO ANIMAL

DETERMINACIÓN DE BIOMASA Y BANCOS DE LA ALMEJA DE SIFÓN Panopea globosa (Dall, 1898) EN UNA ZONA VIRGEN DEL ALTO GOLFO DE CALIFORNIA

ASSESSING BIOMASS AND BEDS OF CORTES GEODUCK Panopea globosa (Dall , 1898) IN A VIRGIN AREA OF THE UPPER GULF OF CALIFORNIA

DETERMINAÇÃO DE BIOMASSA E BANCOS DE MEXILHÃO Panopea globosa (Dall , 1898) EM UMA ZONA VIRGEM DO ALTO GOLFO DE CALIFÓRNIA

EUGENIO ALBERTO ARAGON NORIEGA Sergio Alejandro Pérez Valencia (2012)

"En este trabajo se describe cómo determinar bancos de la almeja de sifón Panopea globosa (Dall 1898) para una población de la parte alta del Golfo de California mediante la combinación de conocimiento tradicional de los pescadores y el uso de tecnología de posición geográfica satelital. La presencia de almejas de sifón fue evaluada mensualmente durante un periodo anual del 01/11/2008 al 02/11/2009. La zona era un área virgen para la pesca de esa especie y fue posible establecer el contorno de un banco de la almeja. Por otro lado, la biomasa virgen del banco fue evaluada por medio de un modelo estructurado por tallas para poder emitir una cuota de captura basada en la explotación del 1% anual para el aprovechamiento en un horizonte de 50 años. La administración de la pesquería en estos términos puede garantizar que uno de los sectores más vulnerable de la sociedad (los pescadores) tenga empleo y que disminuya la presión sobre otros recursos pesqueros que por cambio de sus técnicas de pesca impactan en organismos con importancia para la conservación como es la vaquita marina (Phocoena sinus). "

"This study describes a scheme to determine Cortes geoduck (Panopea globosa Dall, 1898) beds for a population of the upper Gulf of California through the combination of traditional fishermen knowledge and the use of satellite position technology. The presence of Cortes geoduck was assessed monthly during an annual period, from 11/01/2008 to 11/02/2009. The area was a virgin area for Cortes geoduck fishing and it was possible to establish the shape of a bed for this clam. On the other hand, the virgin biomass in the bed was assessed using a size structured model in order to setup a capture quota based on the exploitation of 1% per year for the use in a 50 year horizon. This term established in the administration of fisheries can ensure that the more vulnerable sector of society (fishermen) has employment and also decrease the pressure on other fisheries resources which, by their changing fishing techniques, impact negatively on species with a conservation status such as Phocoena sinus (‘vaquita marina’). "

"Neste trabalho se descreve como determinar bancos de mexilhão Panopea globosa (Dall 1898) para uma população da parte alta do Golfo de Califórnia mediante a combinação de conhecimento tradicional dos pescadores e o uso de tecnología de posição geográfica por satélite. A presença dos mexilhões foi avaliada mensalmente durante um período anual de 01/11/2008 a 02/11/2009. A zona era uma área virgem para a pesca dessa espécie e foi possível estabelecer o contorno de um banco do mexilhão. Por outro lado, a biomassa virgem do banco foi ava liada por meio de um modelo estruturado por tamanhos para poder emitir uma cota de captura baseada na exploração de 1% anual para o aproveitamento em um horizonte de 50 anos. A administração da pescaria nestes termos pode garantir que um dos sectores mais vulneráveis da sociedade (os pescadores) tenha emprego e que diminua a pressão sobre outros recursos pesqueiros que por mudança de suas técnicas de pesca impactam em organismos com importância para a conservação como é o golfinho “a vaquita” (Phocoena sinus)."

Article

Almeja de Sifón, Biomasa, Golfo de California, Panopea globosa CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS PECES Y FAUNA SILVESTRE DINÁMICA DE LAS POBLACIONES DINÁMICA DE LAS POBLACIONES

Función de verosimilitud conjunta basada en distribuciones de probabilidad normal y multinomial para analizar la variabilidad fenotípica en el crecimiento de almeja de sifón Panopea globosa.

MARLENE ANAID LUQUIN COVARRUBIAS (2016)

La variabilidad individual en el crecimiento ha sido una característica común en diferentes especies del género Panopea, si este aspecto no es considerado en el análisis de crecimiento puede conducir a sobreestimaciones o subestimaciones de los parámetros y trayectorias teóricas. Sin embargo, los métodos usados tradicionalmente para modelar el crecimiento individual no han sido efectivos en identificar la variabilidad dentro de la composición de longitud de concha a la edad. Bajo este contexto, en estudios de edad y crecimiento es importante analizar dos hipótesis: si la variabilidad en la longitud de concha a la edad disminuye con el tiempo o la edad el fenómeno es conocido como crecimiento compensatorio; por el contrario, si la variabilidad incrementa con la edad, se denomina crecimiento depensatorio. En el presente estudio, un nuevo enfoque para analizar la variabilidad fenotípica individual en el crecimiento de Panopea globosa fue desarrollado, suponiendo que un efecto depensatorio influye sobre la población de Bahía Magdalena. El análisis incorporó datos de distribución de frecuencias de longitud de estadios tempranos y datos de longitud de concha a la edad de individuos adultos, mediante una función negativa de verosimilitud conjunta. Ambos tipos de datos fueron ajustados a seis modelos de crecimiento candidatos: von Bertalanffy, Gompertz, Johnson, Logístico, generalizado de von Bertalanffy y Richards, los cuales incluyeron una estimación de varianza para cada edad observada en la población. El mejor modelo de crecimiento candidato fue seleccionado usando una corrección del criterio de información Akaike (AICc) para muestras pequeñas. La modelación de crecimiento incorporando dos tipos de datos mostró mejores estimaciones del parámetro t0 y mayor exactitud en el ajuste de las trayectorias de crecimiento al origen (edad 0) en comparación con los métodos convencionales. Los modelos de crecimiento candidatos incluyendo varianza a la edad evidenciaron un patrón de crecimiento depensatorio, sus trayectorias fueron similares, con excepción del modelo de von Bertalanffy que exhibió una mayor variabilidad, demostrando no ser el más adecuado para representar a la población de Bahía Magdalena. El AICc indicó que el modelo de crecimiento de Johnson fue el más adecuado para describir ambos tipos de datos.

Individual growth variability has been a common feature within different Panopea species; if this aspect is not incorporate in the growth analysis it can lead to overestimates and underestimates of the parameters and theoretical trajectories. However, the methods used traditionally to modeling the individual growth have not been effective for identified the variability within of the shell length at age composition. Thus, for age and growth studies, is important analyze two hypotheses: if the length-at-age variability decreases with time or age the phenomena is known as growth compensation, in contrast if length-at-age variability increases with age it is called growth depensation. In this study, a new approach to analyze the individual phenotypic variability in growth of Panopea globosa was development, assuming that a depensation effect influeces in the population of Bahia Magdalena. The analysis incorporated shell length frequency distribution of early stages and shell length-at-age for adult individuals data, through a joint negative log likelihood function. Both data sets were fitted to six candidate growth models: von Bertalanffy, Gompertz, Johnson, Logistic, Generalize von Bertalanffy and Richards, they incorporated an estimation of variance for each age observed in the population. The best candidate growth model was selected using a corrected Akaike information criterion (AICc) for small samples. Growth modeling incorporating two data sets showed better estimates of t0 parameter and higher accuracy for fit the growth trajectories to origin (age zero) in contrast to conventional methods. Candidate growth models including variance-at-age, showed a growth depensation pattern, their trajectories were similar except von Bertalanffy growth model that exhibited greater variability, showing not be the most suitable to represent the population from Bahia Magdalena. The AICc indicated that the Johnson growth model was the most suitable to describe both data set.

Master thesis

crecimiento depensatorio; Bahía Magdalena; AICc; Panopea globosa BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA ANIMAL (ZOOLOGÍA) ZOOLOGÍA MARINA

Teoría de la información, inferencia multimodelos y fuente de datos para modelar el crecimiento individual de almeja de sifón Panopea globosa

Information theory, multi-model inference and source data to model individual growth of Cortes Geoduck Panopea globosa

EUGENIO ALBERTO ARAGON NORIEGA ROLANDO CRUZ VASQUEZ GUILLERMO RODRIGUEZ DOMINGUEZ Edgar Alcántara Razo (2014)

"Este trabajo describe el crecimiento de la almeja de sifón Panopea globosa en el Golfo de California, utilizando un enfoque multimodelo. Para ajustar los modelos se usaron datos totales y datos promedio de longitud a cada edad. Los parámetros de crecimiento individual fueron estimados por medio de cuatro modelos: von Bertalanffy, Logístico, Gompertz y Schnute. Los parámetros en cada uno de los modelos y su intervalo de confianza fueron calculados por el método de máxima verosimilitud. El modelo que mejor se ajustó a los datos de longitud-edad fue seleccionado utilizando el criterio de información de Akaike (aic, por sus siglas en inglés). Según el aic, el modelo logístico de crecimiento describe mejor el crecimiento de P. globosa en esta región. La longitud asintótica de la concha de la almeja de sifón P. globosa de Guaymas (localizada en la parte centro del Golfo de California) fue de 122.2 mm (95% ic, 116.3-128.1), al promediar los estimados de los cuatro modelos, en comparación con los datos promedio de los valores totales (114.98 mm, 95% ic, 112.91-117.04 mm). Se concluyó que el enfoque multimodelo y el uso de aic son la forma más sólida para evaluar parámetros de crecimiento, por lo menos en la especie objeto de estudio. También se sugiere utilizar datos crudos para posteriores análisis de crecimiento, en lugar de datos promedio."

"This paper describes the growth of Cortes Geoduck clam Panopea globosa in the Gulf of California using a multi-model approach. Total and average data of length at each age were used to fit the models. Individual’s growth parameters were estimated by four models: von Bertalanffy, Logistic, Gompertz and Schnute. The parameters in each model and their confidence interval were computed by using the maximum likelihood method. The best model fit was selected using Akaike’s information criterion (aic). According to the aic the best description of the growth of P. globosa in this region was the Logistic growth model. The asymptotic length of the shell of Cortes Geoduck clam P. globosa off Guaymas (located in the central Gulf of California) was 122.2 mm (95% ci, 116.3-128.1) after averaging the estimates of the four models, compared to the average of total values (114.98 mm, 95% ci, 112.91-117.04 mm). The conclusions are that the multi-model inference and aic are robust methods to evaluate growth parameters for the studied species. It is also recommended to use only the raw data instead of averaged data."

Article

Panopea globosa, Golfo de California, pesca, modelos de crecimiento Gulf of California, fishery, growth models BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA ANIMAL (ZOOLOGÍA) CRECIMIENTO ANIMAL CRECIMIENTO ANIMAL

Ciclo reproductivo de la almeja de sifón Panopea globosa en la Playa del Sol, Empalme, Sonora, México

Edna María Arambula Pujol (2006)

"La almeja de sifón Panopea globosa es una especie nativa de México que posee un alto potencial económico, de la cual no existen reportes relacionados a su distribución y su biología en los litorales mexicanos, desconociendo las bases biológicas que permitan su aprovechamiento. Derivada de una prospección realizada por el Centro Regional de Investigaciones Pesqueras en el litoral de Empalme, Sonora fueron localizadas poblaciones naturales en las costas de Sonora, lo cual está permitiendo realizar diversos estudios sobre su biología, ecología y potencial pesquero. En el presente estudio se muestran los resultados de un trabajo sobre el ciclo reproductivo de la almeja de sifón Panopea globosa, en el litoral de Empalme, Sonora, incluyendo la apariencia externa de las gónadas y la determinación del ciclo reproductivo usando técnicas histológicas. Las características macroscópicas externas de la masa gonadal no presentaron diferencias entre machos y hembras. Sin embargo, las diferencias entre sexos sólo se aprecian a nivel microscópico en los cortes histológicos del tejido gonádico. Se definieron cinco estadios gametogénicos: inmaduro = 0, actividad temprana = 1, actividad tardía = 2, maduro = 3, parcialmente desovado = 4 y vacío = 5. En invierno se presentan los estadios 1, en primavera el estadio 2 y en verano el estadio 3 con el posterior desove. Estos resultados indican que el ciclo reproductivo encontrado en P. globosa, es similar a lo reportado en otras especies del mismo género como P. abrupta en Puget Sound entre los límites de Seattle, EE.UU. y Vancouver, Canadá, y en P. zelandica en Nueva Zelanda."

"The Geoduck clam Panopea globosa is a native species of Mexico that possesses a high economic potential. Reports with respect to their distribution in the Mexican coast and their biology do not exist. Therefore, its biological basis that permits their use is not known. Recently, natural populations in the coast of Sonora have been located, which has permitted to carry out diverse studies on their biology, ecology and fishing potential. In the present study, the advances of a work on the reproductive biology of the Geoduck clam Panopea globosa, in the coast of Empalme-Sonora are shown, including its external appearance of the gonads, the determination of its reproductive cycle, and its fertility using histological techniques. The external macroscopic characteristics of the mass gonadal did not present differences between male and female. Nevertheless, the differences among sexes only are appreciated at the microscopic level in the histological slides of the gonadal tissue. Five stages of gametogenesis were defined: immature = 0, early activity = 1, late activity = 2, ripe = 3, partly spent = 4 and spent = 5. Stage 1 is presented in winter, stage 2 in spring, and stage 3 in summer, with the subsequent spawning. These results indicate that the reproductive cycle found up to now in P. globosa, is similar to that reported in other species of the same kind as P. abrupt in Puget Sound, which is located among the limits of Seattle, United States and Vancouver, Canada, and in P. zelandica in New Zealand."

Master thesis

Panopea globosa, ciclo reproductivo, Golfo de California reproductive cycle BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA ANIMAL (ZOOLOGÍA) FISIOLOGÍA ANIMAL FISIOLOGÍA ANIMAL