Autor: Cesar Petroli

Introduction to the DArTseq genotyping method and its data outputs

Cesar Petroli (2019)

This guide describes the DArTseq genotyping method, marker naming conventions, data output formats, data file column headers, and BLAST parameters used for aligning markers to a genome sequence.

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CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Introducción al método de genotipificación DArTseq y los datos obtenidos

Cesar Petroli (2019)

Esta guía describe de manera simple el método de genotipificación DArTseq, las convenciones de nomenclatura de los marcadores moleculares, los formatos de los datos obtenidos, los encabezados de las columna en los archivos de datos, y los parámetros y umbrales del BLAST utilizados para alinear los marcadores moleculares sobre la secuencia del genoma de referencia correspondiente.

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CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

DArTseq-derived SNPs for wheat Mexican landrace accessions

Carolina Sansaloni Cesar Petroli (2014)

More than 8000 Mexican wheat landrace accessions from the CIMMYT Germplasm Bank have been genotyped using the DArTseq technology.

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CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

DArTseq-derived SNPs for wheat Iranian landrace accessions

Carolina Sansaloni Cesar Petroli (2014)

More than 2000 Iranian wheat landrace accessions from the CIMMYT Germplasm Bank have been genotyped using the DArTSeq technology.

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CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Evaluation of maize pre-breeding materials under the Seeds of Discovery initiative in 2018

Jose Crossa Cesar Petroli Sarah Hearne (2021)

These data describe the evaluation of landrace-derived pre-breeding materials for biotic and abiotic stress resistance as well as for blue maize production in 2018. Populations of interest for drought stress during flowering time, heat stress during flowering time, Tar Spot tolerance, and blue maize production were evaluated for yield potential and response to the stresses with support from the MasAgro Biodiversidad project and the CGIAR Research Program on Maize.

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CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

CIMMYT Maize Line (CML) SNPs Generated Using DArTseq Genotyping

Sarah Hearne jiafa chen Cesar Petroli (2016)

This set of genotypic data was used for the analyses described in the paper: Chen J, Zavala C, Ortega N, Petroli C, Franco J, Burgueño J, et al. (2016) The Development of Quality Control Genotyping Approaches: A Case Study Using Elite Maize Lines. PLoS ONE 11(6): e0157236. doi:10.1371/journal.pone.0157236

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Taller: "Aprovechamiento De Los Atlas Moleculares De Maíz Y Trigo." Diciembre 2015

Carolina Sansaloni Cesar Petroli Jorge Franco Gordon Stephen Sebastian Raubach Sarah Hearne Kate Dreher (2015)

PROPÓSITO GENERAL DE APRENDIZAJE: Al finalizar el taller, los participantes serán capaces de utilizar los atlas moleculares de maíz y trigo para el estudio, conservac ión y aprovechamiento de la diversidad genética. A través de un taller se desarrollarán capacidades en los participantes para que aprovechen los atlas moleculares de maíz y trigo generados por el proyecto MasAgro-Biodiversidad; para lo cual se utilizará la exposición, demostraciones prácticas, análisis de casos y discusiones grupales. Se desarrollarán los siguientes ejes temáticos: 1. Fundamentos de la técnica de genotipificación por secuenciación (GbS) 2. An álisis de la diversidad genética para su conservación y aprovechamiento 3. Utilización de los atlas moleculares de maíz y trigo desarrollados por MasAgro - Biodiversidad

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