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Regulation of the slow vacuolar channel by luminal potassium: Role of surface charge

MANUEL MARTINEZ ESTEVEZ (2005)

Voltage-dependent activation of slow vacuolar (SV) channels has been studied on isolated patches from red beet (Beta vulgaris L.) vacuoles. Isoosmotic variation of vacuolar K+ from 10 to 400 mM in Ca 2+-free solutions at the vacuolar side shifted the SV channel activation threshold to more positive voltages. The effect of K+ could be mimicked by additions of choline or N-methyl D-glucamine and could be explained by unspecific screening of the negative surface charge. Fitting the dependence of voltage shift on K+ concentration to the Gouy-Chapman model yields a surface charge density of 0.36 ± 0.05 e -/nm2. Negative surface potential also tended to increase the local concentration of permeable ions (K+), resulting in anomalously high single-channel conductance, ∼200 pS in 10 mM KCl. An increase of ionic strength due to addition of impermeable cations greatly reduced the unitary conductance. Large positive shift of the SV channel voltage dependence, caused by physiological (0.5 mM) free vacuolar Ca2+, was partly ameliorated by increasing luminal K+. We interpreted these results as follows: K+ induced a reduction of surface potential, hence i) causing a positive shift of the voltage dependence and ii) a dilution of Ca2+ in the membrane vicinity, thus reducing the inhibitory effect of vacuolar Ca2+ and causing a negative shift of the SV channel voltage dependence, with a sum of the two shifts being negative.

Article

 CALCIUM PATCH CLAMP POTASSIUM SLOW VACUOLAR CHANNEL VACUOLE VOLTAGE GATING BIOLOGÍA Y QUÍMICA

Transferencia de embriones del ganado criollo lechero tropical

FERNANDO NARANJO CHACON (2014)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Agroecositemas Tropicales).- Colegio de Postgraduados, 2015.

La transferencia de embriones es una biotecnología para la mejora genética y la conservación de especies y razas bovinas en peligro de extinción. La raza bovina Criollo Lechero Tropical de México (CLT) está adaptada a los climas cálidos y tiene un programa de mejora genética, pero se desconoce el mejor método para la criopreservación de sus embriones. El objetivo de este estudio fue comparar dos métodos de criopreservación por curva lenta y vitrificación de embriones CLT, mediante la transferencia a vacas receptoras CLT puras y mestizas. El estudio se realizó en el Colegio de Posgraduados (CP) y en Olinalá Guerrero (OG). Los tratamientos se asignaron aleatoriamente a las receptoras de ambos genotipos, seis embriones para CLT y cuatro para mestizas por curva lenta, cinco en receptoras CLT y cinco en mestizas por vitrificación para CP, para OG cuatro embriones por curva lenta en receptoras CLT y cinco con mestizas, para embriones vitrificados seis en receptoras CLT y cinco en mestizas. Se realizó la prueba de ji-cuadrada para analizar los datos. No se encontró efecto del método de criopreservación en el porcentaje de gestación (p>0.05) y se obtuvieron 10 % (1/10) y 20 % (2/10) para CP y 11 % (1/9) y 27 % (3/11) en OG de gestación para curva lenta y vitrificación. Se requiere de otros estudios para determinar los factores que afectan el éxito de la transferencia de embriones CLT en vacas receptoras. _______________ EMBRYO TRANSFER OF THE TROPICAL MILKING CRIOLLO CATTLE. ABSTRACT: Embryo transfer is a biotechnology for the genetic improvement and conservation of livestock species and breeds in danger of extinction. The Tropical Milking Criollo (CLT) cattle breed in Mexico is adapted to warm climates and has a genetic improvement program, but the best method for the cryopreservation of embryos is unknown. The objective of this study was to compare two methods of CLT embryo cryopreservation, slow freezing and vitrification, prior to transfer to pure and crossbred recipient CLT cows from Colegio de Postgraduados (CP) and Olinalá Guerrero (OG), the two study sites. Treatments were randomly assigned to the receiving females of both genotypes. Six purebred and four crossbred embryos were assigned to slow freezing. Five crossbred and five purebred embryos were assigned to vitrification for CP, while four purebred OG and five crossbred embryos were assigned to slow freezing; for vitrified embryos, six were assigned to purebreds and five to crossbreds. A chi-square was used to analyze the data. No effect was found from cryopreservation method on pregnancy rate (p>0.05); 10 % and 20 % for CP and 11 % and 27 % for OG were obtained for slow freezing and vitrification, respectively. Further studies are required to determine the factors affecting the success of embryo transfer in recipient CLT cows.

Master thesis

Embriones Criollo Curva Lenta Vitrificación Embryos Slow Freezing Vitrification Agroecosistemas Tropicales Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS PRODUCCIÓN ANIMAL BOVINOS

Diseño y evaluación de microcápsulas de urea In Vitro para su uso en rumiantes

RAYMUNDO LIRA CASAS (2011)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Ganadería).- Colegio de Postgraduados, 2011.

Las nuevas líneas de investigación en nutrición de rumiantes están buscando diseñar productos con liberación prolongada de urea dentro del rumen. El objetivo de esta investigación fue desarrollar y evaluar microcápsulas que liberen urea en el líquido ruminal. Métodos: Las microcápsulas fueron preparadas por el método de emulsión y evaporación de solvente, como primer paso se preparo el acarreador poroso, después se preparo la fase orgánica con Eudragit RS 100 y por último se preparo la fase acuosa en donde fue agregada la fase orgánica. Las microcápsulas se identificaron mediante microscopia electrónica de barrido, determinando el tamaño y la morfología. Se evaluó la encapsulación de la urea, la flotabilidad de las microcápsulas y la liberación de N amoniacal en líquido ruminal. Resultados: Se encontraron diferencias significativas en el factor volumen de la fase acuosa en el nivel 50 mL (p< 0.05) y presento un efecto negativo en la encapsulación de la urea. La morfología de las microcápsulas fue mejor con el factor bajo de temperatura de la fase acuosa of 35 °C (p< 0.05), comparada con el nivel alto de 45°C. La flotabilidad de las microcápsulas fue arriba del 50% a las 12 h de agitación, mostrando diferencias significativas en el factor volumen de la fase orgánica de 20 mL (p< 0.05). Con las microcápsulas, la liberación de del N amoniacal incremento aun después de las 24 h en el líquido ruminal. El tratamiento con urea sin proteger después de una hora, la concentración de N amoniacal en líquido ruminal incremento rápidamente y entre las 12 y las 24 h declino la concentración. Conclusión: En la elaboración de las microcápsulas el volumen de la fase acuosa regula el porcentaje de encapsulación de la urea, debido a que es muy soluble en agua. El Eudragit RS 100 funcionó bien, encapsulando y manteniendo la lenta liberación de urea que se requiere en una digestión in vitro que simula las condiciones del rumen. _______________ DISIGNING AND EVALUATION OF UREA MICROCAPSULES In Vitro TO USE IN RUMINANTS. ABSTRACT: The new research lines in ruminant nutrition are working to design urea products of prolonged release within the rumen. The objective of this research was to develop and evaluate microcapsules that release urea in the rumen fluid. Methods: The microcapsules were prepared by the method of emulsion and solvent evaporation. First, the porous carrier was prepared; then the organic phase was prepared with Eudragit RS 100; and finally, the aqueous phase, in which the organic phase was added, was prepared. The microcapsules were identified through scanning electron microscopy, determining their size and morphology. Urea encapsulation, buoyancy of the microcapsules, and release of ammonia N in the rumen fluid were evaluated. Results: there were significant differences in the volume factor of the aqueous phase at 50 mL (p <0.05), and there was a negative effect on the encapsulation of the urea. The morphology of the microcapsules was better (p <0.05) with the low temperature factor of the aqueous phase at 35°C than with the high one, 45°C. The buoyancy of the microcapsules was above 50% at 12h of agitation, showing significant differences in the volume factor of the organic phase of 20 mL (p <0.05). With regard to the microcapsules, the release of ammonia N increased even after 24 h in the rumen fluid. In the treatment with unprotected urea after an hour, the concentration of ammonia N in rumen fluid increased rapidly, but between 12 and 24h the concentration declined. Conclusion: In the preparation of the microcapsules the volume of the aqueous phase regulates the percentage of urea encapsulation, because it is very soluble in water. Eudragit RS 100 worked well, encapsulating and maintaining the slow release of urea that is required for in vitro digestion simulating conditions in the rumen.

Master thesis

Urea Microcápsulas Lenta liberación Rumiante Microcapsules Slow release Ruminant Maestría Ganadería CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Relationship between the number of partial resistance genes and the response to leaf rust in wheat genotypes

JUAN GABRIEL RAMIREZ PIMENTEL Susanne Dreisigacker JULIO HUERTA-ESPINO (2018)

The adult plant resistance conferred by genes with an additive effect is an alternative to achieve durable resistance to leaf rust caused by the fungus Puccinia triticina in wheat (Triticum spp.) The objective of this study was to know the response to this disease in bread wheat genotypes that possess the partial resistance genes Lr34, Lr46, Lr67 and Lr68. The severity level of the disease was measured in 280 wheat genotypes in three locations. The presence or absence of partial resistance genes was determined by molecular markers for each gene in 245 wheat genotypes. The different combinations of adult plant genes resulted in the genotypes were classified into nine groups. In 77 of these genotypes, the markers were negative for these genes. The Lr34, Lr46, Lr67 and Lr68 genes were identified individually in 48, 48, 5, and 14 genotypes, respectively. The combination of two genes, Lr34+Lr46, Lr34+Lr68 and Lr46+Lr68, was determined in 18, 17, and 12 genotypes, respectively. Only in six genotypes the combination Lr34+Lr46+Lr68 was identified. The genotypes with the Lr34, Lr46, Lr67 and Lr68 genes in a unique form showed 21%, 24.8%, 21.9% and 21.8% of rust severity on average, respectively. An additive effect was observed in the combinations of two genes, and higher effect in the combinations that included the Lr34 gene since genotypes with this gene combination showed on average 11.4% of rust severity. The combination of three genes Lr34+Lr46+Lr68 provide greater protection in the genotypes with 9.7% of rust severity on average.

Article

Wheats Rusts Genotypes Adult Plant Resistance Severity Slow-Rusting AGRICULTURAL SCIENCES AND BIOTECHNOLOGY PHENOTYPE TRITICUM AESTIVUM CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Recreating intestinal peristalsis in the petri dish

ROSA ESPINOSA LUNA ALMA ROSA BARAJAS ESPINOSA Fernando Ochoa Cortés Carlos Barajas López (2017)

"Here we describe a culture technique of cells dissociated from the external muscularis of the guinea pig small intestine, which allows us to maintain all the elements involved in the intestinal peristaltic reflex. After a few days in culture, these cells reorganize to form a small group of cells that permit the generation of pacemaker activity, spontaneous contractions, and the development of inhibitory and excitatory junction potentials in the petri dish, all elements involved in the peristaltic reflex. Therefore, these co-cultures are suitable to study the cellular and molecular aspects related to the development, maintenance, and modulation of motor intestinal functions."

Article

Smooth muscle Neuromuscular junctions Gastrointestinal tract Small intestine Enteric nervous system Myenteric neurons Slow waves Inhibitory junction potentials Excitatory junction potentials BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOQUÍMICA BIOQUÍMICA

Códigos de verificación de paridad de baja densidad: Construcción y Propiedades

JORGE ARTURO FLORES CASTRO (2014)

En este trabajo se revisan métodos de construcción y propiedades de los códigos LDPC, tanto en el caso binario como en el no binario (NB).

Para el caso binario se presenta un programa-muestra interactivo programado en MATLAB que pudiese ser usado como elemento de apoyo para presentar e iniciar el estudio de los códigos LDPC. Esta herramienta no sólo presenta los conceptos básicos necesarios para iniciar el estudio de los códigos LDPC, sino que además permite al usuario observar el impacto de los parámetros de diseño, transmisión y decodificación en el desempeño global de los mismos.

En el caso no binario el análisis se enfoca el método de diseño de códigos cuasi cíclicos (QC) llamado Lifting. A partir de este análisis, se propone un algoritmo para optimizar la selección de los parámetros de diseño de esta construcción con el fin de evitar la presencia de aciertos Absorbing Sets en el grafo de Tanner de los códigos generados con este algoritmo garantiza un mejor desempeño en la región de Error Floor mientras que su estructura cuasi cíclica les confiere un nivel moderado de complejidad de codificación / decodificación. Resultados de simulaciones comprueban el desempeño superior de los códigos generados con el algoritmo propuesto en comparación con construcciones reportadas recientemente.

Master thesis

Digital communications Channel capacity Channel coding Codes Coding errors CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA ELECTRÓNICA

Effects of ammonium nitrate, cesium chloride and tetraethylammonium on high-affinity potassium uptake in habanero pepper plantlets (Capsicum chinense Jacq.)

JOSE RAMON PACHECO ARJONA NANCY RUIZ LAU MARIA DE FATIMA MEDINA LARA YERENI MINERO GARCÍA ILEANA DE LA CARIDAD ECHEVARRIA MACHADO CESAR DE LOS SANTOS BRIONES MANUEL MARTINEZ ESTEVEZ (2011)

Potassium (K +) is an essential nutrient and the most abundant cation in plant cells. Plants have a wide variety of transport systems for K + acquisition that catalyze K + uptake across a wide spectrum ofexternal K + concentrations and mediate K + movement within the plant, as well as its release into the environment. The KUP/HAK/KT transporter family plays a key role in K + homeostasis in plant cells. The present study demonstrates that habanero pepper plantlets have a clear pattern of K + uptake when resupplemented with K + after K + starvation. Habanero pepper plantlets, re-supplemented with a solution containing low concentrations of K + after 72, 96 or 120 h of K + starvation were able to decrease the amount of K + in the solution at different time points. To study the effect of NH 4 +, we added different concentrations of NH4NO3 to the medium solution and demonstrated that NH 4 + inhibited K + uptake in a dose-dependent manner. When the plantlets were subjected to K +starvation for 72 h and then resupplemented with 50 or 100 μM K +, exposure to K + channel blockers (10 mM CsCl and 20 mM TEA) decreased their K + uptake compared with the control treatment. A model demonstrating the process of K + uptake through an NH 4 +-insensitive component was proposed.

Article

 AMMONIUM CHANNEL BLOCKERS HIGH AFFINITY TRANSPORTERS POTASSIUM BIOLOGÍA Y QUÍMICA

A fading channel simulator implementation based on GPU computing techniques.

ROBERTO CARRASCO ALVAREZ JAVIER VAZQUEZ CASTILLO JAIME SILVERIO ORTEGON AGUILAR (2015)

"Channel simulators are powerful tools that permit performance tests of the individual parts of a wireless communication system. This is relevant when new communication algorithms are tested, because it allows us to determine if they fulfill the communications standard requirements. One of these tests consists of evaluating the system performance when a communication channel is considered. In this sense, it is possible to model the channel as an FIR filter with time-varying random coefficients. If the number of coefficients is increased, then a better approach to real scenarios can be achieved; however, in that case, the computational complexity is increased. In order to address this issue, a design methodology for computing the time-varying coefficients of the fading channel simulators using consumer-designed graphic processing units (GPUs) is proposed. With the use of GPUs and the proposed methodology, it is possible for nonspecialized users in parallel computing to accelerate their simulation developments when compared to conventional software. Implementation results show that the proposed approach allows the easy generation of communication channels while reducing the processing time. Finally, GPU-based implementation takes precedence when compared with the CPU-based implementation, due to the scattered nature of the channel."

Article

Communication System Channel Simulation GPU Implementation INGENIERÍA Y TECNOLOGÍA

Identificación ciega de canal disperso basado en algoritmos de sub-espacio

NICTHE NATALY JIMENEZ CASTRO MARTÍNEZ (2016)

En esta tesis se aborda el problema de la identificación del canal ciego con

la condición de canal escaso. Nos basamos en las propuestas de los métodos

de identificación ciego sub-espaciales, con filtros precodificadores redundantes

para la identificación de canal ciego, así como la ecualización de canales FIR.

A diferencia de los enfoques anteriores para la identificación de canal ciego,

la propuesta de esta tesis incluye la identificación de los canales dispersos y

utiliza la norma l1. Los resultados muestran que el rendimiento del método

propuesto es mejor que los enfoques propuestos por los autores en estudio,

para las condiciones de canales dispersos.

Master thesis

Blind channel estimation method OFDM Multi-intput-multi-output Equalizer Dispersed channel CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA FÍSICA ELECTRÓNICA