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Detección e incidencia del fitoplasma Maize Bushy Stunt y su relación con el rendimiento en maíz en el estado de Veracruz, México

SUSANA ALCANTARA MENDOZA (2009)

Detection and incidence of Maize Bushy Stunt fitoplasma and its relation with maize yield in the state of Veracruz, Mexico

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Fitopatología). -- Colegio de Postgraduados, 2009

Una nueva enfermedad del maíz apareció en el estado de Veracruz, México durante 2003-2004. Síntomas de amarillamiento, enrojecimiento y posterior quemado de hojas, proliferación de mazorcas, jilotes raquíticos, falta de fecundación y granos vanos fueron parte del síndrome de la enfermedad. El fitoplasma Maize Bushy Stunt (MBS) se identifico por PCR se detectó en plantas con los síntomas antes descritos, en los municipios de Tlalixcoyan, Cosoleacaque y Paso de Ovejas en 2006 y 2007. Los genotipos CP-562, 30F83, 30F92, Orca, 30F96, Nutria y Asgrow 7573 resultaron positivos a la presencia del MBS, mientras que en 3086, 30F97 y CP-560 no se detectó la presencia del MBS en una plantación experimental en plantas sintomáticas en Tlalixcoyan, Ver. en 2006 y 2007. La mayor incidencia se presentó en los genotipos 30F83 (27%), AS7573 (21%) y 30F97 (21%) con una severidad de 0.29, 0.14 y 0.15 respectivamente. Los genotipos con mayor rendimiento en peso de semilla fueron ORCA (4714 kg ha-1), AS-7573 (5445 kg ha-1), y 39F97 (4062 kg ha-1). Hubo correlación positiva de la incidencia con la severidad de la enfermedad (r=0.69), la incidencia con el numero de mazorcas enfermas (r=0.43) y de la severidad con la disminución en peso de semilla sana (r=0.51). La identificación del MBS se confirmó mediante secuenciación directa. La secuencia fue depositada en el Genbank y mostró una homología de 99% con el genoma del MBS. Otros síntomas como pudrición vascular en tallo, franjeado foliar, necrosis en la vaina de la hoja, manchas blancas en las brácteas, necrosis de la nervadura central y deformación del jilote también fueron observados como parte del síndrome de la enfermedad y se encontraron asociados a bacterias, cuyos resultados se reportarán por separado. ABSTRACT: A new disease of maize appeared in Veracruz, Mexico during 2003-2004. Yellowing, reddening and leaf necrosis, proliferation and poor growth of corncobs, lack of pollination and vain grain were part of the syndrome of the disease. The Maize Bushy Stunt (MBS) phytoplasma identified by PCR was detected in plants with these symptoms from Tlalixcoyan, Cosoleacaque and Paso de Ovejas countries in 2006 and 2007. MBS phytoplasma was detected in the maize genotypes CP-562, 30F83, 30F92, Orca, 30F96, Nutria and Asgrow 7573, whereas it was negative in 3086, 30F97, and CP-560 in an experimental plot in Tlalixcoyan, Veracruz, México in 2006 and 2007. The greatest incidence appeared in the genotypes 30F83 (27 %), AS7573 (21 %) and 30F97 (21 %) with a severity of 0.29, 0.14 and 0.15 respectively. Highest yield of seed was obtained in genotypes. ORCA (4714 kg ha-1), AS-7573 (5445 kg ha-1) and 39F97 (4062 kg ha-1). Positive correlation was obtained between incidence and severity of the disease (r=0.69), incidence and number of symptomatic ears (r=0.43) and severity with decrease in weight of healthy seed (r=0.51). The identification of the MBS was confirmed by direct sequence. The sequence was deposited in the Genbank and proved to have a 99 % similarity with MBS genome. Other symptoms like stem rot, leaf stripes, leaf pod necrosis, white spots on the bracts, necrosis of the central vein and deformation of corncobs were also observed as part of the disease syndrome, but associated with bacteria, whose results will be published separately.

Master thesis

Maize Bushy Stunt PCR incidencia resistencia genética genoma homología Incidence genetic resistance genome homology CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Biology of healthy aging and longevity

Juan José Carmona SHADAY MICHAN AGUIRRE (2016)

Resumen: A medida que la esperanza de vida humana se prolonga, las enfermedades relacionadas con la edad están prosperando. El envejecimiento es un proceso multifactorial complejo molecular y celular que afecta la función tisular a lo largo del tiempo, haciendo que los organismos frágiles y susceptibles a la enfermedad y muerte. Durante las últimas décadas, un creciente cuerpo de literatura científica a través de diferentes modelos biológicos, que van desde la levadura, gusanos, moscas y ratones a los primates, seres humanos y otros animales de larga vida, ha contribuido en gran medida a la identificación de especies conservadas que evitan el deterioro estructural y funcional dentro de los sistemas vivos. Colectivamente, estos datos, brindan importantes conocimientos sobre el envejecimiento saludable y la longevidad. Por ejemplo, la integridad molecular del genoma, la longitud de los telómeros, la epigenética. La estabilidad del paisaje y la homeostasis de las proteínas son características vinculadas a estados "juveniles". Estas marcas moleculares subyacen. funciones celulares asociadas con el envejecimiento como fitness mitocondrial, detección de nutrientes, comunicación intercelular eficiente, la renovación celular y la capacidad regenerativa de los tejidos. En la actualidad, la restricción calórica sigue siendo la estrategia más robusta para extender la salud y la esperanza de vida en la mayoría de los modelos biológicos probados. Así, las vías que median los efectos beneficiosos de la restricción de calorías mediante la integración de señales metabólicas a los procesos de envejecimiento han recibido mayor atención, como la insulina / factor de crecimiento de insulina-1, Sirtuinas, blanco mamífero de rapamicina, y 5 'quinasa activada por monofosfato activado con adenosina. Consecuentemente, los objetivos de estas vías han surgido en la búsqueda impetuosa de miméticos restricción de calorías, de los cuales resveratrol, metformina y rapamicina son las más estudiadas. Una comprensión global de los procesos moleculares y los mecanismos que subyacen en el deterioro y la reparación relacionados con la edad, y cómo se interconectan estas vías, sigue siendo un reto importante para descubrir las intervenciones para retrasar el envejecimiento humano y extender la juventud, vitalidad y salud molecular y fisiológica. Esta revisión resume los principales mecanismos moleculares subyacentes en la biología del envejecimiento saludable y la longevidad.

Article

MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD Ciencias médicas Ciencias clínicas Geriatría Fenómenos fisiológicos Crecimiento y desarrollo Envejecimiento Longevidad Fenómenos genéticos Estructuras genéticas Genóma Geriatrics Physiological phenomena Growth and development Aging Longevity Genetic phenomena Genetic structures Genome

Biology of healthy aging and longevity

Juan José Carmona SHADAY MICHAN AGUIRRE (2016)

Resumen: A medida que la esperanza de vida humana se prolonga, las enfermedades relacionadas con la edad están prosperando. El envejecimiento es un proceso multifactorial complejo molecular y celular que afecta la función tisular a lo largo del tiempo, haciendo que los organismos frágiles y susceptibles a la enfermedad y muerte. Durante las últimas décadas, un creciente cuerpo de literatura científica a través de diferentes modelos biológicos, que van desde la levadura, gusanos, moscas y ratones a los primates, seres humanos y otros animales de larga vida, ha contribuido en gran medida a la identificación de especies conservadas que evitan el deterioro estructural y funcional dentro de los sistemas vivos. Colectivamente, estos datos, brindan importantes conocimientos sobre el envejecimiento saludable y la longevidad. Por ejemplo, la integridad molecular del genoma, la longitud de los telómeros, la epigenética. La estabilidad del paisaje y la homeostasis de las proteínas son características vinculadas a estados "juveniles". Estas marcas moleculares subyacen. funciones celulares asociadas con el envejecimiento como fitness mitocondrial, detección de nutrientes, comunicación intercelular eficiente, la renovación celular y la capacidad regenerativa de los tejidos. En la actualidad, la restricción calórica sigue siendo la estrategia más robusta para extender la salud y la esperanza de vida en la mayoría de los modelos biológicos probados. Así, las vías que median los efectos beneficiosos de la restricción de calorías mediante la integración de señales metabólicas a los procesos de envejecimiento han recibido mayor atención, como la insulina / factor de crecimiento de insulina-1, Sirtuinas, blanco mamífero de rapamicina, y 5 'quinasa activada por monofosfato activado con adenosina. Consecuentemente, los objetivos de estas vías han surgido en la búsqueda impetuosa de miméticos restricción de calorías, de los cuales resveratrol, metformina y rapamicina son las más estudiadas. Una comprensión global de los procesos moleculares y los mecanismos que subyacen en el deterioro y la reparación relacionados con la edad, y cómo se interconectan estas vías, sigue siendo un reto importante para descubrir las intervenciones para retrasar el envejecimiento humano y extender la juventud, vitalidad y salud molecular y fisiológica. Esta revisión resume los principales mecanismos moleculares subyacentes en la biología del envejecimiento saludable y la longevidad.

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MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD Ciencias médicas Ciencias clínicas Geriatría Fenómenos fisiológicos Crecimiento y desarrollo Envejecimiento Longevidad Fenómenos genéticos Estructuras genéticas Genóma Geriatrics Physiological phenomena Growth and development Aging Longevity Genetic phenomena Genetic structures Genome

Optimización de costos en la producción de proteínas en el Genoma Humano

Cost optimization of protein synthesis in the human genome

ARAXI URRUTIA ODABACHIAN (2004)

Estancias

Casi la totalidad de las células en nuestro cuerpo contienen una copia de nuestro genoma. Los genes contienen la información necesaria para producir todas las proteínas que realizan todas las actividades en la célula. Enfermedades como el cáncer o defectos hereditarios pueden resultar de errores en la secuencia de los genes. Hoy a más de 50 años del descubrimiento de la estructura del ADN, los investigadores cuentan con la secuencia completa del genoma humano. En contraste, el conocimiento acerca de la organización del genoma y la función de los genes es muy pobre. Dado que el tamaño de la población de las especies de mamíferos es reducida, generalmente se asume que la fuerza de la selección natural es relativamente débil. A continuación se presentan los resultados más recientes que evalúan esta hipótesis. La comparación de los niveles de actividad con las características físicas (como su longitud o composición) de los genes, ha revelado que aquellos genes con mayor actividad tienen características peculiares. Estas observaciones se cuentan entre las primeras en mostrar que las secuencias génicas muestran patrones consistentes con la acción de la selección natural para aumentar la eficiencia de la síntesis de proteínas

Virtually all cells in our body hold a complete copy of the genome. The 35000 human genes contained in the genome are required to produce all the proteins in the cell allowing us to carry out the activities of our daily lives. If our genes go wrong then diseases such as cancer might develop or inherited defects past on to future generations. On the 50th anniversary of the discovery of the DNA structure, the human genome sequence has already been cracked. Still very little is known about its organization and the function of most genes it contains. It is usually assumed that selection mediated by expression is a weak force in determining gene characteristics in humans. Here we present recent evidence of a relationship between physical characteristics of genes with levels of activity in human genes. We found that highly active genes tend to be smaller and have a particular nucleotide composition compared to other genes of lower activity. Together these results constitute the first systematic studies to show that gene sequences in mammalian genomes show signatures consistent with the action of natural selection to increase efficiency of protein synthesis

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MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD Genoma humano Condón

Construcción y secuenciación de una colección de cromosomas bacterianos artificiales de una levadura cervecera

CINTIA NOEMI GOMEZ MUÑOZ (2015)

"Las nuevas tecnologías de secuenciación permitieron la obtención de la secuencia genómica de una cepa de levadura cervecera tipo lager; sin embargo, el tamaño corto de las lecturas de estas tecnologías dificulta el proceso de ensamblaje. Una opción para mejorar el borrador de la secuencia es incorporar información de fuentes alternativas como lo son los mapas físicos basados en BACs. Por lo anterior, desarrollamos un protocolo para la construcción de clonas BACs con insertos de DNA de la levadura y obtuvimos las secuencias del extremo del vector (BES) de una colección de ellas. Encontramos que estos BESs pueden contribuir a la mejora del ensamblaje de la secuencia."

"Next-generation sequencing technologies allowed the retrieval of the genome sequence of a lager beer yeast strain; however, the short read size of these technologies hinders the assembly process. One option to improve the draft sequence is by incorporating information from alternative sources such as BACbased physical maps. Therefore, we developed a protocol for the construction of BAC clones with yeast DNA inserts and obtained the BAC-end sequences (BES) of a collection of them. We found that these BESs can contribute to the improvement of the sequence assembly."

Master thesis

Nuevas tecnologías de secuenciación Ensamblaje del genoma Cromosomas bacterianos artificiales Secuencias de los extremos del vector BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA MOLECULAR BIOLOGÍA MOLECULAR

La biodiversidad como recurso estratégico

EDGAR TALLEDOS SANCHEZ (2007)

"Con los nuevos desarrollos y avances ocurridos en los últimos años, vinculados al conocimiento genético, que motivaron que se desarrollara la lectura e interpretación del genoma humano, y que detonaron todo un sin fin de estudios (que se venia realizando a desde tiempos atrás), en los seres vivos del planeta principalmente animales y plantas, posicionaron a la biodiversidad de todo el mundo como un recurso estratégico, de dominación territorial y tecnológica para las potencias imperialistas. Ya que su control implica no sólo un buen negocio a escala global, sino además, la generación de conocimiento medico que puede llevar a solucionar enfermedades incurables hasta este momento, como en Cáncer y el SIDA. Conocimiento que será utilizado como medida de control y dominio hacia los países del tercer mundo. Estos avances tecnológicos que propiciaron un auge enorme en la experimentación genética de plantas, es propiciada en gran medida por las relaciones sociales políticas-económicas en que se desenvuelve (sistema capitalita), y su desarrollo depende de los intereses económicos que se encuentran detrás de estas experimentaciones genéticas. En este trabajo lo que se pretende es, abordar como las diferentes experimentaciones y extracción de biodiversidad que se llevan acabo en América Latina y México, encubren toda una serie de argucias legales y de convenios establecidos entre diferente universidades y entidades gubernamentales y no gubernamentales, tanto nacionales y extranjeras, para extraer la riqueza biológica de la zona y poder generar un conocimiento genético que se convierte en una arma estratégica en el control de enfermedades."

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Diversidad biológica / Hispanoamérica Genoma humano BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA OTRAS ESPECIALIDADES DE LA BIOLOGÍA OTRAS ESPECIALIDADES DE LA BIOLOGÍA

Análisis no lineal de la dinámica del cáncer

HOMERO GARCES FLORES ADONIS GERMINAL COCHO GIL RAUL PERALTA RODRIGUEZ PEDRO EDUARDO MIRAMONTES VIDAL (2018)

El cáncer es una de las enfermedades complejas de mayor prevalencia a nivel mundial y el aumento de casos de este padecimiento se debe a una mayor exposición a los factores de riesgo relacionados en gran parte con el estilo de vida. Estos factores tienen la capacidad de interactuar con los genes moduladores del crecimiento y la diferenciación celular y producir mutaciones o alteraciones en el genoma. Tales mutaciones inducen un cambio en la dinámica de interacciones génicas en el interior de la célula y, como consecuencia, modifican la estabilidad de las redes de regulación génica característica de cada fenotipo celular. En este artículo se estudian las redes de regulación génica en la teoría matemática de la dinámica no lineal y sus propiedades, que las hacen parte esencial de la teoría de los sistemas complejos.

Article

MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD CIENCIAS MÉDICAS mutaciones en el genoma, interacción génica, dinámica no lineal, propiedades, sistemas complejos