Title

Caracterización taxonómica y genética de especies de polidóridos que afectan a Magallana gigas cultivado en la Bahía de San Quintín

Morphologic and genetic characterization of polydorid species affecting Magallana gigas cultured in the San Quintin Bay

Author

Ana Leticia Gracida Olivera

Contributor

Jorge Abelardo Cáceres Martínez (Thesis Adviser)

Access level

Open Access

Summary or description

El ostión Magallana gigas u ostión japonés, es uno de los moluscos bivalvos de mayor importancia y producción a nivel mundial. En México la mayor producción de este bivalvo se obtiene en la Bahía de San Quintín (BSQ), en el estado de Baja California, que ronda las 2,000 toneladas anuales. Los moluscos bivalvos en general y el ostión japonés en particular están expuestos a la infestación por gusanos perforadores de la familia Spionidae que conforman el complejo Polydora-Boccardia. Una de sus características principales es que poseen la capacidad de asentarse sobre conchas calcáreas para después perforarlas, formando túneles donde establecen un refugio para vivir. Desde 1997, se han registrado la presencia de este tipo de gusanos en la BSQ afectando su cultivo y, hasta la fecha no se han identificado correctamente. En estudios recientes se corroboró la presencia de dos fenotipos en la Bahía, lo cual hace imprescindible su correcta identificación. El objetivo del presente estudio fue caracterizar morfológica y genéticamente ambos fenotipos. Para tal efecto, se obtuvieron ostiones cultivados en nueve granjas de la Bahía y se extrajeron los polidóridos mismos que fueron identificados por taxonomía convencional bajo un microscopio y siguiendo claves dicotómicas. Adicionalmente, se complementó esta identificación con ayuda de microscopia electrónica de barrido (MEB). Para la caracterización genética se realizó secuenciación Sanger y su secuenciación masiva de próxima generación. Los resultados obtenidos del análisis taxonómico convencional indicaron que uno de los fenotipos corresponde a Polydora websteri, lo que fue confirmado con el análisis genético molecular, que indicó una similitud del 99.5% con esta especie. El análisis taxonómico convencional y por MEB del segundo fenotipo indicó que se trata de un polidórido del género Boccardiella sin coincidir con ninguna de las especies descritas para el género. El análisis del genoma mitocondrial corroboró su pertenencia al género indicado, pero con una escasa similitud (79.85%) con una de las especies descritas, Boccardiella hamata, corroborando que se trata de una nueva especie denominada Boccardiella Vicentina. Así mismo, se diseñaron marcadores específicos para identificar a esta nueva especie, dando una herramienta diagnóstica de gran utilidad para el seguimiento de este epibionte.

The Magallana gigas oyster or Japanese oyster is one of the most important bivalve molluscs and production worldwide. In Mexico, the largest production of this bivalve is obtained in San Quintín Bay (BSQ), in the state of Baja California, which is around 2,000 tons per year. Bivalve molluscs in general and Pacific oysters are exposed to infestation by borer worms of the Spionidae family that make up the Polydora-Boccardia complex. One of its main characteristics is that they can settle on calcareous shells and then drill them, forming tunnels where they establish a shelter to live. Since 1997, the presence of this type of worms has been recorded in the BSQ affecting its cultivation and, to date, they have not been correctly identified. Recent studies confirmed the presence of two phenotypes in the Bay, making their correct identification essential. The aim of this study was to characterize both phenotypes morphologically and genetically. For this purpose, cultured oysters were obtained from nine farms in the Bay and the polydorids themselves, which were identified by conventional taxonomy under a microscope and following dichotomous keys, were extracted. Additionally, this identification was complemented with the help of scanning electron microscopy (SEM). For genetic characterization, Sanger sequencing and next generation massive sequencing were performed. The results obtained from the conventional taxonomic analysis indicated that one of the phenotypes corresponds to Polydora websteri, which was confirmed with the molecular genetic analysis, which indicated a 99.5% similarity with this species. The conventional taxonomic analysis and by SEM of the second phenotype indicated that it is a polydorid of the genus Boccardiella without coinciding with any of the species described for the genus. The analysis of the mitochondrial genome corroborated its belonging to the indicated genus, but with little similarity (79.85%) with one of the described species, Boccardiella hamata, corroborating that it is a new species called Boccardiella Vicentina. Likewise, specific markers were designed to identify this new species, providing a very useful diagnostic tool for monitoring this epibiont.

Publisher

CICESE

Publish date

2023

Publication type

Master thesis

Format

application/pdf

Language

Spanish

Citation suggestion

Gracida Olivera, A.L. 2023. Caracterización taxonómica y genética de especies de polidóridos que afectan a Magallana gigas cultivado en la Bahía de San Quintín. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 59 pp.

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Repositorio Institucional CICESE

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