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Etiología del colapso del tetecho (Neubuxbaumia tetetzo Coultier [Backeberg]) en Zapotitlán Salinas, Puebla.

DIMAS MEJIA SANCHEZ (2018)

Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, 2018.

El tetecho (Neobuxbaumia tetetzo (Coultier [Backeberg]) es una cactácea columnar endémica de México. En Zapotitlán Salinas, se han observado individuos con áreas amarillas en tallo y necrosis de tejido interno, así como pudrición blanda que invade el tallo y provoca colapso de la planta. En el tejido con pudrición y galerías del tallo se asocian diferentes insectos. El objetivo de la investigación fue: i) identificar las bacterias que causan estos síntomas; ii) identificar los insectos asociados y detectar la presencia de las bacterias causales en el intestino de estos insectos. A partir del tejido con pudrición blanda se aislaron bacterias y se inocularon en plantas sanas de tetecho reproduciendo los síntomas de pudrición. La caracterización fenotípica y genética de las bacterias las identificaron como Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense (Pcb). Este es el primer reporte de Pcb causando pudrición blanda en cactáceas en el mundo y en México. Del síntoma de necrosis interna de tallo, se aislaron cuatro morfotipos bacterianos, la inoculación en plantas sanas de tetecho reprodujo los síntomas de necrosis y se identificó a Pseudomonas, Curtobacterium, Leuconostoc y Carnobacterium como los agentes causales. Los insectos asociados a los síntomas se identificaron como Lagocheirus lugubris (Coleoptera: Cerambycidae), Chalcolepidius sp. (Coleoptera: elateridae) y Glyphidops flavifrons (Diptera: Neriidae). Del intestino de los insectos se detectó Carnobacterium y Curtobacterium, en larvas de Lagocheirus; Pseudomonas se detectó en todos los insectos excepto en el adulto de Chalcolepidius., Pcb se detectó en larvas y adultos de Lagocheirus y en el adulto de Glyphidops. _______________ ETIOLOGY OF THE COLLAPSE OF THE TETECHO (Neubuxbaumia tetetzo Coultier [Backeberg]) IN ZAPOTITLÁN SALINAS, PUEBLA. ABSTRACT: Tetecho (Neobuxbaumia tetetzo (Coultier [Backeberg]) is a columnar cactus endemic to Mexico. In Zapotitlán Salinas, individuals have been observed with yellow areas on stem and necrosis of internal tissue, as well as soft rot that invades the stem and causes collapse of The plant In the rotten tissue and stem galleries different insects are associated The objective of the research was: i) to identify the bacteria that cause these symptoms; ii) identify the associated insects and detect the presence of the causative bacteria in the intestine of these insects. Bacteria were isolated from the tissue with soft rot and inoculated in healthy tetecho plants reproducing the symptoms of rotting. The phenotypic and genetic characterization of the bacteria identified them as Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense (Pcb) This is the first report of Pcb causing soft rot in cacti in the world and in Mexico. From the symptom of internal stem necrosis, four bacterial morphotypes were isolated, inoculation in healthy tetecho plants reproduced the symptoms of necrosis and Pseudomonas, Curtobacterium, Leuconostoc and Carnobacterium were identified as the causative agents. The insects associated with the symptoms were identified as Lagocheirus lugubris (Coleoptera: Cerambycidae), Chalcolepidius sp. (Coleoptera: elateridae) and Glyphidops flavifrons (Diptera: Neriidae). Carnobacterium and Curtobacterium were detected in the intestine of the insects in Lagocheirus larvae; Pseudomonas was detected in all insects except the adult Chalcolepidius. Pcb was detected in larvae and adults of Lagocheirus and in adult Glyphidops.

Doctoral thesis

Cactácea Pudrición blanda Bacterias Brasiliense PCR Insectos Soft rot Bacteria Brasiliense Insects Fitopatología Doctorado BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA VEGETAL (BOTÁNICA) BOTÁNICA GENERAL

ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA, CAUSAL AGENT OF SOFT ROT IN POLIANTHES TUBEROSE

Evangelina Esmeralda Quiñones Aguilar (2015)

El nardo (Polianthes tuberosa) es uno de los cultivos más importantes de la floricultura en el estado de Morelos. La producción de este cultivo se ve afectado por varias plagas y enfermedades. Una de las enfermedades que causan pérdidas importantes es la pudrición blanda provocada por Pseudomonas aeruginosa (Pa), bacteria ubicua y multi-huésped. Pa es capaz de infectar seres humanos, animales, plantas e insectos y se ha aislado a partir de varias especies de plantas como la cebolla, el rábano, papa, lechuga y apio, así como en las aguas residuales, lo que constituye una fuente de inóculo para los cultivos florícolas. El objetivo de este trabajo fue aislar e identificar Pa de suelo de la rizosfera de nardo de Morelos. Las muestras de suelo fueron tomadas de la rizosfera de plantas nardo enfermas por pudrición blanda en Puente de lxtla, Morelos. El aislamiento de Pa se realizó por el método de diluciones seriales 1:10 en medio selectivo Kings B, donde Pseudomonas presenta un fenotipo verde fluorescente, 31 aislados se caracterizaron molecularmente por ITS y 29 fueron positivos a Pa de acuerdo con el tamaño del ITS del genoma publicado de esta bacteria. También se determinó la patogenicidad y la virulencia de los 29 aislamientos de Pa, los resultados mostraron la pudrición blanda; por lo tanto, los aislados bacterianos de Pa fueron considerados como fitopatógenos.

Conference proceedings

Pudrición blanda; bacterias fitopatógenas; Identificación molecular por ITS. CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Etiología y manejo de la pudrición de frutos de piña (Ananas comosus L Merr) en postcosecha

MARIA DOLORES SANCHEZ AGUIRRE (2013)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, 2013.

En el cultivo de piña (Ananas comosus L. Merr.) desde el 2011 se ha estado presentando una enfermedad de frutos en postcosecha de etiología desconocida, en el estado de Veracruz, México. Fusarium subglutinans, Fusarium verticillioides (sin. Fusarium moni¬liforme) y Fusarium oxysporum, identificados cultural, morfológica y molecularmente, se asocio con este problema en 84% de los aislamientos obtenidos de pudrición de frutos. Se realizaron pruebas de patogenicidad en frutos de piña en estado de madurez 1 de la variedad MD2. Los frutos mostraron la pudrición, caracterizada inicialmente la presencia de pequeñas manchas irregulares de color café claro en el pericarpio de los frutos, conforme avanzo la enfermedad la mancha irregular se torno de color café obscuro, misma que al avanzar el tejido afectado esta adquirió una apariencia flácida y húmeda. El estudio de patogenicidad confirmo a F. subglutinans, F. verticillioides y F. oxysporum como agentes causales de la pudrición de frutos de piña en postcosecha. Se realizaron pruebas in vitro de los fungicidas triadimefon, trifloxystrobim, tiabendazol, procloraz e imazalil para la inhibición del crecimiento micelial de F. subglutinans, F. verticillioides y F oxysporum. Imazalil y procloraz fueron los mas efectivos con valores de CL50 <0.1 mg•L-1, seguido de tiabendazol y trifloxystrobim con valores de CL50 <1.0 mg•L-1. _______________ ETIOLOGY AND MANAGEMENT OF FRUIT ROT PINEAPPLE (Ananas comosus L. Merr.) POST-HARVEST. ABSTRACT: In the cultivation of pineapple (Ananas comosus L. Merri) since 2011 has been presenting a postharvest fruit disease of unknown etiology, in the state of Veracruz, Mexico. Fusarium subglutinans, Fusarium verticillioides (syn. Fusarium moni ¬ liforme) and Fusarium oxysporum, identified culturally, morphologically and molecularly, was associated with this problem in 84% of the isolates from fruit rots. Pathogenicity tests were conducted on pineapple fruit at maturity 1 MD2 variety. The fruits showed decay, initially characterized the presence of small irregular spots of dark brown in the pericarp of the fruit, as I go spot disease irregular dark brown around, same as to move the affected tissue is acquired appearance flaccid and moist. The study confirmed pathogenicity to F. subglutinans, F. and F. verticillioides oxysporum as causal agents of fruit rot of pineapple in postharvest. In vitro tests were conducted on fungicides triadimefon, trifloxystrobim, thiabendazole, prochloraz, and imazalil for inhibiting the mycelial growth of F. subglutinans, F. verticillioides and F oxysporum. Imazalil and prochloraz were the most effective with LC50 values <0.1 mg•L-1, followed by thiabendazole and trifloxystrobim with LC50 values <1.0 mg•L-1.

Master thesis

Pudrición F. subglutinans F. verticillioides F. oxysporum Fungicidas Rot Fungicides Fitopatología Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Distribución y variabilidad genética de organismos asociados a la enfermedad "pata prieta" de la jamaica (Hibiscus sabdariffa L), en Guerrero, México

SANTO ANGEL ORTEGA ACOSTA (2012)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, 2012.

La enfermedad “pata prieta” de la jamaica es una de las principales limitantes fitosanitarias del cultivo de ésta especie en la zona productora más importante del estado de Guerrero, con pérdidas que rebasan el 50% de la producción. La presente investigación se realizó con la finalidad de conocer la distribución y frecuencia de organismos asociados a la enfermedad en 12 sitios ubicados en los municipios de Ayutla y Tecoanapa, Guerrero. Se consideraron variables ambientales y edáficas de los sitios seleccionados. La identificación de organismos se realizó mediante claves taxonómicas y fue confirmada con técnicas moleculares. Los organismos asociados con la enfermedad fueron Phytophthora parasitica, Macrophomina phaseolina, Fusarium oxysporum, Fusarium solani, Fusarium incarnatum, Phomopsis longicolla, Colletotrichum truncatum y Glomerella cingulata. El oomiceto P. parasitica fue el de mayor importancia por su alta frecuencia y distribución. En pruebas de patogenicidad P. parasitica, M. phaseolina y F. incarnatum resultaron ser patogénicos. P. parasitica ha sido reportado en esta zona como el principal agente causal de la enfermedad, por lo que se estableció el estudio de su variabilidad genética a nivel de la región ITS del ADNr, además de realizar un análisis filogenético, a partir de aislamientos provenientes de los municipios en estudio, adicionalmente se consideró un aislamiento del municipio de Juan R. Escudero del mismo estado. Un total de 13 aislamientos de P. parasitica fueron analizados, evidenció variaciones a nivel de la región amplificada, el análisis filogenético permitió diferenciar cuatro grupos. _______________ DISTRIBUTION AND GENETIC VARIABILITY OF ORGANISMS ASSOCIATED WITH THE ROSELLE´S “BLACKLEG” DISEASE (Hibiscus Sabdariffa L.), IN GUERRERO, MEXICO. ABSTRACT: Roselle´s “blackleg” disease is one of the main phytosanitary limiting of culture of this specie in the most important producing area in Guerrero, with losses that exceed 50% of production. This research was accomplished with the purpose of determining distribution and frequency of organisms associated to disease at 12 places located in the townships of Ayutla and Tecoanapa, Guerrero. Enviromental and edaphic variables of assigned sites were considered. Identification was made with taxonomic keys and confirmed with molecular techniques. Organisms associated to disease were Phytophthora parasitica, Macrophomina phaseolina, Fusarium oxysporum, Fusarium solani, Fusarium incarnatum, Phomopsis longicolla, Colletotrichum truncatum and Glomerella cingulata. Oomycete P. parasitica, was the most important for its high frequency and distribution. In pathogenicity tests, P. parasitica, M. phaseolina and F. incarnatum were found to be pathogenic. P. parasitica has been reported in this area as the main causative agent of disease, for that reason was established the study of its genetic variability at level of ITS region of rDNA, besides of phylogenetic analysis, starting from isolations proceeding of studies townships. Additionally was considered one isolation from Juan R. Escudero township in the same state. A total 13 isolation of P. parasitica were analyzed, showing variation at level of amplified region and phylogenetic analysis allowed to distinguish four groups.

Master thesis

Hibiscus sabdariffa Pudrición basal Patógenos Complejo fungoso Pseudohongo Variación Basal rot Pathogenic Fungus complex Pseudo-fungus Variation Fitopatología Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Etiología de la pudrición del cogollo de la piña (Anana comosus L Merril) en Isla, Veracruz México

CESAR JOEL ESPINOSA RODRIGUEZ (2015)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Fruticultura).- Colegio de Postgraduados, 2014.

La pudrición del cogollo de la piña (Ananas comosus L. Merril) es una enfermedad con alta incidencia en la regiones productoras de Veracruz, México, el cultivar MD2 es el más susceptible. El objetivo de este estudio fue identificar morfológica y filogenéticamente el agente causal de la enfermedad. Muestras de piña se colectaron entre Septiembre de 2011 y Marzo de 2012. De las hojas basales en contacto con el cogollo con pudrición se aisló un oomicete. Para la identificación morfológica se utilizó el micelio y las estructuras reproductivas asexuales (esporangios y clamidosporas). Para la identificación filogenética, se amplificó el espacio transcrito interno del ADN ribosomal utilizando los iniciadores ITS6 (5’- GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3’) e ITS4 (5’- TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’). Las secuencias obtenidas se compararon con la base de datos del Banco de Genes del National Center for Biotechnology Information (NCBI, 2012) USA, con la accesión JN699566. En la caracterización morfológica se identificó al oomicete Phytophthora nicotianae. La identificación filogenética tuvo 100% de similitud con Phytophthora nicotianae, con la secuencia reportada por el NCBI. Se realizaron pruebas de patogenicidad in vitro e in vivo. Para las pruebas in vitro se inoculó el oomicete en coronas de piña, los primeros signos y síntomas aparecieron 7 - 9 días después de la inoculación (ddi) en el 100% de las coronas inoculadas; para las pruebas in vivo se utilizaron vástagos (gallos) sembrados en una mezcla de tierra y tezontle (3:2 v/v) cultivados por 5 meses, los signos y síntomas se presentaron 16 - 20 ddi en el 95% de las plantas inoculadas. Por lo que se considera el primer reporte de Phytophthora nicotianae en piña para esta zona. _______________ ABSTRACT: Bud rot of pineapple (Ananas comosus L. Merril) is a disease with high incidence in the growing regions of Veracruz, Mexico, MD2 cultivar is the most susceptible. The objective of this study was to identify morphological and phylogenetically the causative agent of the disease. Samples were collected pineapple between September 2011 and March 2012. Basal leaves from contact with the bud rot oomycete isolated one. For morphological identification mycelium and asexual reproductive structures (sporangia and chlamydospores) was used. Phylogenetic identification for the internal transcribed space ribosomal DNA was amplified using primers ITS6 (5'-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3 ') and ITS4 (5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3'). The sequences obtained were compared with the database of Gen Bank National Center for Biotechnology Information (NCBI, 2012) USA, with JN699566 accession. In the morphological characterization the oomycete Phytophthora nicotianae was identified. Phylogenetic identification was 100% similarity to Phytophthora nicotianae, with the sequence reported by the NCBI. Tests in vitro and in vivo pathogenicity were performed. For in vitro tests in the oomycete inoculated pineapple crowns, early signs and symptoms appeared 7-9 days after inoculation (dai) in 100% of inoculated crowns; for in vivo testing stems (roosters) planted in a mixture of earth and volcanic rock (3:2 v / v) grown for 5 months, the signs and symptoms presented were used 16 - 20 ddi in 95% of the plants inoculated. It is considered the first report of Phytophthora nicotianae in pineapple for this area.

Master thesis

Pudrición del cogollo Ananas comosus Phytophthora nicotianae Bud rot Fruticultura Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Caracterización morfológica y molecular de aislamientos de Penicillium sp obtenidos de frutos de manzana (Malus x domestica Borkh) en México y pruebas de agresividad

OMAR HERNANDEZ ROMERO (2014)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Entomología y Acarología).- Colegio de Postgraduados, 2014.

Según FAO-SAGARPA la manzana es de los productos más cultivados en el mundo; en México para 2012 se tuvo una producción de 375,044.9 ton de una superficie de 58, 451.25 ha y un promedio de rendimiento de 6.42 ton.ha-1; logrando con ello un valor de la producción de 3,008.86 millones de pesos. El estado de Chihuahua tiene la mayor área cosechada para este año con 25, 123 has. Durante el almacenamiento postcosecha de la manzana ocurren pérdidas debidas a hongos, de los cuales más de 80% son atribuidas a la pudrición azul (Penicillium expansum Link). La identificación de estas especies con base a las características morfológicas es imprecisa pues hay variación entre los aislados de una misma especie. Las técnicas moleculares basadas en el análisis de ADN son muy específicas y sensibles. En esta trabajo 118 aislamientos de Penicillium sp. provenientes de Chihuahua fueron colectados en el año 2013. La caracterización molecular de 25 de estos cultivos se realizó mediante PCR-ITS, se secuenció el producto de PCR y se confirmó a Penicillium expansum. Para la caracterización morfológica se utilizaron los medios de cultivo Potato-Dextrose-Agar (PDA) y Malta-Extracto de malta (MEA). Las colonias presentaron diversidad de formas, colores y tamaños en ambos medios. Hubo también diversidad en la longitud y formas del conidióforo, fialide, métula, y conidios y hubo traslape intra y interespecífico. La agresividad de 25 cultivos monospóricos se midió en base al diámetro de las lesiones desarrolladas en frutos de manzana var Golden Delicius, desde los 2 hasta los 10 días después de la inoculación. Solo 12 de los 25 aislados de Penicillium expansum presentaron síntomas de pudrición blanda, acuosa, color pardo claro. En la superficie aparece primero un moho blanco que luego se torna verde-azulado. Se confirmó a P. expansum como la especie más agresiva en Chihuahua, México. _______________ MOLECULAR AND MORPHOLOGICAL CHARACTERIZATION OF ISOLATION OF Penicillium sp., OBTEINED FROM APPLE FRUITS (Malus x domestica Borkh) IN MEXICO, AND AGGRESSIVENESS TESTS. ABSTRACT: According to FAO-SAGARPA, apple is one of the most cultivated fruit in the world. By 2012, there were 375,044.9 ton production in Mexico; it was cultivated in 58,451.25 ha with an average yield of 6.42 ton ha-1. As a result, the production value achieved 3,008.86 pesos millions. The Chihuahua State has the most harvested area in this year with 25,123 ha. There are losses due to fungi during the post-harvest apple storage. Most of the 80% losses are attributed to blue rot (Penicillium expansum Link). The identification of these species based on morphological characteristics is imprecise because there is a variation among isolated organisms of the same species. Molecular techniques based on DNA analysis are so specific and sensitive. In this document, 118 isolates of Penicillium sp., were collected from Chihuahua State in 2013. The molecular characterization of these 25 samples, was carried out by PCR-ITS. The PCR product was sequenced and confirmed as Penicillium expansum. To morphological characterization, were used Papa-Dextrosa-Agar (PDA) and Malt Extract-Agar (MEA); both of them, colonies showed diversity of shapes, colors and sizes. There was diversity in length and shape of conidiophore, fialide, metula, and conidia. There was overlap intra and interspecific, too. The aggressiveness of 25 monosporic samples was measured based on the diameter of the lesions developed in Golden Delicious apple fruits, in a period of 2 to 10 days after inoculation. Only 12 of 25 Penicillium expansum isolates, showed: soft rot, watery, and a light brown color. First, there appears a white mold on surface, and then it turns blue-green. P. expansum was confirmed as the most aggressive species in Chihuahua State, Mexico.

Master thesis

Penicillium expansum Pudrición azul Postcosecha Medios de cultivo PCR Blue rot Post-harvest Culture media Entomología y Acarología Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Dinámica de la concentración de fosfitos en árboles de aguacate (Persea americana Mill) atacados por Phytophthora cinnamomi Rands

FABIAN GUTIERREZ CHACON (2014)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, 2014.

Phytophthora cinnamomi Rands, provoca la “tristeza del aguacatero”, uno de los principales problemas fitosanitarios en Michoacán, México. En el presente estudio se evaluó el efecto del ácido fosforoso en la recuperación de árboles de aguacate “Hass" con síntomas iniciales, intermedios y avanzados de tristeza. El ácido fosforoso al 40% y a un pH de 5.5 se aplicó a la dosis de 45 mL/árbol (7.18 g i.a.) en noviembre de 2013. El pseudohongo fue aislado de raíces (noviembre, 2013; enero, 2014; junio, 2014: árboles con síntomas iniciales: 4, 4 y 6 aislamientos respectivamente; árboles con síntomas intermedios: 9, 7 y 6 aislamientos respectivamente; y árboles con síntomas avanzados: 9, 8 y 8 aislamientos respectivamente) y suelo (noviembre, 2013; enero, 2014; junio, 2014: árboles con síntomas iniciales: 11, 6 y 2 aislamientos respectivamente; árboles con síntomas intermedios: 27, 23 y 8 aislamientos respectivamente; y árboles con síntomas avanzados: 75, 70 y 20 aislamientos respectivamente) en medio especifico P.A.R.P.H (Penicilina-Ampicilina-Rifamicina-PCNB-Hymexazol). El número de aislamientos de raíz y suelo fueron proporcional con la severidad de síntomas. El micelio toruloso, camelioide y esporangios alimonados fueron típicos de P. cinnamomi. La concentración de fosfitos en las raíces fluctuó en 10 mg•kg-1 (Noviembre, 2013, previo a la aplicación) a 50 mg•kg-1 en un periodo de ocho meses (junio, 2014). Uno de los árboles con síntomas avanzados murió, y el resto, incluyendo los árboles con síntomas iniciales e intermedios mantuvo su nivel de síntomas durante los 8 meses después de la aplicación. El contenido nutrimental foliar (N, P, K+, Ca2+, Mg2+, Fe2+, Zn2+, Cu2+, Mn2+) y suelo (más S, Mo2+, B3+) fue similar para árboles con síntomas iniciales e intermedios y significativamente superior al contenido en árboles con síntomas avanzados de la enfermedad. _______________ DYNAMICS OF PHOSPHITES CONCENTRATION IN AVOCADO TREES (Persea americana Mill) ATTACKED BY Phytophthora cinnamomi Rands. ABSTRACT: Phytophthora cinnamomi Rands causes "avocado tristeza", one of the main phytosanitary problems in Michoacán, Mexico. In the present study the effect of the phosphorous acid in the recovery of avocado trees 'Hass' with initial, intermediate and advanced symptoms were evaluated of tristeza. Phosphorous acid 40% and pH of 5.5 was applied to the dose of 45 mL/tree (7.18 g a.i.) in November 2013. The pseudohongo was isolated from roots (November 2013, January 2014, June, 2014: trees with initial symptoms: 4, 4 and 6 isolates respectively; trees with intermediate symptoms: 9 , 7 and 6 isolates, respectively, and trees with advanced symptoms: 9, 8 and 8 isolates, respectively) and soil (November 2013, January 2014, June, 2014: trees with initial symptoms: 11, 6 and 2 isolates, respectively; trees with intermediate symptoms: 27, 23 and 8 isolates, respectively, and trees with advanced symptoms: 75, 70 and 20 isolates, respectively) in specific medium P.A.R.P.H. (penicillin-ampicillin-rifamycin-PCNB-hymexazol). The number of isolates of root and soil were proportional to the severity of symptoms. The toruloso mycelium, camelioide and sporangia lemony were typical of P. cinnamomi. La. phosphite concentration in roots fluctuated 10 mg•kg-1 (November, 2013, prior to the application) 50 mg•kg-1 in a period of eight months (June, 2014). One of the trees with advanced symptoms died, and the rest, including the initial and intermediate trees with symptoms maintained it’s level of symptoms during the 8 months after application. Foliar nutrient content (N, P, K+, Ca2+, Mg2+, Fe2+, Zn2+, Cu2+, Mn2+) and soil (more S, Mo2+, B3+) was similar for trees with initial and intermediate symptoms and significantly higher than the content in trees advanced disease symptoms.

Master thesis

Persea americana Phytophthora cinnamomi Pudrición de raíces Severidad Ácido fosforoso Fosfitos Root-rot Severity Phosphorus acid Phosphites Fitopatología Maestría CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Diversidad genética en el patosistema maíz-fusarium en el Altiplano de México

DOLORES BRIONES REYES (2013)

Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista en Genética).- Colegio de Postgraduados, 2013.

Las variantes de maíz (Zea mays L.) nativas (criollos) preservadas por los agricultores a través de generaciones, constituyen más de 80% del área sembrada con maíz en México; la pudrición de mazorca por Fusarium spp. provoca pérdidas de hasta 30%. El estudio de las poblaciones de maíz y sus patógenos como patosistema tiene sentido, pues en la variación genética del maíz nativo se puede encontrar resistencia/tolerancia a enfermedades; el conocimiento de la estructura de las poblaciones de maíz y del patógeno de manera integral ayudaría a resolver el problema de pudrición, aumentar la producción de grano y conservar la diversidad del maíz. En 2010 se colectaron 56 poblaciones de maíz nativo con y sin síntomas de pudrición de mazorca en cinco estados en México en altitudes entre 1498 y 2520 m. En 2010 y 2011, se evaluó la respuesta de las poblaciones de maíz, en tres localidades (Montecillo y Ayapango, Edo. de Méx., y Huamelulpan, Oax.) bajo infección natural de Fusarium spp. y condiciones de temporal. En 2012 se realizó una evaluación en plántula para valorar la virulencia del patógeno y la susceptibilidad/tolerancia de las poblaciones de maíz ante Fusarium spp de distinta procedencia geográfica. En 2013 un análisis isoenzimático para poblaciones de maíz y poblaciones de Fusarium fue necesario para valorar la diversidad genética en el patosistema. La respuesta en campo, mostró diferencias significativas entre las poblaciones de maíz, entre localidades y para la interacción localidades x población en cada ciclo agrícola; se observó que los maíces locales al ambiente de evaluación tienden a presentar menor daño por Fusarium spp. y mayor rendimiento; por la procedencia geográfica, los maíces de Oaxaca presentaron menor daño que los de los estados de México, Puebla, Tlaxcala y Guerrero. Resultado de la prueba en plántula, se observó variación en virulencia del inóculo, fue más virulento el procedente del estado de México, mientras que el del Edo. de Guerrero provocó menor daño. Las poblaciones de maíz respondieron de manera diferencial, al expresar valores de daño distintos a través de los diferentes inóculos a los que fueron sometidos. Las poblaciones de maíz y las de Fusarium spp. mostraron un patrón de agrupación de acuerdo a su procedencia geográfica. La variación observada en el patosistema Maíz- Fusarium spp. por medio del análisis isoenzimático, puede estar relacionada con la variación ecológica en la zona de exploración, localizada entre los 1490 y 2720 msnm, la cual provee amplia variación ecológica, generando diversidad en ambos organismos. Se obtuvieron evidencias experimentales de que los patrones de virulencia de Fusarium y la respuesta del maíz parecen corresponder a la procedencia geográfica (condiciones ecológicas), lo que sugiere la necesidad de profundizar en el estudio de procesos de coevolución. _______________ GENETIC DIVERSITY IN THE MAIZE-Fusarium PATHOSYSTEM IN THE HIGHLANDS OF MEXICO. ABSTRACT: The native (creole) varieties of maize (Zea mays L. ) preserved by farmers through generations, constitute more than 80% of the area planted with maize in Mexico; the Fusarium spp. ear rot could cause yield losses up to 30 %. The study of maize populations and their pathogens as pathosystem makes sense, because in the genetic variation of native maize can be found resistance/tolerance to such disease; the knowledge of the maize and the pathogen structure populations could help to solve the rot problem, increase the grain production and preserve the genetic diversity. In 2010, 56 native maize populations were collected, with and without symptoms of ear rot from five states in Mexico at altitudes between 1498 and 2520 m. In 2010 and 2011, under rainfed conditions and natural infection by Fusarium, the response of maize populations was evaluated in three locations (Montecillo and Ayapango, Edo. de Mex., and Huamelulpan, Oax.). In 2012, the virulence of the pathogen and the susceptibility/tolerance of maize populations to Fusarium spp. of different geographical origin were assessed in seedling stage. In 2013 an isoenzymatic analysis for maize populations and Fusarium populations were required in order to know the genetic diversity in the pathosystem. The field response, showed significant differences between maize populations, between locations and interaction environment x population, was evident that local maize populations in the evaluation environment tend to have less damage by Fusarium spp., and higher grain yield; by geographical origin, maize from Oaxaca should less damage than those from the states of Mexico, Puebla, Tlaxcala and Guerrero. The seedling test showed variation in virulence between sources of inoculum; the most virulent was from the state of Mexico, while the on from Guerrero caused minor damages. Maize populations responded differently, expressing different degree of damage through various sources of inoculum. The maize and Fusarium spp. populations showed a pattern of grouping according to their geographical origin. The variation observed in the maize-Fusarium spp. pathosystem through isoenzyme analysis, may be related to ecological variation in the exploration area, located between 1490 and 2720 m, which provides wide environmental variation, generating diversity in both populations. Experimental evidences were obtained about patterns of Fusarium virulence and maize populations responses that seems correspond with geographical origin (ecological conditions) that may suggest the need of research in order to better insight on coevolution processes.

Doctoral thesis

Diversidad Patosistema Fusarium spp. Maíz nativo Pudrición de mazorca Virulencia Diversity Pathosystem Native maize Ear rot Virulence Genética Doctorado CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Fosfito en la solución nutritiva para el control de Phytophthora cactorum en fresa

JORGE ALBERTO GIL VALENZUELA (2012)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Edafología).- Colegio de Postgraduados, 2012.

Se establecieron plantas de fresa cv. Festival en sistema hidropónico abierto, utilizando como sustrato tezontle, con el objetivo de evaluar el efecto del fosfito en el control pre-infección de la pudrición cuerosa de la fresa ocasionada por Phytophthora cactorum. Los porcentajes del fósforo (P) total en la solución nutritiva en forma de fosfito (Phi) evaluados fueron 0, 5, 10, 15 y 20 %. Las soluciones nutritivas conteniendo Phi se suministraron una única ocasión en cinco riegos con intervalos de 1 h. Dos, cuatro y siete días después del tratamiento con fosfito, los frutos se inocularon con una solución conteniendo P. cactorum a una concentración de 105 zoosporas mL-1. La aplicación foliar de mefenoxam™ (Ridomil Gold 480 SL 45.28%) en la concentración recomendada por el proveedor se utilizó como testigo positivo en el control de P. cactorum. La incidencia de pudrición cuerosa en frutos de fresa se evaluó a los 12 días después de la inoculación de los frutos. Los resultados obtenidos muestran que los diferentes porcentajes del P total en forma de Phi en la solución nutritiva, son igualmente efectivos que mefenoxam™ para el manejo de P. cactorum en un sistema hidropónico abierto. Se observó que la adición de iones Phi en menor cantidad a las recomendadas comercialmente favorece un mejor manejo de la enfermedad, al reducir los costos de producción y contaminación al ambiente. _______________ PHOSPHITE IN THE NUTRIENT SOLUTION FOR THE CONTROL OF Phytophthora cactorum IN STRAWBERRY. ABSTRACT: Strawberry plants cv. Festival were established in an open hydroponic system, using volcanic rock as substrate, in order to evaluate the effect of phosphite (Phi) in the pre-infection management of leather rot of strawberry caused by Phytophthora cactorum. The percentages of total phosphorus (P) as Phi in the nutrient solution evaluated were 0, 5, 10, 15 and 20%. The nutrient solutions containing Phi were supplied only once in five waterings at intervals of 1 h. Two, four and seven days after treatment with Phi, fruits were inoculated with a solution containing P. cactorum at a concentration of 105 zoospores. Foliar application of mefenoxam™ (Ridomil Gold 480 SL 45.28%) in the concentration recommended by the supplier was used as positive control against P. cactorum. The incidence of leather rot in strawberry fruit was assessed 12 days after inoculation. The results show that the different percentages of total P as Phi in the nutrient solution are equally effective as mefenoxam™ in controlling P. cactorum in an open hydroponic system. We observed that the addition of Phi at lower concentrations tan those commercially recommended enables a better management of the disease, as it reduces costs of production and impacts in the environment.

Master thesis

Fragaria ananassa Pudrición cuerosa Mefenoxam Sodio Leather rot Sodium Maestría Edafología CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Caracterización molecular de genes de frijol inducidos en la interacción con Rhizoctonia solani

MARIA DE LA LUZ GUERRERO GONZALEZ (2009)

"El frijol común (Phaseolus vulgaris L) es una de las leguminosas de mayor consumo en el mundo. Sin embargo, su producción es afectada tanto por factores bióticos como abióticos. La pudrición de raíz del frijol, es una de las enfermedades más importantes que afectan la productividad y desarrollo de este cultivo, además se encuentra ampliamente distribuida en México y en diversas regiones del mundo. Entre los principales agentes causales de la enfermedad destacan Rhizoctonia solani y Fusarium spp. Rhizoctonia solani, es un hongo de distribución cosmopolita nativo del suelo y se ha estimado que puede reducir hasta en un 50% la producción de frijol. Este hongo fitopatógeno puede permanecer por varios años en el suelo en forma de esclerocios (masas compactas de micelio) por lo que es difícil erradicarlo. Para aislar genes de frijol que son diferencialmente expresados durante la interacción incompatible con Rhizoctonia solani, desarrollamos una genoteca sustractiva por medio de la técnica de hibridación substractiva por supresión (SSH). La SSH se realizó empleando el cDNA de raíces de frijol inoculas con Rhizoctonia solani como la condición problema y el cDNA de raíces no inoculadas así como de una proporción de micelio de Rhizoctonia solani crecido por separado como condición control, todos colectados a las 8 y 16 h de interacción.En total se obtuvieron 179 agrupamientos (contigs) que equivalen a 136 genes únicos (uni-genes) de 300 clonas secuenciadas. Estos uni-genes se clasificaron en 12 categorías funcionales, metabolismo primario (10%),metabolismo secundario (12%), defensa (8%), respuesta a estrés (11%),transporte (8%), síntesis de proteínas (6%), componente celular (5%), degradación de proteínas (2%), factores de transcripción (2%), transducción de señales (2%), proteínas de función desconocida (10%) y secuencias sin identidad (24%)."

"The common bean (Phaseolus vulgaris L) is one of the legumes of greater consumption in the world. However, its production is affected by biotic and abiotic stresses. Common bean root rot, is one of the most important diseases affecting the growth and productivity of this crop, having a wide distribution in Mexico and diverse regions of the world. Among the main causal agents are Rhizoctonia solani and Fusarim spp. Rhizoctonia solani, is a fungus of cosmopolitan distribution native of the soils and it has been estimated that it can reduced up to 50% the production of common bean. This phytopathogenic fungus is able to remain several years in soil in the form of sclerotia (compact mases of hypha) being difficult to eradicate. In order to isolated common bean genes differentially expressed during the incompatible interaction with Rhizoctonia solani, we constructed a Suppresive Substractive Hybridization Library (SSH). The SSH was generated using the cDNA of common bean roots inoculated with Rhizoctonia solani as tester and the cDNA of non-inoculated common bean roots plus a proportion of Rhizoctonia solani micelia as the driver or control condition. All this samples were collected after 8 and 16 h of interaction. From 300 sequenced clones, we obtained a total of 179 contigs equivalent to 136 unigenes. These unigenes were classified in 12 functional categories, primary metabolism (10%), secondary metabolism (12%), defense (8%), response to stress (11%), transport (8%), protein synthesis (6%), cellular component (5%), protein degradation (2%), transcription factors (2%), signal transduction (2%), proteins of unknown function (10%), and sequences with no identity (24%)."

Master thesis

Hibridación substractiva por supresión Rhizoctania solani Pudrición de raiz Phaseolus vulgaris L Receptor -CRK Arabidopsis thaliana BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA MOLECULAR