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Una extensión de la prueba exacta incondicionada de Barnard a no inferioridad

MAGIN ZUÑIGA ESTRADA (2013)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Estadística).- Colegio de Postgraduados, 2013.

En 1945, George Alfred Barnard presentó una prueba exacta incondicional para comparar dos proporciones independientes. Por construcción, las regiones críticas para esta prueba satisfacen la propiedad, muy útil, de ser conjuntos convexos de Barnard. Además, se cree que esta prueba es la más potente de entre las pruebas exactas incondicionales para dos proporciones independientes, pero no existe prueba de esta conjetura. Los cálculos de las regiones críticas de la prueba de Barnard son complicados debido a que son construidas iterativamente hasta que el tamaño de la prueba obtenido se encuentre tan cercano como sea posible y menor o igual al nivel de significancia nominal. En esta investigación se propone una extensión de la prueba de Barnard a hipótesis de no inferioridad cuando la medida de disimilaridad es la diferencia entre proporciones. Además, se calculan regiones críticas para esta prueba extendida para tamaños de muestra menores o iguales a 30, niveles de significancia nominales de 0.01, 0.025, 0.05 y 0.1, y para márgenes de no inferioridad de 0.0, 0.05, 0.1, 0.15 y 0.2. Adicionalmente, se calculan tamaños de prueba para las configuraciones mencionadas. Para hacer estos cálculos se escribió un programa en el entorno R. _______________ AN EXTENSION OF THE BARNARD UNCONDITIONAL EXACT TEST FOR NONINFERIORITY. ABSTRACT: In 1945, George Alfred Barnard presented an unconditional exact test to compare two independent proportions. By construction, the critical regions for this test have the very useful property of being Barnard convex sets. Besides, it is believed that this test is the most powerful among the unconditional exact tests for two independent proportions, but there is no proof of this conjecture. Calculations of critical regions of Barnard's test are complicated because they are constructed iteratively until the test size obtained is as close as possible and less than or equal to the nominal significance level. In this investigation we propose an extension to non-inferiority hypotheses when the dissimilarity measure is the difference between proportions. Also, we calculate the critical regions for this extended test for sample sizes less than or equal to 30, nominal significance level 0.01, 0.025, 0.05 and 0.10 and for non-inferiority margins 0, 0.05, 0.10, 0.15 and 0.20. Additionally, we computed test sizes for the mentioned configurations. To do these calculations, we wrote a program in the R environment.

Master thesis

Prueba de Barnard Prueba Exacta No Inferioridad Prueba Incondicional Región Crítica Tamaño de Prueba Bernard Test Exact Test Non-inferiority Unconditional Test Critical Region Test Size Estadística Maestría CIENCIAS SOCIALES

Corrección por continuidad para la prueba asintótica de no-inferioridad de Laster-Johnson-Kotler para dos proporciones independientes

YONI MIGUEL CASTILLO TZEC (2013)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Estadística).- Colegio de Postgraduados, 2013.

Las pruebas asintóticas de no-inferioridad se usan frecuentemente en ensayos clínicos.

El criterio del ‘al menos tan bueno como’ fue introducido por Laster et al. [17] para datos

dicotómicos. En este enfoque (LJK), el margen de no-inferioridad se considera como un

porcentaje del tratamiento activo, en lugar de una diferencia fija. Este procedimiento ha

mostrado ser más eficiente que el enfoque de una diferencia fija produciendo tamaños de

muestra más pequeños. También, el procedimiento presenta varias ventajas en su diseño, eficiencia estadística e interpretación de las pruebas de no-inferioridad. Sin embargo, el procedimiento de LJK tiene la desventaja de que el tamaño de la prueba es usualmente mayor que el nivel de significancia nominal especificado o requerido ( ). En este trabajo, mediante el uso de factores de corrección por continuidad, se ha ajustado el procedimiento para evitar este inconveniente. _______________ CONTINUITY CORRECTION FOR THE LASTER-JOHNSON-KOTLER NON-INFERIORITY ASYMPTOTIC STATISTICAL TEST FOR TWO INDEPENDENT PROPORTIONS. ABSTRACT: Non-inferiority asymptotic statistical tests are frequently used in clinical trials. The ‘at least as good’ criterion was introduced by Laster, et al. [17] for dichotomous data. In this approach (LJK), the margin of non-inferiority is taken as a percentage of the control response, rather than a fixed difference. The procedure is seen to be more efficient than the fixed margin approach yielding smaller sample sizes. Also, the procedure offers several advantages in the design, statistical efficiency and interpretability of non-inferiority trials. However, the LJK procedure has the disadvantage that its test size is usually much greater than the specified or required nominal significance level ( ). In this paper, by using a continuity correction factor, we have adjusted this procedure to solve this drawback.

Master thesis

No-inferioridad Datos dicotómicos Tamaño de prueba Prueba de Laster-Johnson-Kotler Corrección por continuidad Non-inferiority Dichotomous data Test size Laster-Johnson-Kotler test Continuity correction Estadística Maestría CIENCIAS SOCIALES

Una expresión explícita para la potencia media de pruebas de no inferioridad para la comparación de proporciones

EMMANUEL ANGUIANO MONDRAGON (2013)

Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista en Estadística).- Colegio de Postgraduados, 2013.

Las pruebas de no-inferioridad para comparar proporciones son frecuentemente empleadas en los ensayos clínicos con el objeto de verificar si hay evidencia muestral de que un tratamiento nuevo no es significativamente inferior en eficacia al tratamiento estándar, donde el tratamiento nuevo presenta algunas ventajas sobre el tratamiento estándar como por ejemplo: tener menos efectos secundarios, ser más barato o ser más fácil de aplicar. Un buen número de pruebas de no-inferioridad se han reportado en la literatura. Desafortunadamente, las comparaciones de las pruebas de no inferioridad reportadas hasta ahora son insatisfactorias pues se han realizado utilizando simulaciones o aproximaciones gruesas. Utilizando el concepto de “potencia media”, Martín-Andrés y Silva-Mato [20] desarrollaron un método nuevo para comparar las potencias de pruebas exactas de superioridad para la diferencia de proporciones. En este trabajo, este método se ha extendido para la comparación de potencias de pruebas exactas de no-inferioridad. Para ilustrar la aplicación de este método, hemos comparado dos pruebas exactas de no-inferioridad comúnmente usadas en la práctica para comparar proporciones: la prueba de Razón de Verosimilitudes (RV) y la prueba de Farrington-Manning (FM). Se obtiene como conclusión que, basados en este método, la prueba RV tiene mayor potencia media que la prueba FM. _______________ AN EXPLICIT EXPRESSION FOR THE MEAN POWER OF NON-INFERIORITY TESTS FOR THE COMPARISON OF PROPORTIONS. ABSTRACT: Noninferiority tests for comparing two proportions are frequently used in practical applications, for instance in the important field of clinical trials. The objective is to verify, based on sample data, that a new treatment with few side effects, or low cost, or easier to use, is not significantly inferior in efficacy to the standard treatment. There are several noninferiority tests for comparing two proportions reported in the literature. Unfortunately, the reported comparisons of powers of noninferiority tests are based on simulations or gross approximations. By using the concept of “mean power”, Martin-Andres and Silva-Mato [20] developed a new method to compare the powers of superiority tests for the difference of proportions. In the present work, this method is extended to the comparison of powers of noninferiority exact tests. To illustrate this new method we have compared two popular noninferiority exact tests for the difference of proportions: the Likelihood Ratio test (LR) and the Farrington-Manning test (FM). Based on the methodology developed in this work, we have obtained the conclusion that the LR test has greater mean power than the FM test.

Doctoral thesis

Pruebas de no-inferioridad Potencia Potencia media Tamaños de prueba Non-inferiority tests Power Mean power Test size Estadística Doctorado CIENCIAS SOCIALES

Insights into the high-energy γ -ray emission of markarian 501 from extensive multifrequency observations in the fermi era

Alberto Carramiñana Alonso Luis Carrasco Bazúa (2011)

We report on the γ -ray activity of the blazar Mrk 501 during the first 480 days of Fermi operation. We find that the average Large Area Telescope (LAT) γ -ray spectrum of Mrk 501 can be well described by a single power-law function with a photon index of 1.78 ± 0.03. While we observe relatively mild flux variations with the Fermi-LAT (within less than a factor of two), we detect remarkable spectral variability where the hardest observed spectral index within the LAT energy range is 1.52 ± 0.14, and the softest one is 2.51 ± 0.20. These unexpected spectral changes do not correlate with the measured flux variations above 0.3 GeV. In this paper, we also present the first results from the 4.5 month long multifrequency campaign (2009 March 15—August 1) onMrk 501, which included the Very Long Baseline Array (VLBA), Swift, RXTE, MAGIC, and VERITAS, the F-GAMMA, GASP-WEBT, and other collaborations and instruments which provided excellent temporal and energy coverage of the source throughout the entire campaign. The extensive radio to TeV data set from this campaign provides us with the most detailed spectral energy distribution yet collected for this source during its relatively low activity. The average spectral energy distribution of Mrk 501 is well described by the standard one-zone synchrotron self-Compton (SSC) model. In the framework of this model, we find that the dominant emission region is characterized by a size ≲0.1 pc (comparable within a factor of few to the size of the partially resolved VLBA core at 15–43 GHz), and that the total jet power (≃10⁴⁴ erg s⁻¹) constitutes only a small fraction (∼10⁻³) of the Eddington luminosity. The energy distribution of the freshly accelerated radiating electrons required to fit the time-averaged data has a broken power-law form in the energy range 0.3 GeV–10 TeV, with spectral indices 2.2 and 2.7 below and above the break energy of 20 GeV.We argue that such a form is consistent with a scenario in which the bulk of the energy dissipation within the dominant emission zone of Mrk 501 is due to relativistic, proton-mediated shocks. We find that the ultrarelativistic electrons and mildly relativistic protons within the blazar zone, if comparable in number, are in approximate energy equipartition, with their energy dominating the jet magnetic field energy by about two orders of magnitude.

Article

Acceleration of particles – BL Lacertae objects General – BL Lacertae objects Individual (Mrk 501)– galaxies Active – gamma rays General – radiation mechanisms Non-thermal CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA ASTRONOMÍA Y ASTROFÍSICA ASTRONOMÍA Y ASTROFÍSICA

Una prueba robusta para detectar heterogeneidad de varianzas en un diseño experimental completamente al azar

ANNEL HURTADO JARAMILLO (2013)

Tesis (Maestría en Ciencias, especialista en Estadística).- Colegio de Postgraduados, 2013.

Uno de los supuestos más importantes del ANOVA es que las varianzas de las poblaciones estudiadas son iguales. Una prueba para verificar homogeneidad de varianzas es la prueba de Levene la cual es relativamente sensible a desviaciones de normalidad, se han propuesto algunas modificaciones logrando pruebas más robustas, sin embargo, no han sido del todo satisfactorias. Por lo que, este trabajo tiene como objetivo proponer una prueba robusta para heterogeneidad de varianzas usando el principio de transformación a rangos sobre el valor absoluto de los residuos. Mediante simulación Monte Carlo se comparó la potencia y el tamaño de la prueba propuesta con distintas variantes de la prueba de Levene. Los resultados de la simulación muestran que la prueba de Levene basada en medianas es muy conservadora en muestras pequeñas (n=5) y que la prueba de Nordstokke-Zumbo (2010) tiene tamaños de prueba que tienden a incrementar conforme aumenta el tamaño de efecto. La prueba propuesta resultó ser más potente que la prueba de Levene basada en medianas cuando la distribución de los errores corresponde a distribuciones con colas pesadas. _______________ ROBUST TEST TO DETECT HETEROGENEITY OF VARIANCES IN A COMPLETELY RANDOMIZED DESIGN. ABSTRACT: One of the most important assumptions of ANOVA is that the variances of the populations studied are equal. Levene's test for homogeneity of variances is relatively sensitive to deviations from normality, some modifications have been proposed achieving more robust evidence, however, were not entirely satisfactory. This paper suggests a robust test for homogeneity of variances which is based on the principle of rank transformation on the absolute value of the residuals. Monte Carlo simulation was performed to compare the power and size of the proposed test with the different variants of the Levene's test. Simulation results show that the Levene's test based on medians is quite conservative for small sample sizes (n = 5), Nordstokke- Zumbo's (2010) test has sizes which tend to increase with increasing e_ect size. The proposed test was more powerful than the Levene's test based on medians from when the error distribution is double exponential and student's t distribution.

Master thesis

No normalidad Potencial de una prueba Prueba de Levene Robustez Tamaños de prueba Transformación a rangos Leven´s test Non-normality Power of test Rank transformation Robustness Test´s size Estadística Maestría CIENCIAS SOCIALES

Proteomic analysis of non-toxic Jatropha curcas byproduct cake: fractionation and identification of the major components

ANDRES LEON VILLANUEVA JOSE ANGEL HUERTA OCAMPO ALBERTO BARRERA PACHECO SERGIO MEDINA GODOY ANA PAULINA BARBA DE LA ROSA (2018)

"Jatropha curcas non-toxic genotypes have been reported in Mexico and the press-cake, after oil extraction, represents a potential of new source of protein for food and feed uses. However, the characterization of the press-cake proteins is still unknown. The aim of this work was to carry out the molecular characterization of J. curcas seed storage proteins. Proteins in press-cake were pre-fractionated according to the classical Osborne procedure. Main protein fraction in J. curcas cake was represented by glutelins, the electrophoretic analysis showed that glutelins and globulins have the same profile, indicating that oil extraction process could have effect on globulins agglomeration. Protein fractions were analyzed by two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry, results provide a new dataset of protein species or proteoforms that are accumulated in J. curcas endosperm. The identification of toxic proteins such as curcin in the non-toxic variety could represent that this protein have important roles in seeds. Regulatory proteins such as proteasome subunits and 14-3-3 were identified. A group of different heat shock and stress defense protein species was detected. Proteases related with inhibitory activity against DPPIV were also detected; this could support the potential use of J. curcas cake as nutraceutical food."

Article

Jatropha curcas LC–MS/MS Mass spectrometry Non-toxic Proteome Seed storage proteins BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA MOLECULAR BIOLOGÍA MOLECULAR

Production of biodiesel from roasted chicken fat and methanol: free catalyst

JORGE RAMIREZ_ORTIZ MERCED MARTINEZ ROSALES Horacio Flores Zúñiga (2014)

"Transesterification reactions free of catalyst between roasted chicken fat with methanol were carried out in a batch reactor in order to produce biodiesel to temperatures from 120°C to 140°C. Parameters related to the transesterification reactions, including temperature, time and the molar ratio of chicken fat to methanol also investigated. The maximum yield of the reaction was of 98% under conditions of 140°C, 4 h of reaction time and a molar ratio of chicken fat to methanol of 1:31. The biodiesel thus obtained exhibited a viscosity of 6.3 mm2/s and a density of 895.9 kg/m3. The results showed this process can be right choice to produce biodiesel since this process does not use any catalyst. Therefore, the steps of neutralization and washing are avoided, indispensables in the case of the alkaline catalysis."

Article

Bodiesel Non-catalyst Roasted chicken fat Transesterification BIOLOGÍA Y QUÍMICA QUÍMICA QUÍMICA

Changes in body size spectra of benthic caridean shrimps (Decapoda: Caridea) and snails (Gastropoda) as response to seasonal variability

ERNESTO IVAN BADANO (2016)

"Ecologists have been largely interested in the description and understanding of the power scaling relationships between body size and abundance of organisms. Many studies have focused on estimating the exponents of these functions across taxonomic groups and spatial scales, to draw inferences about the processes underlying this pattern. The exponents of these functions usually approximate -3/4 at geographical scales, but they deviate from this value when smaller spatial extensions are considered. This has led to propose that body size-abundance relationships at small spatial scales may reflect the impact of environmental changes. This study tests this hypothesis by examining body size spectra of benthic shrimps (Decapoda: Caridea) and snails (Gastropoda) in the Tamiahua lagoon, a brackish body water located in the Eastern coast of Mexico. We measured water quality parameters (dissolved oxygen, salinity, pH, water temperature, sediment organic matter and chemical oxygen demand) and sampled benthic macrofauna during three different climatic conditions of the year (cold, dry and rainy season). Given the small size of most individuals in the benthic macrofaunal samples, we used body volume, instead of weight, to estimate their body size. Body size-abundance relationships of both taxonomic groups were described by tabulating data from each season into base-2 logarithmic body size bins. In both taxonomic groups, observed frequencies per body size class in each season were standardized to yield densities (i.e., individuals/m3). Nonlinear regression analyses were separately performed for each taxonomic group at each season to assess whether body size spectra followed power scaling functions. Additionally, for each taxonomic group, multiple regression analyses were used to determine whether these relationships varied among seasons. Our results indicated that, while body size-abundance relationships in both taxonomic groups followed power functions, the parameters defining the shape of these relationships varied among seasons. These variations in the parameters of the body size-abundance relationships seems to be related to changes in the abundance of individuals within the different body size classes, which seems to follow the seasonal changes that occur in the environmental conditions of the lagoon. Thus, we propose that these body size-abundance relationships are influenced by the frequency and intensity of environmental changes affecting this ecosystem."

Article

Allometry Energetic equivalence México Non-equilibrium, Power functions Seasonal changes BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA

Fisiología y tecnología postcosecha del chile habanero (Capsicum chinense Jacq.)

YANIK IXCHEL MALDONADO ASTUDILLO JAVIER JIMENEZ HERNANDEZ RICARDO SALAZAR LOPEZ (2020)

Capsicum chinense Jacq. Pertenece a la familia Solanaceae y es ampliamente conocido en el mundo. En México se conoce como chile habanero y representa parte de la tradición e identidad cultural de México; sus cualidades y prestigio permitieron la otorgarle la denominación de origen "chile habanero de la Península de Yucatán"

Al Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT) por el financiamiento del proyecto con título: Análisis de los cambios metabolómicos durante el desarrollo del fruto Capsicum chinense Jacq cultivado en diferentes tipos de suelo con No. 257588 correspondiente a la convocatoria CB-2015-01.

Capsicum chinense Jacq. It belongs to the Solanaceae family and is widely known in the world. In Mexico it is known as "chile habanero" and represents part of the tradition and cultural identity of Mexico; its qualities and prestige allowed the granting of the denomination of origin "chile habanero de la Península de Yucatán"

Book part

Climatérico Vida de anaquel No climatérico Respiración Climateric Shelf life Non climacteric Respiration CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS AGRONOMÍA

Sostenibilidad de dalea lutea en bosque mixto y pastizal en tenancingo, Estado de México

PEDRO SALDIVAR IGLESIAS ANTONIO LAGUNA CERDA CLAUDIO ESQUIVEL ALVAREZ CARLOS ERNESTO GONZALEZ ESQUIVEL (2012)

Sostenibilidad de Dalea luteaen bosque mixto y pastizal en Tenancingo, Estado de México. El objetivo del presente trabajo fue analizar la dinámica poblacional, el comportamiento anual y evaluar la sostenibilidad ecológica de una población deD. lutea(Cav.) Willd. La presente investigación se llevó a cabo en la comunidad de Chalchihuapán, Tenancingo Estado de México (México) durante el periodo de otoño 2002 a otoño 2004. Se evaluó una población de Dalea lutea (Cav.) Willd. en bosque mixto y en pastizal inducido. Se marcaron para ello cuatro parcelas por zona y se clasificaron los individuos en tres tipos: plántulas, juveniles y adultas; los datos se trataron con análisis de varianza, prueba de medias y fórmulas de sostenibilidad. La población de D. luteaaumentó durante el verano-otoño y disminuyó durante el periodo invierno-primavera. Los muestreos presentaron diferencias estadísticas para plántulas y juveniles, no así en adultas, pero cuando estas clases se evaluaron dentro de las zonas no difirieron estadísticamente; el mayor número de individuos se reportó durante el verano, otoño e invierno de 2003. Respecto a sostenibilidad, el pastizal mostró al final del periodo un restablecimiento de 59,5 y 41% para plántulas y plantas adultas, respectivamente, y una disminución de 79% en juveniles. Mientras que en bosque mixto las plántulas y las juveniles decrecieron en 4,4 y 16,2%, y las adultas se restablecieron en 25,1%. La población de D. luteaaumentó o disminuyó conforme la época de muestreo, y el número de individuos estuvo afectado por la precipitación. Bajo las condiciones actuales de recolecta, la población de D. lutease mantuvo estable en bosque mixto y se restableció mejor en la zona de pastizal.

Universidad Autónoma del Estado de México

Article

Cestería dinámica poblacional Productos forestales no maderables Basketry Non-timber forest products Population dynamics CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA