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Análisis y comparación genómica de Pseudomonas fluorescens UM270: una cepa con capacidades de biocontrol y promoción del crecimiento vegetal

Julie Eliene Hernández Salmerón (2016)

Instituto de Investigaciones Agropecuarias y Forestales. Instituto de Investigaciones sobre los Recursos Naturales. Instituto de Investigaciones Químico Biológicas. Facultad de Biología. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Facultad de Químico Farmacobiología. Programa Institucional de Doctorado en Ciencias Biológicas

In the present study the analysis of the genomic sequence of a plant growth promoting bacterium Pseudomonas fluorescens UM270 was carried out, which has shown the capacity to produce volatile and diffusible compounds that participate in the protection and growth promotion in plants of Medicago truncatula in vitro assays. The strain P. fluorescens UM270 was isolated from the rhizosphere of Medicago sp. The genome of this bacterium is contained in a single circular chromosome, no plasmids were detected, with a size of 6,050,830bp, GC content of %60.8 and contains 5,388 coding DNA sequences (CDS). A phylogenetic analysis was performed and it was found that UM270 is related to the strain P. fluorescens Pf0-1, which was used as reference genome to carry out the ordering of the genes and to construct the chromosomal map of UM270. Additionally, the genomic comparison of this strain was carried out with seven complete P. fluorescens genomes. In this comparison, the functions were grouped according to the SEED database and highlighted those as more abundant related to metabolism, signaling, stress response, virulence, disease and defense, which are essential functions for survival. Furthermore, we determined the "core-genome" of the species P. fluorescens, which contains 3,039 genes. In this analysis it was observed that the UM270 strain contains a larger number of CDS shared with the genome of P. fluorescens F113. In addition, we identified the number of unique genes in the UM270 genome with 599 CDS, of which 192 have a reported function in other organisms and the remaining 407 are still unknown, which opens the possibility of further research.

En el presente estudio se llevó a cabo el análisis de la secuencia genómica de una bacteria promotora del crecimiento vegetal Pseudomonas fluorescens UM270, la cual ha mostrado la capacidad de producir compuestos volátiles y difusibles que participan en la protección y promoción de crecimiento en plantas de Medicago truncatula en ensayos in vitro. La cepa P. fluorescens UM270 fue aislada de la rizósfera de plantas de Medicago sp. El genoma de esta bacteria está contenido en un solo cromosoma circular, no se detectaron plásmidos, con un tamaño de 6,050,830pb, un porcentaje de contenido de GC de 60.8 y contiene 5,388 secuencias codificantes (CDS). Se realizó un análisis filogenético y se encontró que UM270 se encuentra relacionada a la cepa P. fluorescens Pf0-1, la cual se empleó como genoma de referencia para realizar el ordenamiento de los genes y construir el mapa cromosómico de UM270. Adicionalmete, se llevó a cabo la comparación genómica de esta cepa con siete genomas completos de P. fluorescens. En esta comparación se agruparon las funciones de acuerdo a la base de datos de SEED y resaltaron aquellas como más abundantes las relacionadas al metabolismo, señalización, respuesta al estrés, virulencia, enfermedad y defensa; que son funciones indispensables para la sobrevivencia. Por otro lado, se determinó el “coregenoma” de la especie P. fluorescens, el cual contiene 3,039 genes; en este análisis se observó que la cepa UM270 contiene un mayor número de CDS homólogos con el genoma de P. fluorescens F113. Además, se identificó el número de genes únicos con que cuenta el genoma de UM270 con 599 CDS, de los cuales 192 cuentan con función reportada en otros organismos y los 407 restantes son aún desconocidos, lo cual abre la posibilidad de nuevas investigaciones al respecto.

Doctoral thesis

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA IIQB-D-2016-1596 Opción en Biología Experimental Core-genoma Expresión

Análisis de la expresión de los genes marcadores de las vías de respuesta a estrés biótico y deficiencia de hierro mediada por la dimetilhexadecilamina en plantas de Medicago truncatula

Vicente Montejano Ramírez (2021)

Instituto de Investigaciones Agropecuarias y Forestales. Instituto de Investigaciones sobre los Recursos Naturales. Instituto de Investigaciones Químico Biológicas. Facultad de Biología. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Facultad de Químico Farmacobiología. Programa Institucional de Doctorado en Ciencias Biológicas

Plants interact with both biotic and abiotic factors through different molecular and biochemical mechanisms. In the presence of pathogenic microorganisms or insects, plants activate different defense pathways with the participation of phytohormones, such as salicylic acid (SA), jasmonic acid (JA), and ethylene (ET), among others. The scarce availability of nutrients in the soil also generates changes, such is the case of iron (Fe) deficiency during which genes involved in the reduction and transport of this element are activated. In addition, beneficial bacteria, known as Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR), promote resistance to biotic and abiotic stress in plants through different processes, including the emission of volatile organic compounds (VOC). In the present work we evaluate the effect of the VOC dimethyl hexadecylamine (DMHDA) produced by the PGPR Arthrobacter agilis UMCV2 on the growth of Medicago truncatula and on the expression of the defense genes MtWRKY70, MtNPR4, MtMYC2 and MtDef2.1 and the genes MtbHLH38, MtbHLH39, MtFIT and MtFRO3 which respond to Fe deficiency. We observed that unlike AS and AJ that activate the SAR and ISR pathways, respectively, DMDHA increased the expression of genes corresponding to both pathways. However, induction is minimal for the genes MtWRKY70, MtNPR4, and MtMYC2; and marked for MtDef2.1. Furthermore, DMHDA promoted M. truncatula growth and induced the expression of the genes involved in the uptake of Fe, mainly of the MtbHLH38 and MtbHLH39 transcription factors; these results contrast with SA and JA, since these phytohormones inhibited the expression of iron deficiency response genes and decreased plant growth. The increase in the expression of defense genes correlated with greater resistance to the pathogens Botrytis cinerea and Pseudomonas syringae in plants treated with DMDHA. In conclusion, DMHDA activates biotic and abiotic stress resistance through an alternate pathway to SA and JA.

Las plantas interactúan tanto con factores bióticos como abióticos a través de mecanismos moleculares y bioquímicos. Ante la presencia de microorganismos o insectos patógenos, las plantas activan diferentes vías de defensa, en las cuales participan fitohormonas como el ácido salicílico (AS), el ácido jasmónico (AJ), el etileno (ET), entre otras. La escasa disponibilidad de nutrientes en el suelo, también genera cambios en las plantas, tal es el caso de la deficiencia de hierro (Fe) durante la cual se activan genes involucrados en la reducción y en el transporte de este elemento. Adicionalmente, existen bacterias benéficas conocidas como rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPR, por sus siglas en inglés de Plant Growth Promoting Rhizobacteria) que favorecen la resistencia al estrés biótico y al abiótico mediante distintos procesos, incluyendo la emisión de compuestos orgánicos volátiles (COV). En el presente trabajo evaluamos el efecto del COV dimetilhexadecilamina (DMHDA) producido por la PGPR Arthrobacter agilis UMCV2 sobre el crecimiento de Medicago truncatula y en la expresión de los genes de defensa MtWRKY70, MtNPR4, MtMYC2 y MtDef2.1 y los genes de respuesta a deficiencia de Fe MtbHLH38, MtbHLH39, MtFIT y MtFRO3. A diferencia del AS y el AJ que activan las vías de SAR e ISR respectivamente, la DMDHA aumentó la expresión de los genes correspondientes a ambas vías. Sin embargo, la inducción es ligera para el caso de los genes MtWRKY70, MtNPR4, MtMYC2 y marcada para el gen MtDef2.1. Además, la DMHDA promovió el crecimiento de M. truncatula e indujo la expresión de los genes involucrados en la toma de Fe, principalmente de los factores de transcripción MtbHLH38 y MtbHLH39; estos resultados contrastan con aquellos obtenidos para el caso del AS y AJ, puesto que estas fitohormonas inhibieron la expresión de los genes de respuesta a deficiencia de hierro y disminuyeron el crecimiento. El aumento en la expresión de los genes de defensa correlacionó con una mayor resistencia a los patógenos Botrytis cinerea y Pseudomonas syringae en plantas tratadas con DMDHA. En conclusión la DMHDA activa la resistencia a estrés biótico y abiótico a través de una vía alterna al AS y AJ.

Doctoral thesis

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA IIQB-D-2021-0364 Biología Experimental Patógenos Hierro Expresión

Actividad antifúngica desnakina de aguacate nativo mexicano (Persea americana var. drymifolia) producida en el sistema heterólogo Escherichia coli-pMAL

Marco Antonio Hernández Martínez (2016)

Instituto de Investigaciones Químico Biológicas. Maestría en Ciencias en Biología Experimental

Protein heterologous expression is a technique used to produce large quantities of proteins that are of particular interest to medical, industrial and agricultural research. Consists in the protein synthesis by a foreign organism. The most widely used host organisms are yeasts, mammalian cells and bacteria, due to low costs and levels of protein production, bacterial systems are the most used. In this work we reported the production of avocado snaking PaSn functionally active by heterologous expression in Escherichia coli strain ER2523. The peptide fused to the Maltose binding protein (MBP) resulted was not toxic for the strain. The MBP inhibits the biological function of snaking PaSn it favors the solubility of the peptide avoiding the formation of inclusion bodies and presents affinity to amylose used in the first step of purification by affinity chromatography. It was obtained an optimum performance with purification system established achieving 30% of the fusion protein MBP-snaking PaSn. Optimal performance with established purification system was obtained, achieving 30% of the fusion protein MBP-snaking PaSn. To release the peptide snaking PaSn of the fusion protein was use protease Factor Xa. The digestion with protease generated a peptide with size of 8 kDa similar to what was expected. In vitro tests showed that the purified peptide showed antifungal activity against Colletotrichum gloeosporioides and Botrytis cinerea phytopathogens of agronomical importance at concentrations of 150 μg/mL.

La expresión heteróloga es una técnica utilizada para producir grandes cantidades de proteínas que son de especial interés a nivel médico, industrial y agronómico. Consiste en la síntesis de una proteína en un organismo distinto al nativo. Los organismos hospederos más utilizados son levaduras, células de mamífero y bacterias, siendo estos últimos los más utilizados debido a su bajo costo de producción. En el presente trabajo se demostró la producción de un péptido antimicrobiano vegetal, snakina PaSn de aguacate “nativo mexicano” (Persea americana var. drymifolia), funcionalmente activo, por expresión heteróloga en Escherichia coli cepa ER2523. El péptido fusionado a la Proteína de unión a maltosa (MBP por sus siglas en inglés) no resultó ser tóxico para la cepa. La MBP inhibe la función biológica de snakina PaSn, favorece la solubilidad del péptido evitando la formación de cuerpos de inclusión y presenta afinidad a amilosa utilizada en el primer paso de purificación por cromatografía de afinidad. Se obtuvo un óptimo rendimiento con el sistema de purificación establecido, consiguiendo un 30% de la proteína de fusión MBP-snakina PaSn. Para liberar al péptido snakina PaSn de la proteína de fusión, se utilizó la proteasa Factor Xa. La digestión con la proteasa generó un péptido con un tamaño de 8 KDa similar al esperado. En los ensayos in vitro, se demostró que el péptido presentó actividad contra Colletotrichum gloeosporioides y Botrytis cinérea, fitopatógenos de importancia agronómica, a una concentración de 150 μg/mL de snakina PaSn.

Master thesis

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA IIQB-M-2016-1387 Expresión heteróloga Péptido antimicrobiano Proteína de unión a maltosa

Estudio de la interactómica in vivo del baculovirus SfNPV-Ar en su hospedero Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae)

JONATAN CARMEN RANGEL NUÑEZ (2021)

Spodoptera frugiperda es la plaga de mayor importancia para la producción de maíz en América; con el peligro de extenderse al resto del mundo. Actualmente el control de esta plaga está migrando hacia alternativas a las que no presente resistencia, dentro de las cuales se encuentra un baculovirus denominado SfNPV-Ar. Este microorganismo ha mostrado a nivel de laboratorio y campo su potencial para ser usado en el control del gusano cogollero S. frugiperda. La alta virulencia mostrada por el virus llevó a realizar un estudio transcriptómico y proteómico, para determinar el efecto del virus en las células columnares del intestino medio de S. frugiperda. Como resultado de la secuenciación e identificación de los genes y proteínas regulados por la infección a las 6, 12 y 24 hpi, se obtuvo que el virus induce un sistema de defensa basado en el aumento de la concentración de peróxido. Al mismo tiempo que se apaga la expresión de un modulador de la producción de especies reactivas de oxígeno, se determinó que el virus induce desde las etapas tempranas de la infección, un aumento en los genes relacionados al tráfico de lípidos

en el citoplasma, el cual podría ser causado por el aumento de las necesidades energéticas de las células o bien por la oxidación lipídica que sufre la membrana celular al acumularse el peróxido. De igual manera se determinó una sobre expresión de genes involucrados en el rearreglo del citoesqueleto, así como un arresto del ciclo celular, entre las 6 y 12 hpi, coincidiendo con las etapas previas al inicio del ensamble de las núcleo cápsides. Finalmente, a las 24 hpi, se determinó que la infección viral apagaba los procesos de rearreglo del citoesqueleto, metabolismo y arresto del ciclo celular, mientras que genes y proteínas relacionadas con la activación de la apoptosis fueron sobre expresados. Esto último podría estar relacionado al fenómeno por el cual el intestino infectado por baculovirus es el único de los tejidos que se recupera de la infección. Esta investigación aporta nuevo conocimiento en el desarrollo del proceso de infección de los baculovirus y sus hospederos, y permitirá entender como estas relaciones co-evolutivas virus-huésped, inciden en la efectividad de los baculovirus como agentes de control biológico, para así poder optimizar en el futuro, su uso como tal.

The fall armyworm is the most important pest in the maize production in the Americas continent. The control of the pest is carried out primarily by chemical products, but alternatives of control are gaining importance, alternatives like the use of the entomopathogenic virus SfNPV-Ar, this virus shows high virulence against the fall arming worm in laboratory and field. The aims of this work were to identify the effect of the primary infection by the determination of the regulation of gens and protein in three times post infection (6, 12 and 24 h). As a result of the transcriptomic and proteomic identification we found an induction of cellular defense by the accumulation of peroxide; but at the same time, the virus down regulates the main productor system of reactive oxygen species. In the other hand the infection increases the expression of genes and proteins related with mobility of cytoplasm lipids and metabolism, the cytoskeleton reorganization and cell cycle arrest, all above between the 6 and 12 hours post infection; according with the beginning of the replication of the NC. Finally, 24 hours post infection the infected cells showed a down regulation of genes and proteins related with cytoskeletal, metabolism and cell cycle arrest; at this time, the cells showed an upper regulation of genes and proteins whose function was associated to the activation of the apoptotic prosses. All above showed

how the virus took the control of the cellular machinery to control de cellular proliferation, grew up and activated defense mechanism against reactive oxygen species, in the first hours post infection, in the latest times all mechanism was shut down followed by an apoptosis signal. This could answer why the intestine was the only tissue that did recovery from de viral infection. This research brings new knowledge in the development of the infection process of baculoviruses and their hosts and will allow understanding of how these co-evolutionary virus-host relationships affect the effectiveness of baculoviruses as biological control agents so that they can optimize their use as such in the future.

Doctoral thesis

CIS- Doctorado en Biociencias CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS AGROQUÍMICA Interactómica Gusano cogollero – Control biológico Baculovirus SfNPV-Ar ARN (Ácido Ribonucleico) Proteínas Expresión diferencial Plagas Interactomal Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) Baculoviridae SfNPV-Ar RNA (Ribonucleic Acid) Protein Differential expression Pests

Estudio de la interactómica in vivo del baculovirus SfNPV-Ar en su hospedero Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae)

JONATAN CARMEN RANGEL NUÑEZ (2021)

Spodoptera frugiperda es la plaga de mayor importancia para la producción de maíz en América; con el peligro de extenderse al resto del mundo. Actualmente el control de esta plaga está migrando hacia alternativas a las que no presente resistencia, dentro de las cuales se encuentra un baculovirus denominado SfNPV-Ar. Este microorganismo ha mostrado a nivel de laboratorio y campo su potencial para ser usado en el control del gusano cogollero S. frugiperda. La alta virulencia mostrada por el virus llevó a realizar un estudio transcriptómico y proteómico, para determinar el efecto del virus en las células columnares del intestino medio de S. frugiperda. Como resultado de la secuenciación e identificación de los genes y proteínas regulados por la infección a las 6, 12 y 24 hpi, se obtuvo que el virus induce un sistema de defensa basado en el aumento de la concentración de peróxido. Al mismo tiempo que se apaga la expresión de un modulador de la producción de especies reactivas de oxígeno, se determinó que el virus induce desde las etapas tempranas de la infección, un aumento en los genes relacionados al tráfico de lípidos

en el citoplasma, el cual podría ser causado por el aumento de las necesidades energéticas de las células o bien por la oxidación lipídica que sufre la membrana celular al acumularse el peróxido. De igual manera se determinó una sobre expresión de genes involucrados en el rearreglo del citoesqueleto, así como un arresto del ciclo celular, entre las 6 y 12 hpi, coincidiendo con las etapas previas al inicio del ensamble de las núcleo cápsides. Finalmente, a las 24 hpi, se determinó que la infección viral apagaba los procesos de rearreglo del citoesqueleto, metabolismo y arresto del ciclo celular, mientras que genes y proteínas relacionadas con la activación de la apoptosis fueron sobre expresados. Esto último podría estar relacionado al fenómeno por el cual el intestino infectado por baculovirus es el único de los tejidos que se recupera de la infección. Esta investigación aporta nuevo conocimiento en el desarrollo del proceso de infección de los baculovirus y sus hospederos, y permitirá entender como estas relaciones co-evolutivas virus-huésped, inciden en la efectividad de los baculovirus como agentes de control biológico, para así poder optimizar en el futuro, su uso como tal.

The fall armyworm is the most important pest in the maize production in the Americas continent. The control of the pest is carried out primarily by chemical products, but alternatives of control are gaining importance, alternatives like the use of the entomopathogenic virus SfNPV-Ar, this virus shows high virulence against the fall arming worm in laboratory and field. The aims of this work were to identify the effect of the primary infection by the determination of the regulation of gens and protein in three times post infection (6, 12 and 24 h). As a result of the transcriptomic and proteomic identification we found an induction of cellular defense by the accumulation of peroxide; but at the same time, the virus down regulates the main productor system of reactive oxygen species. In the other hand the infection increases the expression of genes and proteins related with mobility of cytoplasm lipids and metabolism, the cytoskeleton reorganization and cell cycle arrest, all above between the 6 and 12 hours post infection; according with the beginning of the replication of the NC. Finally, 24 hours post infection the infected cells showed a down regulation of genes and proteins related with cytoskeletal, metabolism and cell cycle arrest; at this time, the cells showed an upper regulation of genes and proteins whose function was associated to the activation of the apoptotic prosses. All above showed

how the virus took the control of the cellular machinery to control de cellular proliferation, grew up and activated defense mechanism against reactive oxygen species, in the first hours post infection, in the latest times all mechanism was shut down followed by an apoptosis signal. This could answer why the intestine was the only tissue that did recovery from de viral infection. This research brings new knowledge in the development of the infection process of baculoviruses and their hosts and will allow understanding of how these co-evolutionary virus-host relationships affect the effectiveness of baculoviruses as biological control agents so that they can optimize their use as such in the future.

Doctoral thesis

CIS- Doctorado en Biociencias CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA CIENCIAS AGRARIAS AGROQUÍMICA Interactómica Gusano cogollero – Control biológico Baculovirus SfNPV-Ar ARN (Ácido Ribonucleico) Proteínas Expresión diferencial Plagas Interactomal Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae) Baculoviridae SfNPV-Ar RNA (Ribonucleic Acid) Protein Differential expression Pests

Efecto de la expresión ectópica y del silenciamiento del elF3f en células de adenocarcinoma pulmonar humano (A549)

Ana Edith Higareda Mendoza (2010)

Instituto de Investigaciones Agropecuarias y Forestales. Instituto de Investigaciones sobre los Recursos Naturales. Instituto de Investigaciones Químico Biológicas. Facultad de Biología. Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Facultad de Químico Farmacobiología. Programa Institucional de Doctorado en Ciencias Biológicas

In the present work we investigated the down and up-regulation of the function of the gene coding for the subunit f of the eukaryotic initiation factor 3 (eIF3f) and evaluated its cellular effect. The eIF3f gene plays an important role in the initiation of translation (Benne y Hershey 1978). We originally found that the transcriptional expression of the common bean (Phaseolus vulgaris) eIF3f gene was related to cell division. Laboratory results showed that expression of the eIF3f bean gene in meristematic tobacco cells TBY-2 is circumscribed to the G2/M transition of the cell cycle, and that it is essential for the progression of the cell cycle. Recent results suggest that eIF3f is a negative regulator of translation and has a role in apoptotic signaling (Shi et al. 2006). Therefore, it was interesting to investigate if deregulation of eIF3f expression had an effect on human cell proliferation. We investigated the effect of ectopic expression and silencing of eIF3f gene on cellular growth of a human lung adenocarcinome (cell line A549) with the objective of gathering evidence that indicated its importance in cell division and its possible use in gene therapy against cancer. We found that in quiescent cultures, arrested in G0 by serum limitation, the levels of expression of eIF3f are lowered, compared to proliferating cultures. To determine the expression profile of human eIF3f gene during the cell cycle, A549 cells were synchronized and samples were taken after arrest release (mitotic index, RNA and protein). Expression profiles of both the mRNA and the protein of human eIF3f showed the same cyclic outline.

El presente trabajo consiste en alterar, a través de su silenciamiento y sobre-expresión, la función del gen eIF3f (subunidad f del factor eucarióntico de iniciación 3) y evaluar su efecto celular. El gen eIF3f forma parte del complejo multiproteico eIF3, el cual tiene una función importante en el inicio de la traducción (Benne y Hershey 1978). Originalmente se observó que la expresión transcripcional del gen eIF3f de frijol (Phaseolus vulgaris) estaba relacionada a la división celular (Llanderl-Mendoza 2003). Resultados del laboratorio mostraron que la expresión del gen eIF3f de frijol en células meristemáticas de tabaco TBY-2 está circunscrita a la transición G2/M del ciclo celular, y que es esencial para la progresión del mismo (Llanderal-Mendoza 2003). Resultados recientes sugieren que es un regulador negativo de la traducción y que tiene una función en la señalización apoptótica (Shi et al. 2006). Por lo anterior, se consideró interesante investigar si cambios en los niveles de expresión del gen eIF3f tiene un efecto sobre la proliferación de células humanas. Se investigó el efecto de la expresión ectópica y del silenciamiento del gen eIF3f sobre el crecimiento de células provenientes de un adenocarcinoma pulmonar de humano (línea celular A549), con el fin de reunir evidencia que indiquen su relevancia en la división celular y su posible uso en terapia génica contra el cáncer. Se encontró que, en cultivos quiescentes, bloqueados en G0 por limitación de suero, los niveles de expresión del gen eIF3f están abatidos, en comparación con cultivos en crecimiento.

Doctoral thesis

CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA IIQB-D-2010-0003 Sobre-expresión Gen Complejo multiproteico

Respuesta de plantas de tomate a la aplicación de hidrocarburos simulando un evento de contaminación

ISELA DIAZ LOPEZ (2019)

"La contaminación del agua y suelo agrícola por hidrocarburos es un tema que ha ido ganado importancia, ya que como cualquier agente estresante estos generan daños en las plantas, es por eso que en este trabajo se estudiaron las respuesta de plantas de tomate bajo la contaminación de diferentes hidrocarburos como son la gasolina (80 y 90 mg L-1) el diésel (26 y 28 mg L-1) y una combinación de ambos (20 mg L-1 cada uno), para evaluar parámetros agronómicos, bioquímicos y transcripcionales de las plantas de tomate, así como la calidad de los frutos. Se realizó la aplicación diaria de los tratamientos directo al sustrato de las plantas junto con el último riego del día. Los resultados mostraron un 12.5% de muertes en las plantas con la aplicación de diésel a 28 mg L-1 y de 6.25% con gasolina a 90 mg L-1. La cantidad de los frutos disminuyó con la mayoría de los tratamientos, excepto con la gasolina y diésel a 20 mg L-1, mientras que el peso y calidad de los frutos no se vio afectada con los tratamientos aplicados. Las concentraciones de licopeno aumentaron significativamente con el tratamiento de gasolina y diésel a 20 mg L-1 y con las dos concentraciones de diésel (26 y 28 mg L-1), siendo el diésel a 26 mg L-1 donde se reflejó una mayor concentración de este metabolito. La capacidad antioxidante aumento en mayor cantidad con los tratamientos de gasolina en la etapa de floración mientras que en la de fructificación fue con los tratamientos de diésel. En cuanto al contenido mineral de las hojas en la etapa de floración se observó disminución en el Mn y Mo con los tratamientos de gasolina a 80 y 90 mg L-1. La gasolina a 90 mg L-1 en la etapa de floración, aumentó el contenido de Na y el Se disminuyó en la etapa de fructificación. El diésel a 28 mg L-1 aumentó el Mg y N en la etapa de floración, mientras que en la etapa de fructificación la concentración de N se vio disminuido. El diésel a 26 mg L-1, aumentó el contenido de Ca, Cu y Fe en las hojas de la etapa de floración, mientras que el K disminuyó. La gasolina y diésel a 20 mg L-1 aumentaron el contenido del Cu en los frutos mientras que la gasolina a 90 mg L-1 disminuyo el contenido de Se. El diésel a 26 mg L- 1 sobreexpresó considerablemente los genes CAT, GPX y SOD, seguido de la gasolina a 80 mg L-1 donde también se obtuvo una sobreexpresión de estos genes"

"The contamination of water and agricultural land by hydrocarbons is an issue that has gained importance, since like any stressful agent these generate damage to the plants, that is why in this work we studied the responses of tomato plants under the contamination of different hydrocarbons such as gasoline (80 and 90 mg L-1) diesel (26 and 28 mg L-1) and a combination of both (20 mg L-1 each), to evaluate agronomic, biochemical and transcriptional parameters of Tomato plants, as well as fruit quality. The daily application of the treatments was carried out directly to the substrate of the plants along with the last irrigation of the day. The results showed 12.5% of deaths in plants with the application of diesel at 28 mg L-1 and 6.25% with gasoline at 90 mg L-1. The amount of the fruits decreased with most treatments, except with gasoline and diesel at 20 mg L-1, while the weight and quality of the fruits was not affected with the treatments applied. Lycopene concentrations increased significantly with the treatment of gasoline and diesel to 20 mg L-1 and with the two concentrations of diesel (26 and 28 mg L-1), with diesel being 26 mg L-1 where a higher concentration of this metabolite. The antioxidant capacity increased in greater quantity with the gasoline treatments in the flowering stage while in the fruiting stage it was with the diesel treatments. Regarding the mineral content of the leaves in the flowering stage, a decrease in Mn and Mo was observed with gasoline treatments at 80 and 90 mg L-1. Gasoline at 90 mg L -1 in the flowering stage, increased the Na content and the decreased in the fruiting stage. Diesel at 28 mg L-1 increased Mg and N in the flowering stage, while in the fruiting stage the concentration of N was decreased. Diesel to 26 mg L-1, increased the content of Ca, Cu and Fe in the leaves of the flowering stage, while the K decreased. Gasoline and diesel at 20 mg L-1 increased the content of Cu in fruits while gasoline at 90 mg L-1 decreased the content of Se. Diesel at 26 mg L-1 considerably overexpressed the CAT, GPX and SOD genes, followed by gasoline at 80 mg L-1 where overexpression of these genes was also obtained"

Master thesis

Calidad de frutos Gasolina expresión de genes CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA