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Expresión diferencial de genes de las proteínas fluorescentes y su asociación con indicadores fisiológicos de estrés en Pocillopora verrucosa en dos comunidades coralinas

Differential gene expression of fluorescent proteins and their association with physiological stress indicators in Pocillopora verrucosa from two coral communities

ERICK DELGADILLO NUÑO (2018)

El deterioro de los arrecifes de coral es un problema global de suma importancia. La mayoría de los arrecifes en el mundo presentan perdidas en la cobertura coralina y los eventos de blanqueamiento son cada vez más frecuentes, debido a la constante presión ambiental y al cambio climático. A pesar de esto, la regulación de estos ecosistemas es deficiente. Se necesita una mayor comprensión fisiológica y ecológica de la simbiosis coral-algal para la protección y conservación de los arrecifes de coral. En el presente estudio, se pretende evaluar la respuesta fisiológica y transcriptómica del coral Pocillopora verrucosa de morfologías verde y café. Para esto, se reubicaron dos colonias coralinas bajo diferentes profundidades en su ambiente original y en un arrecife severamente impactado. Posteriormente, se tomaron muestras durante un periodo de 24 horas (T1-cenit; 2:00 pm, T2-ocaso; 8:00 pm, T3 medianoche; 12:00 am; T4-amanecer; 8:00 am) entre los días 17, 18 y 19 de mayo de 2017. De esta manera, se tomaron 34 muestras de para análisis de RNA y 34 para análisis fisiológicos. Los resultados de los análisis fisiológicos indican que los holobiontes de ambas morfologías presentaron el mismo nivel de respuestas antioxidante y de salud durante las 24 horas posteriores a su reubicación. Aunque no hubo resultados significativos, los patrones parecen indicar que hay diferencia en la respuesta fisiológica entre las morfologías verde y café en los corales reubicados en la Boquita. En lo que respecta a la colonia verde, esta presentó un mayor promedio en la concentración de FPs (p=0.04). Además, los niveles de expresión de los genes que codifican esta proteína se expresaron significativamente más en el coral verde, independientemente de la localidad. Exceptuando las FP, cuando ambas morfologías se encuentran en Carrizales, presentan un perfil de expresión similar. Sin embargo, los corales reubicados en La Boquita reportaron un perfil totalmente opuesto entre sí. Ambos corales tuvieron un descenso en la expresión del gen psbA del fotosistema II, pero solo el coral café presentó un incremento significativo en la expresión de los genes con función antioxidante (PXDNL, CAT, GSTT2B2, GPT1, GSS, GPX5 y GST) y de digestión (Capn9). Mientras que el fenotipo verde sólo presentó incrementos Capn9 y CAT. Los datos nos indican que ambos corales reubicados en La Boquita presentaron estrés oxidativo. Sin embargo, la morfología café es la más afectada tras la reubicación en el ambiente m

The deterioration of coral reefs is a global problem of the utmost importance. Most of the reefs in the world present losses in coral reef coverage and bleaching events are becoming more frequent, due to constant environmental pressure and climate change. Despite this, the regulation of these ecosystems is deficient, and a greater physiological and ecological understanding of coral-algal symbiosis is needed for the protection and conservation of coral reefs. In the present study, we intend to evaluate the physiological and transcriptomic response of the Pocillopora verrucosa coral of green and brown morphologies. For this, two coral colonies were relocated under different depths in their original environment and in a severely impacted reef. Subsequently, samples were taken during a period of 24 hours (T1-zenith, 2:00 pm, T2-sunset, 8:00 p.m., T3 midnight, 12:00 a.m., T4-dawn, 8:00 a.m.) between May 17-19, 2017. Thirty-four samples were taken for RNA analysis and 34 for physiological analysis. The results of the physiological analysis indicate that the holobionts of both morphologies presented the same level of antioxidant and health responses during the 24 hours after their relocation. Although there were no significant results, the patterns seem to indicate that there is a difference in the physiological response between the green and brown morphologies in the corals relocated in La Boquita. However, the green colony showed a higher average concentration of FPs (p = 0.04). In addition, the expression levels of the genes encoding this protein were expressed significantly more in the green coral, regardless of location. Except for FP, when both morphologies were found in Carrizales, they presented a similar expression profile. However, the corals relocated to La Boquita reported a completely opposite profile. Both corals had a decrease in psbA gene expression of photosystem II, but only the brown coral showed a significant increase in the expression of genes with antioxidant function (PXDNL, CAT, GSTT2B2, GPT1, GSS, GPX5 and GST) and digestion (Capn9), while the green phenotype only showed increases in Capn9 and CAT. These characteristics indicate that both corals relocated in La Boquita presented oxidative stress. However, the brown morphology is the most affected after relocation in the marginal environment and this coincides with the low level of expression and concentration of FPs.

Master thesis

esteres oxidativo, expresión génica GFP, oxidative stress, gene expression, P.verrucosa BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA ANIMAL (ZOOLOGÍA) GENÉTICA ANIMAL

Expresión génica y receptores hormonales en cáncer mamario: El camino hacia la búsqueda de terapias preventivas

JONNATHAN GUADALUPE SANTILLAN BENITEZ ANGEL ORDOÑEZ QUIROZ Hugo Mendieta Zerón Leobardo Manuel Gómez-Oliván (2013)

Abstract Breast cancer is the leading cause of death from neoplastic disease in women, in Mexico and the world. The study of gene expression is a key part for understanding the origin of the cancer, as well as analysis of origin promoter mutations, which are involved in cancer development, recently published studies demonstrate that mutations in the somatic cells, alterations in maternal hormonal environment, and inherited variants carrying mutations in their genomes somatic mutation and drivers mutations related to the expression of estrogen receptors, progesterone receptor, HER-2 and leptin, are issues related to the elucidation of molecular subtypes of breast cancer, which are analyzed in this review. The management of molecular subtypes in clinical staging or grant will allow a degree of specific cell differentiation most likely help the clinician to be more preventive and decision tools for specific treatments and therefore a greater survival period patient. The analysis of molecular subtypes and hormone receptors, will reveal more about the origin of breast cancer, and identify ways to develop effective preventive therapies.

Article

Expresión génica Receptores hormonales Cáncer mamario Terapias preventivas MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD

Perfil de expresión a nivel transcripcional en cáncer cervicouterino y su relación con la vía de señalización Notch

MA. FABIOLA LEON GALVAN (2008)

"El cáncer cervicouterino (CaCU) es la primer causa de mortalidad en mujeres en México, y la segunda a nivel mundial. Entre las causas principales para el desarrollo de cáncer se encuentran la presencia de mutaciones, deleciones, translocaciones e inserciones virales en los genes. El Virus de Papiloma Humano (VPH) está asociado en el 99% de los casos diagnosticados, aunque no es el único factor determinante. El sistema de señalización Notch está implicado en eventos celulares esenciales como el desarrollo, diferenciación, proliferación y apoptosis, esta vía está involucrada en varias de enfermedades humanas principalmente en cáncer, se ha reportado que la desregulación de los genes Notch, sin embargo el mecanismo exacto de participación de esta vía para la generación de neoplasia no es claro, se desconoce aún la existencia de componentes que puedan interactuar con la vía y que además pueden estar involucrados en la diferenciación tumoral. Se ha demostrado que dependiendo del nivel de expresión y del contexto celular, los receptores de membrana Notch contribuyen claramente en la resistencia a apoptosis en células tumorales. En este trabajo, se evaluó el perfil del transcriptoma de CaCU para la identificación de los genes que se inducen y/o reprimen en presencia de fenotipo neoplásico y la posible participación que tiene en la regulación de la vía Notch. El estudio se realizó en biopsias de pacientes con cáncer cervicouterino en los diferentes estadios de la enfermedad (NIC I, NIC II, NIC III y cáncer Invasor)."

"The cervical cancer (CC) is the first cause of death in women in Mexico and the second worldwide. 99% of the cases diagnosed with CC are affected by the Human Papilloma Virus (HPV), however other factors are involved. In the last years, there are reports about over expression of the Notch signaling pathway elements in a great variety of a human tumors including CC. However, the exact mechanism of the participation of this pathway is not clear. It is unknown yet the existence of elements that could interact with this pathway and that possibly involved in the tumor differentiation. Among the main causes for the development of CC are the presence of mutations, deletions, translocations, and insertions of viral genes. The Notch signaling pathway is involved in essential cellular events such as development, differentiation, proliferation, and apoptosis. In addition, this pathway has been involved in several human diseases, mainly in cancer. It has been demonstrated that depending of the expression level and the cellular context, the Notch receptors contribute clearly in the resistances to apoptosis in tumor cells. In this work, we study the transcriptome profile in CC for identification of genes that are induced and /or repressed in the present of a neoplastic phenotype and the possible participation in the Notch via. In this study we used biopsies from patients with CC in the different stages of the disease (CIN I, CIN II, CIN III, and invasive cancer)."

Doctoral thesis

Cancer cervicouterino Expresión génica Vía Notch BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA MOLECULAR

Expresión placentaria de los transcritos OB-RS Y OB-RL del receptor de leptina y su relación con la antropometría neonatal

Cesar Alberto Morales Aponte (2015)

Durante el embarazo la expresión de leptina y sus receptores en tejido placentario juegan un papel importante en el desarrollo del feto mediando la regulación del crecimiento fetal y postnatal. Establecer la asociación de la expresión transcripcional de los receptores OB-RS Y OB-RL de leptina en tejido placentario con la antropometría neonatal.

Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), número de beca 364505

During pregnancy, the expression of leptin and its receptors in placental tissue play an important role in fetal development mediating the regulation of fetal and postnatal growth role. Establish the association of transcriptional expression of OB-RS and OB-RL leptin receptors in placental tissue with neonatal anthropometry.

Master thesis

Receptores de leptina Expresión génica Placenta Antropometría neonatos MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD CIENCIAS MÉDICAS

The shift from low to high non-structural protein 1 expression in rotavirus-infected MA-104 cells.

Laura Martinez Alvarez Carolina Piña Vazquez Wilbert Zarco Luis Padilla Noriega (2013)

A hallmark of group/species A rotavirus (RVA) replication in MA-104 cells is the logarithmic increase in viral mRNAs that occurs four-12 h post-infection. Viral protein synthesis typically lags closely behind mRNA synthesis but continues after mRNA levels plateau. However, RVA non-structural protein 1 (NSP1) is present at very low levels throughout viral replication despite showing robust protein synthesis. NSP1 has the contrasting properties of being susceptible to proteasomal degradation, but being stabilised against proteasomal degradation by viral proteins and/or viral mRNAs. We aimed to determine the kinetics of the accumulation and intracellular distribution of NSP1 in MA-104 cells infected with rhesus rotavirus (RRV). NSP1 preferentially localises to the perinuclear region of the cytoplasm of infected cells, forming abundant granules that are heterogeneous in size. Late in infection, large NSP1 granules predominate, coincident with a shift from low to high NSP1 expression levels. Our results indicate that rotavirus NSP1 is a late viral protein in MA-104 cells infected with RRV, presumably as a result of altered protein turnover.

Article

Virología Rotavirus Expresión génica Transcriptómica Interferones tipo 1 Proteosoma Complejo de endopeptidasa Ubiquitinización BIOLOGÍA Y QUÍMICA

Efecto de la proteína de amaranto en ratones con obesidad inducida por dieta: explorando el mecanismo de acción en tejido adiposo y glicoproteínas de plasma

Abraham Escobedo Moratilla (2018)

"El amaranto ha sido propuesto como un alimento nutracéutico, pero su función en enfermedades relacionadas con la obesidad no ha sido comprendida del todo; además la mayoría de los estudios in vivo que se encuentran en la literatura evalúan el efecto del aceite de amaranto en enfermedades cardiovasculares. Por otro lado, la proteína del grano de amaranto, de acuerdo a estudios previos, ha demostrado tener in vitro otra clase de efectos terapéuticos relacionados con el metabolismo de carbohidratos. El objetivo de este trabajo fue producir un aislado proteínico de amaranto de bajo costo y analizar su efecto en los perfiles lipídicos y de resistencia a la insulina en ratones con obesidad inducida por dieta, utilizando proteína de soya como referencia, se exploró el mecanismo de acción en tejido adiposo utilizando la medición de expresión génica y un análisis glicoproteómico de plasma sanguíneo. Ratones C57BL/6 fueron alimentados durante 8 semanas con una dieta regular o una dieta hipercalórica, además de consumir aislado de proteína de amaranto o soya por vía oral a una dosis de 10 mg/Kg. Las variables que se evaluaron fueron los cambios en el peso corporal, tejido adiposo, colesterol total, triglicéridos, insulina, una curva de tolerancia a la glucosa, expresión de genes relacionados con el metabolismo de lípidos y el estado inflamatorio, así como del glicoproteoma de plasma de cada grupo. Los resultados demostraron que la proteína de amaranto induce un decremento de la insulina plasmática en los ratones que fueron alimentados con una dieta regular (0.09 ng/ml vs. 0.39 ng/ml), además de que en ratones con dieta hipercalórica induce un descenso de los triglicéridos (144 mg/dl vs. 125.1 mg/dl). En adición, se encontró una expresión menor de los genes Res, Tnf-α, Fasn, Lep y Fabp4 en este grupo, demostrando una inhibición del estado inflamatorio y de la hidrólisis de lípidos. El análisis glicoproteómico confirmó el involucramiento de lipoproteínas como parte del efecto y mostró otras proteínas afectadas por los tratamientos incluyendo glicoproteínas Hb y serpinas. Estos resultados podrían conducir a nuevos mecanismos de acción mediante los cuales el amaranto ejerce su acción biológica. La proteína de amaranto fue capaz de mejorar la hiperlipidemia e hiperinsulinemia producida por la obesidad inducida por dieta."

"Amaranth has been claimed as nutraceutical food, but its function on obesityrelated disorder is still not fully understood; in addition, most in vivo studies in literature evaluate the effect of amaranth oil on cardiovascular disease. On the other hand, amaranth seed protein, according to previous studies, has been demonstrated to have other therapeutic effects related to the carbohydrates metabolism. The aim of this work was to produce a cost-effective amaranth protein isolate and analyze its effect on lipid and insulin resistance profiles in diet-induced obese mice, using soybean protein as the reference, the mechanism of action in adipose tissue was explored using gene expression assessment and blood plasma glycoproteomic analysis. C57BL-6 mice were fed for 8 weeks with regular or high-fat diet along with amaranth or soybean protein isolates at 10 mg/Kg. Changes in body weight, adipose tissue, total cholesterol, triglycerides, insulin, glucose tolerance test, expression of lipid metabolism-related and inflammation-state genes, and the differences on the plasma glycoproteome of each group were measured as variable of response. Results demonstrated that amaranth protein induced a decrease in plasma insulin in mice fed with a regular diet (0.09 ng/ml vs. 0.39 ng/ml), whereas a decrease in triglycerides was observed in mice fed with high-fat diet (144 mg/dl vs. 125.1 mg/dl).; furthermore lower expression of Res, Tnf-α, Fasn, Lep and Fabp4 genes in this group, demonstrated inhibition of inflammation state and lipids hydrolysis. The glycoproteomic analysis confirmed the inclusion of lipoproteins as part of the effect and showed other proteins affected by the treatments involving Hb and serpin proteins. These results could lead to new possible mechanisms of action by which amaranth exert their biological function. Amaranth protein consumption was able to improve the hyperlipidemia and hyperinsulinemia produced by the diet-induced obesity. The present study has demonstrated that amaranth protein, but not soybean protein, improved the obesity condition in mice"

Doctoral thesis

Alimento funcional Modelo preclínico Glicoproteoma Expresión génica MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD

Conserved versatile master regulators in signalling pathways in response to stress in plants

SAUL FRAIRE VELAZQUEZ (2013)

From the first land plants to the complex gymnosperms and angiosperms of today, environmental conditions have forced plants to develop molecular strategies to surpass natural obstacles to growth and proliferation, and these genetic gains have been transmitted to the following generations. In this long natural process, novel and elaborate mechanisms have evolved to enable plants to cope with environmental limitations. Elements in many signalling cascades enable plants to sense different, multiple and simultaneous ambient cues. A group of versatile master regulators of gene expression control plant responses to stressing conditions. For crop breeding purposes, the task is to determine how to activate these key regulators to enable accurate and optimal reactions to common stresses. In this review, we discuss how plants sense biotic and abiotic stresses, how and which master regulators are implied in the responses to these stresses, their evolution in the life kingdoms, and the domains in these proteins that interact with other factors to lead to a proper and efficient plant response.

En las plantas, desde las primeras especies terrestres hasta las complejas gimnospermas y angiospermas de la actualidad, las condiciones ambientales han forzado el desarrollo de estrategias moleculares para superar obstáculos naturales para crecer y proliferar, y estas ganancias genéticas han sido transmitidas a las generaciones subsiguientes. En este largo proceso natural, nuevos y elaborados mecanismos han evolucionado para permitir a las plantas luchar con las limitaciones ambientales. Elementos en muchas cascadas de señalización permiten a las plantas sensar diferentes, múltiples y simultáneas señales ambientales. Un grupo versátil de reguladores maestros que regulan la expresión génica, controla las respuestas de las plantas a las condiciones de estrés. Para propósitos de mejoramiento genético, la tarea es determinar como activar esos reguladores maestros, para habilitar las apropiadas y óptimas reacciones a diferentes formas de estreses comunes en el medio ambiente. En esta revisión, se discute como las plantas sensan el estrés biótico y abiótico, y como y cuales reguladores maestros están implicados en las respuestas a estos estreses, su evolución en los reinos de la vida, así como los dominios en esas proteínas que interactúan con otros factores que conducen a la apropiada y eficiente respuesta de defensa en la planta.

Producción Científica de la Universidad Autónoma de Zacatecas UAZ

Article

BIOLOGÍA Y QUÍMICA abiótico co-activadores regulación de la expresión génica integradores reguladores clave respuesta a estrés en planta

Identification of relevant genes with a multi-agent system using gene expression data

CHRISTIAN LEMAITRE LEON (2011)

In recent years, technology for information extraction from gene activity in cells, has made an import breakthrough with the DNA microarrays. With is technology itis possible for researches to know witch genes are active in a particular cell in particular situation. The comparison of gene expression paterns (which gene are active) of two cell of the same type, one normal and the other belonging to a tumor, can be of great help in understanding what are the genes that migth be involved in the tumor formation.

Book part

MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD Células Tumores Bioinformática Análisis de Expresión Génica

Ketogenic diet does not change NKCC1 and KCC2 expression in rat hippocampus.

GISELA GOMEZ LIRA JULIETA GRISELDA MENDOZA TORREBLANCA LETICIA GRANADOS ROJAS (2011)

En ratas control, se examinaron los efectos de la dieta cetogénica en los niveles de expresión de los cotransportadores en NKCC1 y KCC2 en el hipocampo de la rata. Ni el número de células inmunorreactivas a NKCC1 ni la intensidad de la marca de KCC2 se modifico en el hipocampo de la rata después del tratamiento con una dieta cetogénica. Estos resultados indican que la dieta cetogénica por sí misma no modifica la expresión de estos cotransportadores catión-cloro.

/ In control rats, we examined the effects of ketogenic diet on NKCC1 and KCC2 expression levels in hippocampus. Neither the number of NKCC1 immunoreactive cells nor the intensity of labeling of KCC2 was found to modify in hippocampus of the rats after ketogenic diet treatment. These results indicate that ketogenic diet by itself does not modify the expression of these cation chloride cotransporters.

Article

MEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD Animales recién nacidos Regulación de la expresión génica Hipocampo - Anatomía & histología Dieta cetogénica - Métodos Neuronas - Metabolismo Ratas sprague - Dawley Cotransportadores de cloruro Dieta cetogénica NKCC1 KCC2 Fraccionador óptico Hipocampo Rata Ketogenic diet Optical fractionator Hippocampus