Complex traits and candidate genes: estimation of genetic variance components across multiple genetic architectures

GIOVANNY COVARRUBIAS-PAZARAN Hans-Peter Piepho (2023, [Artículo])

Average Semivariance Linear Mixed Model Variance Component Estimation Polygenic Inheritance Oligogenic Inheritance Mendelian Inheritance CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA MENDELISM GENETIC VARIANCE GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES PHENOTYPES CHROMOSOME MAPPING

Variaciones en un transecto profundo frente a la costa de Nayarit, México

Emilio Palacios Hernández Luis Brito Castillo LAURA ELENA CARRILLO BIBRIEZCA CARLOS EDUARDO CABRERA RAMOS JORGE MANUEL MONTES ARECHIGA (2022, [Artículo])

"Six oceanographic cruises in a NE-SW transect were made nearshore of southern Sinaloa and Nayarit from March 2006 through May 2008, where no in situ hydrographic data are available. Applying the Thermodynamic Equation of Seawater 2010 (TEOS-10) to the observations, the hydrography and geostrophic currents of the region were characterized. Results indicate that surface variability (0-50 m) emerged mainly from seasonal atmospheric forcing. A relative salinity maximum was present during all cruises below this surface layer, which is attributed to a water mass intrusion of Subtropical Subsurface Water that could be associated with the Mexican Coastal Current. Another water mass intrusion is from the California Current. Samples from the 2007-2008 La Niña produced an uncommon circulation, where water flowing from the Gulf of California along the coast of Sinaloa was observed, opposite to what is commonly known as a mean circulation. This uncommon circulation matches the generation of anticyclonic eddies around the Islas Marias archipelago."

Gulf of California, Mexican Coastal Current, Nayarit Coast, seasonal variation, La Niña CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA CIENCIAS DE LA TIERRA Y DEL ESPACIO OCEANOGRAFÍA OCEANOGRAFÍA DESCRIPTIVA OCEANOGRAFÍA DESCRIPTIVA

Modelación de la variación del consumo de agua potable con métodos estocásticos

Velitchko Tzatchkov VICTOR HUGO ALCOCER YAMANAKA (2016, [Artículo])

El presente artículo describe una metodología para obtener la variación diaria estocástica de la demanda instantánea de agua potable, aplicable a una sola casa o cualquier número de casas con base en los parámetros estadísticos del consumo de agua en casas individuales, nivel de fugas dado y la variación del gasto, medida en la tubería de abastecimiento, considerando casos de suministro continuo e intermitente. La metodología propuesta ofrece una base racional para determinar la variación de la demanda a cualquier nivel de agregación. Los resultados se compararon con mediciones de campo en una ciudad mexicana donde el suministro de agua potable es continuo. La variación de los gastos en las tuberías con suministro intermitente o con servicio continuo, pero con cisternas y tinacos en los domicilios, es muy diferente de aquella en tuberías con suministro continuo sin cisternas y tinacos. El coeficiente de demanda máxima horaria es más alto en suministro intermitente que en suministro continuo, pero más bajo en redes que tienen servicio continuo y cisternas o tinacos en los domicilios.

Abastecimiento de agua Demanda de agua Coeficiente de variación INGENIERÍA Y TECNOLOGÍA

Predicción de la evapotranspiración de referencia mediante redes neuronales artificiales

JUAN MANUEL GONZALEZ CAMACHO ROCIO CERVANTES-OSORNIO WALDO OJEDA BUSTAMANTE IRINEO LORENZO LOPEZ CRUZ (2008, [Artículo])

La evapotranspiración de referencia (ETo) es una variable climática esencial para el cálculo de los requerimientos hídricos de los cultivos. Su previsión a corto plazo es importante para programar la distribución de volúmenes de agua en las zonas de riego. En este trabajo se presenta la aplicación de un modelo de Red Neuronal Artificial (RNA) tipo feedforward backpropagation para predecir la ETo a partir de datos diarios de temperatura del aire, radiación solar, humedad relativa y velocidad del viento. La arquitectura adoptada del modelo de RNA contiene cuatro neuronas en la capa intermedia, una neurona en la capa de salida y funciones de activación tangente hiperbólica en ambas capas. Este modelo fue aplicado a un conjunto de datos climáticos con cinco años de observaciones de la red agroclimática “Valle del Fuerte” del distrito de riego 075, localizada en el norte de Sinaloa, México. El algoritmo de entrenamiento supervisado de Levenberg-Marquardt permitió obtener un buen desempeño de la red en términos del error cuadrático medio y del coeficiente de determinación R2 para estimar la ETo en los diferentes escenarios considerados. Las predicciones de las RNA fueron comparadas con las predicciones de modelos de regresión lineal múltiple y lineal por partes; los resultados muestran que ambos modelos presentan niveles de ajuste muy similares a los datos experimentales.

Evapotranspiración Requerimientos de riego Variables climáticas Distritos de riego Regresión no lineal Redes neuronales artificiales CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA

Spatiotemporal analysis of rainfall and temperature variability and trends for climate resilient maize farming system in major agroecology zones of northwest Ethiopia

Kindie Tesfaye Dereje Ademe Enyew Adgo (2023, [Artículo])

Spatiotemporal studies of the annual and seasonal climate variability and trend on an agroecological spatial scale for establishing a climate-resilient maize farming system have not yet been conducted in Ethiopia. The study was carried out in three major agroecological zones in northwest Ethiopia using climate data from 1987 to 2018. The coefficient of variation (CV), precipitation concertation index (PCI), and rainfall anomaly index (RAI) were used to analyze the variability of rainfall. The Mann-Kendall test and Sen’s slope estimator were also applied to estimate trends and slopes of changes in rainfall and temperature. High-significance warming trends in the maximum and minimum temperatures were shown in the highland and lowland agroecology zones, respectively. Rainfall has also demonstrated a maximum declining trend throughout the keremt season in the highland agroecology zone. However, rainfall distribution has become more unpredictable in the Bega and Belg seasons. Climate-resilient maize agronomic activities have been determined by analyzing the onset and cessation dates and the length of the growth period (LGP). The rainy season begins between May 8 and June 3 and finishes between October 26 and November 16. The length of the growth period (LGP) during the rainy season ranges from 94 to 229 days.

Climate Trends Spatiotemporal Analysis Agroecology Zone CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA AGROECOLOGY CLIMATE CLIMATE VARIABILITY MAIZE

New genomic regions identified for resistance to spot blotch and terminal heat stress in an interspecific population of triticum aestivum and T. spelta

Sudhir Navathe Ramesh Chand Mir Asif Iquebal Govindan Velu arun joshi (2022, [Artículo])

Resistance Terminal Heat CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA BIPOLARIS SOROKINIANA HEAT STRESS WHEAT RESISTANCE VARIETIES

Ecología Forense: al rescate de los manglares

Diana Jacqueline Cisneros de la Cruz JORGE ALFREDO HERRERA SILVEIRA CLAUDIA TEUTLI HERNANDEZ (2022, [Artículo])

Cuando hablamos de series en la tv, no cabe duda de que las más populares son las de detectives y forenses que resuelven crímenes. Pero ¿ecología forense en manglares? Si, cuando los manglares mueren o se degradan, antes de cualquier intento de rescate, o mejor dicho, de restauración, es fundamental descubrir cuál fue la causa. La ecología forense durante la restauración ecológica de manglares es parte de una estrategia que, además de la cooperación entre diferentes sectores, será fundamental para recuperar diversos servicios que nos brindan los manglares y con ello ser aliados ante el cambio climático.

CAMBIO CLIMATICO CARBONO AZUL ECOSISTEMAS COSTEROS RESTAURACION ECOLOGICA VARIABLES INDICADORAS BIOLOGÍA Y QUÍMICA CIENCIAS DE LA VIDA BIOLOGÍA VEGETAL (BOTÁNICA) ECOLOGÍA VEGETAL ECOLOGÍA VEGETAL

Predicción fenológica del cultivo de papa mediante tiempo térmico

Phenological prediction of potato crop by means of thermal time

Hector Flores Magdaleno HILARIO FLORES GALLARDO WALDO OJEDA BUSTAMANTE (2014, [Artículo])

El objetivo del presente estudio fue evaluar tres métodos para predecir la fenología en el cultivo de papa (Solanum tuberosum L.) mediante tiempo térmico, para lo cual se trabajó con un total de 15 parcelas a nivel comercial sembradas con la variedad ‘Alpha’ en el norte de Sinaloa, México. Los métodos comparados fueron: temperatura media, grados día (°D) y días fenológicos de papa (P-days), los tres calculados con los datos obtenidos mediante el monitoreo en campo de cada fase fenológica durante los ciclos agrícolas otoño-invierno 2005-2006 y 2006-2007. Los resultados indicaron que el mejor método para predecir la fenología de esta variedad de papa con base en el tiempo térmico fue el P-days, porque presentó los menores valores de coeficiente de variación con 0.07 y de desviación estándar con 18.03 para todas las etapas fenológicas analizadas.

The objective of this research was to evaluate three methods to predict potato crop (Solanum tuberosum L.) phenology by means of thermal time, which were applied on 15 commercial plots sowed with the variety ‘Alpha’ in northern Sinaloa, México. The compared methods were: average temperature, degree days (°D) and potato days (P-days), all of them calculated with data obtained by field monitoring of each phenological stage during two crop seasons, Autumn-Winter seasons 2005-2006 and 2006-2007. Results showed that the best method to predict the phenology of this potato variety by means of thermal time was the P-days technique because it produced the lowest values of variation coefficient with 0.07 and of standard deviation with 18.03, for all the analyzed phenology stages. To compare the errors in thermal requirements obtained with each method in the plots, other plots were used for validation, and so it was confirmed that the P-days method showed the smallest errors, with 3.6 and 3.2 % for the root mean square error RMSE and the mean absolute error MAE, respectively.

Solanum tuberosum Cultivos alimenticios Variabilidad climática INGENIERÍA Y TECNOLOGÍA

Using homosoils for quantitative extrapolation of soil mapping models

Andree Nenkam Alexandre Wadoux Budiman Minasny Alex McBratney Pierre C. Sibiry Traore Gatien Falconnier Anthony Whitbread (2022, [Artículo])

Cubist Digital Soil Mapping Model-Based Validation Soil Spatial Variation Soil-Forming Factors CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA LAND USE ORGANIC CARBON SOIL SURVEYS SPATIAL VARIATIONS

Integrative taxonomy and molecular phylogeny of genus Aplysina (Demospongiae: Verongida) from Mexican Pacific

José Antonio Cruz-Barraza (2012, [Artículo])

Integrative taxonomy provides a major approximation to species delimitation based on integration of different perspectives (e.g. morphology, biochemistry and DNA sequences). The aim of this study was to assess the relationships and boundaries among Eastern Pacific Aplysina species using morphological, biochemical and molecular data. For this, a collection of sponges of the genus Aplysina from the Mexican Pacific was studied on the basis of their morphological, chemical (chitin composition), and molecular markers (mitochondrial COI and nuclear ribosomal rDNA: ITS1-5.8-ITS2). Three morphological species were identified, two of which are new to science. A. clathrata sp. nov. is a yellow to yellow-reddish or -brownish sponge, characterized by external clathrate-like morphology; A. revillagigedi sp. nov. is a lemon yellow to green, cushion-shaped sometimes lobate sponge, characterized by conspicuous oscules, which are slightly elevated and usually linearly distributed on rims; and A. gerardogreeni a known species distributed along the Mexican Pacific coast. Chitin was identified as the main structural component within skeletons of the three species using FTIR, confirming that it is shared among Verongida sponges. Morphological differences were confirmed by DNA sequences from nuclear ITS1-5.8-ITS2. Mitochondrial COI sequences showed extremely low but diagnostic variability for Aplysina revillagigedi sp. nov., thus our results corroborate that COI has limited power for DNA-barcoding of sponges and should be complemented with other markers (e.g. rDNA). Phylogenetic analyses of Aplysina sequences from the Eastern Pacific and Caribbean, resolved two allopatric and reciprocally monophyletic groups for each region. Eastern Pacific species were grouped in general accordance with the taxonomic hypothesis based on morphological characters. An identification key of Eastern Pacific Aplysina species is presented. Our results constitute one of the first approximations to integrative taxonomy, phylogeny and evolutionary biogeography of Eastern Pacific marine sponges; an approach that will significantly contribute to our better understanding of their diversity and evolutionary history. © 2012 Cruz et al.

chitin, genomic DNA, mitochondrial DNA, molecular marker, ribosome DNA, allopatry, Aplysina clatharata, Aplysina gerardogreeni, Aplysina revillagigedi, article, DNA barcoding, DNA sequence, genetic polymorphism, genetic variability, infrared spectros CIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA CIENCIAS DE LA TIERRA Y DEL ESPACIO OCEANOGRAFÍA OCEANOGRAFÍA